| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,293,036 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (‑114/‑487) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 1293036 = | 0 (0.000) | 222 (1.300) | 102/364 | 0.2 | 100% | intergenic (‑114/‑491) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1293040 | 0 (0.000) | 173 (1.010) | 95/364 | 0.2 | 100% | intergenic (‑118/‑487) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 394 total aligned reads displayed.
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1:1361095‑M1/54‑1 (MQ=255) aTTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatggcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatgg > 1:2153607‑M1/1‑29 (MQ=255) ttCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgat > 1:1758324‑M1/1‑28 (MQ=255) ttCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgat < 2:1758324‑M1/79‑52 (MQ=255) tGTTCTTTATTTTGTGCCGCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggaga > 2:604631‑M1/1‑20 (MQ=255) aggggcaaatccaGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAg > 1:711402‑M1/14‑53 (MQ=255) aggggcaaatccaGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAg < 2:711402‑M1/40‑1 (MQ=255) ggggcaaatccaGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGt < 1:914494‑M1/84‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |