| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3670238 | 122 (1.200) | 10 (0.100) | 8/384 | NT | 7.6% | coding (647/1650 nt) | treF | cytoplasmic trehalase |
| ? | NC_000913 | = 3670407 | 124 (1.250) | coding (816/1650 nt) | treF | cytoplasmic trehalase | |||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
ATGCATGGCCGATAACTTCGCCTGGATGATCGAAAACTACGGTCACATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGGTCGTCTGGCGAGCATTCGTACCACCCAGTTCATCCCCATCGA > NC_000913/3670173‑3670640 | aTGCATGGCCGATAACTTCGCCTGGATGATCGAAAACTACGGTCACATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCGGAATCGTTAATCCCTAATCAGTCCTATCGCCATGTTgtgc < 1:252648‑M2/239‑5 (MQ=255)aTGCATGGCCGATAACTTCGCCTGGATGATCGAAAACTACGGTCACATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTgtgc < 1:677132‑M2/239‑5 (MQ=255) gATAACTTCGCCTGGATGATCGAAAACTACGGTCACATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCcgga < 1:508270/239‑1 (MQ=255) aTAACTTCGCCTGGATGATCGAAAACTACGGTCACATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCcggac > 2:389406/1‑239 (MQ=255) catGGATGATCGAAATCTACGGTCACATCCCAAACGTCAACCGCACCTATTAGTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCgctg < 2:751704/237‑1 (MQ=255) tgatCGAAAACTACGGTCACATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCaa < 2:1139532/238‑1 (MQ=255) tgatCGAAAACTACGGTCACATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCaa < 2:140179/238‑1 (MQ=255) tgatCGAAAACTACGGTCACATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAAc < 1:354936/239‑1 (MQ=255) tgatCGAAAACTACGGTCACATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAAc < 1:286060/239‑1 (MQ=255) gatCGAAAACTACGGTCAAATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAACGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAAc < 1:438915/238‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAg > 1:514651/1‑239 (MQ=255) aGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTgtgcggttgccgttggggatgtgaccgtagttttcgatcatccaggcgaagttatcggccatgcatttcagcaaatctt < 2:356031‑M2/238‑80 (MQ=255) aGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTgtgcggttgccgttggggatgtgaccgtagttttcgatcatccaggcgaagttatcggccatgcatttcagcaaatctt < 2:868346‑M2/238‑80 (MQ=255) aGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTgtgcggttgccgttggggatgtgaccgtagttttcgatcatccaggcgaagttatcggccatgcatttcagcaaatctt < 2:893493‑M2/238‑80 (MQ=255) aGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACt < 2:1062121/196‑1 (MQ=255) aGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACt > 1:1062121/1‑196 (MQ=255) aGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTggg > 1:1182743/1‑199 (MQ=255) 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2:393993/1‑238 (MQ=255) attgccctgtgggatggcCGGTGCAGAATCGATAATCCCTAACCAGGCCTTTCGCCGTGTGGGGCGGAGGCCGGACGGTTCGCTGCCCACCCGTTACTGGGCCGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTgg < 2:958339/227‑1 (MQ=255) tGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGCCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCTTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGc > 1:762207/1‑239 (MQ=255) gCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTa > 2:602277/1‑221 (MQ=255) 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cTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGCTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGAt > 1:1172600/1‑238 (MQ=255) tggaCGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTgg > 1:930388/1‑238 (MQ=255) ggaCGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGgtc > 1:996749/1‑239 (MQ=255) 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2:554765/186‑1 (MQ=255) ttAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGt > 1:554765/1‑186 (MQ=255) ttAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGGTCGTCTGGCGAGCATTc > 1:411405/1‑238 (MQ=255) tAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGGTCGTCTGGCGAGCATTCg < 1:318764/238‑1 (MQ=255) aaTCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGGTCGTCTGGCGAGCATTCGTa < 2:950732/239‑1 (MQ=255) cccTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTgg < 1:1077901/202‑1 (MQ=255) cccTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTgg > 2:1077901/1‑202 (MQ=255) cccTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGGTACTGGTCGTCTGGCGAGCATTCGTacc > 2:320635/1‑238 (MQ=255) cccTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGGTCGTCTGGCGAGCATTCGTacca < 2:930388/239‑1 (MQ=255) cccTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGGTTGGATTACTCTTCCCGGTGGCTGCGTGCTACTGGTCGTCTGGCGGGCATTTGTaac > 2:1012972/1‑236 (MQ=255) aaTCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGGTCGTCTGGCg > 2:1021253/1‑222 (MQ=255) aaTCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGGTCGTCTGGCGAGCATTCGTACCACCCa > 1:1055126/1‑239 (MQ=255) aTCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGGTCGTCTGGCGAGCATTCGTaccac > 1:669929/1‑235 (MQ=255) gCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTgg < 1:528918/192‑1 (MQ=255) gCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTgg > 2:528918/1‑192 (MQ=255) 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cGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTc < 2:6957/36‑1 (MQ=255) cGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGGTCGTCTGGCGAGCATTCGTACCACCCAGTTCATcc < 1:736666/235‑1 (MQ=255) gCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGGTCGTCTGGCGAGCATTCGTACCACCCAGTTCATCCCCATc < 1:421649/239‑1 (MQ=255) aTGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCTTGATACTGGTCGTCTGGCGAGCATTCGTACCACCCAGTTCATTGCCATCGa > 2:757004/1‑238 (MQ=255) 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| ATGCATGGCCGATAACTTCGCCTGGATGATCGAAAACTACGGTCACATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGGTCGTCTGGCGAGCATTCGTACCACCCAGTTCATCCCCATCGA > NC_000913/3670173‑3670640 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |