New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 3670407 | 124 (1.250) | coding (816/1650 nt) | treF | cytoplasmic trehalase |
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
GCTGTGGCCGGTGCTAACCCGCGAACCACAGGATCACATTCCGTGGTCTTCTCTGCTGGCGCTGCCGCAGTCATATATTGTCCCGGGCGGCCGTTTTAGCGAAACCTACTATTGGGATTCCTATTTCACCATGCTGGGGCTGGCGGAAAGTGGTCGGGAAGATTTGCTGAAATGCATGGCCGATAACTTCGCCTGGATGATCGAAAACTACGGTCACATCCCC‑AACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATC > NC_000913/3670002‑3670475 | gCTGTGGCCGGTGCTAACCCGCGAACCACAGGATCACATTCCGTGGTCTTCTCTGCTGGCGCTGCCGCAGTCATATATTGTCCCGGGCGGCCGTTTTAGCGAAACCTACTATTGGGATTCCTATTTCACCATGCTGGGGCTGGCGGAAAGTGGTCGGGAAGATTTGCTGAAATGCATGGCCGATAACTTCGCCTGGATGATCGAAAACTACGGTCACATCCCC‑AACGGCAACCGCACCt > 2:773753/1‑239 (MQ=255) 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GCTGTGGCCGGTGCTAACCCGCGAACCACAGGATCACATTCCGTGGTCTTCTCTGCTGGCGCTGCCGCAGTCATATATTGTCCCGGGCGGCCGTTTTAGCGAAACCTACTATTGGGATTCCTATTTCACCATGCTGGGGCTGGCGGAAAGTGGTCGGGAAGATTTGCTGAAATGCATGGCCGATAACTTCGCCTGGATGATCGAAAACTACGGTCACATCCCC‑AACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATC > NC_000913/3670002‑3670475 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |