| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 88432 = | 213 (1.250) | 6 (0.040) | 5/350 | 9.4 | 3.3% | coding (405/1005 nt) | cra | transcriptional repressor‑activator for carbon metabolism |
| ? | NC_000913 | 88504 = | 143 (0.870) | coding (477/1005 nt) | cra | transcriptional repressor‑activator for carbon metabolism | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
AACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGAT > NC_000913/88268‑88740 | aaCTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGtggt < 1:1906526/239‑1 (MQ=255) tCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCGGGTTGATGCCAATATTGTTGCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGAGCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTg < 2:2189715/239‑1 (MQ=255) tCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTg < 1:786823/239‑1 (MQ=255) tCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTg < 2:1948186/239‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAg > 1:1803764/1‑239 (MQ=255) cgcgGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGgatga < 1:253153/238‑1 (MQ=255) cgcgGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGgatga < 1:286939/238‑1 (MQ=255) aCGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGaaa < 1:2044919/239‑1 (MQ=255) gTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCt < 1:150201/238‑1 (MQ=255) tATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTgg < 1:447654/238‑1 (MQ=255) ctgATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGtt > 1:1165294/1‑239 (MQ=255) ctgATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGtt > 1:715639/1‑239 (MQ=255) agaTCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCGGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCCCCCTCGATCGTGAACGCTTCACCAGGGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCccgc < 2:194351/237‑1 (MQ=255) aTCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCCGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGGGGTAAGTAAGTTTCCGGCCgag > 2:1025405/1‑239 (MQ=255) cacccAGACAACAAAATGCGGTGCATTGATCCCTTTTTACAGCGTCAGGTTGTTGCCTTTTTTGTTTCGACGTCGTGCCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGCCCCGTTCCCTATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCCCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGAc < 2:1965989/236‑1 (MQ=255) cAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGAc > 1:712402/1‑239 (MQ=255) cAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAAGGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGCGAc > 2:865953/1‑239 (MQ=255) ccAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGtggt > 2:1317495/1‑173 (MQ=255) ccAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGtggt < 1:1317495/173‑1 (MQ=255) cAGACAACGAAGTGCGGTGCATTGAGCCCTTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGCCCTGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTAAACACTTCACCAGGGTGGTGGGTGCCGATCGGGAGGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGAc < 2:1569307/235‑1 (MQ=255) aGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGt > 1:1395766/1‑237 (MQ=255) cAACGAAATGCGGTGAATTGACCCCTTTTTACGGCGTCGGGTTGATGCCTTTTTTGTTTCGAGGTCTTTGCCTCCTGAGCATCTTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGCCCCTTTCCCGATTGTCGCGTTGGACCGCGCCCTCGATCGTAAACACTTCACCAGGGTGGTGGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGGGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACg < 2:1486722/232‑1 (MQ=255) gAATTGCGGTGCATTGAGCCCCTTTTACGGCGTAGGTTTGATGCCTTTTTTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGACCATCCTTTTTAT‑CAACGCGGGGCTAACGCCCCTTTCCCGTTTGTCGCGCTGGCCCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGAGGCCGAAATGCGGGGGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCt < 2:1168503/233‑1 (MQ=255) aaaTGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGt > 1:2006999/1‑229 (MQ=255) cgCACTTTTTCCAGCGTCAGGTTTATCCAATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCCCCTGGGCTTCCTTTTTTT‑CAACCTTGGGTTAACGCCCCGTTCCCGTTTGTCGCGCTGGCCCGCCCCCTGGTTCGTGAACATTTCCCCAGCGTGGTGGGGGCCGACCAGGATGTTGCCGAAAGGCTGCAGAAAGAGTCCCGTAAGTTTCCCGCCGAGACg < 2:955930/211‑1 (MQ=255) ccccTTTTACAGCGTCAGGTTTTTGCCTTTTTTGTTCCGCCGTTGTTGCCGCTTG‑GCCTCCCTTTTATCCAACGCGGGGCCAACGCCCCGTTCCCGTTTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTGGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCGGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGc < 2:2072699/236‑1 (MQ=255) cACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGt > 2:1811741/1‑187 (MQ=255) aCCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGt < 1:426691/191‑1 (MQ=255) aCCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTa > 1:77768/1‑217 (MQ=255) cTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCgaga > 1:1337482/1‑205 (MQ=255) tttACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGa > 1:1553540/1‑231 (MQ=255) 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gCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCCTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGaaac > 2:1693466/1‑237 (MQ=255) ccATTATTTTTGCGTCGTGGTTGCCTCCTGGTCATCCTTTTTAC‑CAACGCTGGGCTAACGCCCCTTTCCCGTTTGTCGCGTTGGACCGCGCCCTCGATCGTAAACACTTCCCCGGGGTGTTTGGTGCCGATAAGGATGATGCGGAAATGCTGGCGGAAGATTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACaa < 2:511565/239‑1 (MQ=255) tGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTcc > 1:919418/1‑239 (MQ=255) tCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGtggt > 2:1219723/1‑110 (MQ=255) 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aCCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACa > 1:581060/1‑237 (MQ=255) ccGTTCCCGTTTTCCGCGGTGGACCGCCCCCTGGGTCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGCGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGATTTACGTAATTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTa < 2:712402/239‑1 (MQ=255) ccGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGgatga < 1:1012646/77‑1 (MQ=255) ccGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAag < 2:1419094/97‑1 (MQ=255) ccGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAag > 1:1419094/1‑97 (MQ=255) ccGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCCGCTTCCTTCTTGAACAAGGTTTCCTTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACa > 2:1148228/1‑235 (MQ=255) gTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGgat < 2:91246/73‑1 (MQ=255) cccGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGc < 1:117825/164‑1 (MQ=255) tggtggggcgggACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCCCCAGGGTGGTTGTTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGGGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGa < 1:1856465/228‑1 (MQ=255) gtcggggagcaCCGCGCCCGCGATCGTGAACCGGTCACAAGAGTGGTGGTTCCCGATCGGGATGTGGCCGAATTGCTGGGGGAAGGGTTACGTAATTCTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAggc < 2:542664/229‑1 (MQ=255) tCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAAt > 1:221273/1‑73 (MQ=255) tCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGAc > 1:843640/1‑109 (MQ=255) tCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGAc < 2:843640/109‑1 (MQ=255) tCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAggcg > 1:1109680/1‑239 (MQ=255) gcTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTg < 1:957572/239‑1 (MQ=255) cTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAggcg > 1:289360/1‑234 (MQ=255) tGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACCCTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGATTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGAAGGCGGCTGcc < 1:1918404/239‑1 (MQ=255) cgcCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTAt > 1:1582490/1‑239 (MQ=255) cgcCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTAt > 2:1256253/1‑239 (MQ=255) tCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCt < 1:1313578/103‑1 (MQ=255) cGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACg < 1:1942406/91‑1 (MQ=255) gTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGGGCCAATCGGGATGATGCCGAAATGCTGGGGGAAGGTTTACGTAATTTTCCCGCCGAGACGGTg < 2:1643649/89‑1 (MQ=255) tGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGt > 2:1662488/1‑62 (MQ=255) gaccacTTGCCCAGTGTGGTGGGGGCCGACCGGAATGATGCCGAATGGTTGGCGGAAGAGTTCGGTAAGTTCCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCt < 2:385514/236‑1 (MQ=255) actcccccAGGGTGGTGGGTGCCGTTCAGGAGGATGCCGAAATGCTGGGGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACaa < 2:899450/128‑1 (MQ=255) ttCCCCAGCGTGTGTGTGGCCGATCAGGATGAGCCCAAAATGCGGGCGGAAGAGTTAGGTAGTTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTc < 2:207662/114‑1 (MQ=255) ttCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTc > 2:2175493/1‑114 (MQ=255) ttCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTc < 1:2175493/114‑1 (MQ=255) ttCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAAc > 1:878636/1‑239 (MQ=255) ttCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGGGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAAc > 2:1388878/1‑239 (MQ=255) ttCACCAGCGGGGTTGGTGCCGATCAGGATGAGCCCAAAATGCGGGCGGAAGATGTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAAc < 2:1803764/239‑1 (MQ=255) cACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTg > 1:1643649/1‑89 (MQ=255) 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gCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCg > 1:2059057/1‑239 (MQ=255) cGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAGGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGc < 2:742953/116‑1 (MQ=255) cGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAAc > 2:375075/1‑122 (MQ=255) cGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAAc < 1:375075/122‑1 (MQ=255) cGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGttt > 2:4138/1‑129 (MQ=255) cGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGttt < 1:4138/129‑1 (MQ=255) cGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTa > 1:899450/1‑134 (MQ=255) cGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGtt > 1:1043257/1‑210 (MQ=255) cGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGa > 1:2150808/1‑239 (MQ=255) cGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAAAGGATCCGa > 2:614301/1‑239 (MQ=255) tggtggggGCCGATAAGAATGATGACGAAATGCTGGCGGAGGAGGTACGTAAGTTTCCCGCCCAGACGGAGCTGTATCTTGGGGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTTAAAAAGGTATCCGTACTGCCTGGAAAGATGAGCCGCGCGAGGGGCATTTCCTCAATGCCAAAAGCTAAGAGCGGAAGACGGCGACCCAGTTATTCGCAAAAAGGCTGGAAAAGCATccaag > 2:676450/1‑235 (MQ=255) | AACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTAT‑CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCCGAGACGGTGCTTTATCTTGGTGCGCTACCGGAGCTTTCTGTCAGCTTCCTGCGTGAACAAGGTTTCCGTACTGCCTGGAAAGATGATCCGCGCGAAGTGCATTTCCTGTATGCCAACAGCTATGAGCGGGAGGCGGCTGCCCAGTTATTCGAAAAATGGCTGGAAACGCATCCGAT > NC_000913/88268‑88740 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |