New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1697979 | 65 (0.720) | 4 (0.050) | 3/346 | 6.2 | 6.1% | coding (62/768 nt) | hdhA | 7‑alpha‑hydroxysteroid dehydrogenase, NAD‑dependent |
? | NC_000913 | = 1698127 | 60 (0.690) | intergenic (‑87/+25) | hdhA/malI | 7‑alpha‑hydroxysteroid dehydrogenase, NAD‑dependent/transcriptional repressor of Mal regulon | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CACCGCCACCGGCGTTGTTAACCAGAATATCAACTTTACCCAGCTTACTGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGACACTACCAGGTATAGCAGATAAAGAGAGGATTATTTCGCTGCAATGAGCCGGGCGGGAATAATAAGATTGCGTGAATGCGTCTCTTCAT > NC_000913/1697743‑1698210 | caccgccaccgGCGTTGTTAACCAGAATATCAACTTTACCCAGCTTACTGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTTACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGc > 1:328589/1‑238 (MQ=255) ccgccaccgGCGTTGTTAACCAGAATATCAACTTTACCCAGCTTACTGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGAAGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCATAACCTGcta > 2:116823/1‑236 (MQ=255) gccaccgGCGTTGTTAACCAGAATATCAACTTTACCCAGCTTACTGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCg < 2:935429/239‑1 (MQ=255) gttgttAACCAGAATATCAACTTTACCCAGCTTACTGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGtga > 1:1025456/1‑239 (MQ=255) aaTATCAACTTTACCCAGCTTACTGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCAtt > 1:623459/1‑239 (MQ=255) aaTATCAACTTTACCCAGCTTACTGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCCGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCCCCTGTGAT‑GATGGCGCAtt > 1:510418/1‑239 (MQ=255) tatCAACTTTACCCAGCTTACTGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCAttt > 1:219174/1‑238 (MQ=255) aCTTTACCCAGCTTACTGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTc < 2:623459/239‑1 (MQ=255) aCCCAGCTTACTGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAg > 1:509347/1‑237 (MQ=255) cTTACTGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCg > 2:677140/1‑200 (MQ=255) cTTACTGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCg < 1:677140/200‑1 (MQ=255) aCTGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGt < 2:553031/239‑1 (MQ=255) tGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCa < 1:13506/239‑1 (MQ=255) tGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCa < 1:487614/239‑1 (MQ=255) gCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAAtt > 2:1036885/1‑239 (MQ=255) gCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTAAAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCCCAGATACGCCAGCTGGCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCAACCGCACCTGTGGTGGATGG‑GCATTTTCCGTCGAGTCCCCGGCTGTCAGGAtt > 2:320236/1‑239 (MQ=255) aaaGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTaa < 1:1036885/239‑1 (MQ=255) aaaGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTa < 2:509347/238‑1 (MQ=255) gCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATa > 1:444095/1‑239 (MQ=255) gagagTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAAcct > 2:923607/1‑235 (MQ=255) agTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGa > 1:384970/1‑239 (MQ=255) cTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTc > 2:205080/1‑239 (MQ=255) tCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGt < 1:663031/238‑1 (MQ=255) cGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCtgtg < 1:976572/228‑1 (MQ=255) cGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCtgtg > 2:976572/1‑228 (MQ=255) aaCGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTaa > 1:949818/1‑195 (MQ=255) aaCGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTaa < 2:949818/195‑1 (MQ=255) aCGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCg > 1:134091/1‑238 (MQ=255) gggaggcaAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCCCCGCCt < 1:330536/236‑1 (MQ=255) gACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTc < 2:153251/154‑1 (MQ=255) gACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTc > 1:153251/1‑154 (MQ=255) accaccCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACAtttttt > 2:285975/1‑239 (MQ=255) cccAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTGAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTAtaa > 1:551978/1‑237 (MQ=255) cccAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCGGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTTTTTACCAATCCCTGCCCCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCa < 2:515309/239‑1 (MQ=255) ccATTTGTTGATTTTCGTCTAAAATATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATTTCACTGCCCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTTTTTCCCAATCCCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGTTTGTCAGAATTAAACACATAACCCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCAt < 2:63137/239‑1 (MQ=255) tCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTGGGCGTAAATATCACTGACCCCCACAGATGCGCCGGCTGTCGCGAATGTAATGGCAATTTCTTTCCCATTCCCTGCCCCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCGGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGaaa < 2:1025456/239‑1 (MQ=255) tCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCa < 1:293908/108‑1 (MQ=255) tCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCa > 2:293908/1‑108 (MQ=255) tCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCAcc > 1:661041/1‑101 (MQ=255) tCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCAcc < 2:661041/101‑1 (MQ=255) tCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAaca > 1:56020/1‑157 (MQ=255) tCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAaca < 2:56020/157‑1 (MQ=255) tCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAgg > 1:199602/1‑238 (MQ=255) cTACACCATGGTTAGTTGCGTCGGCGTTAATATCCCTGCCCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGa < 2:444095/238‑1 (MQ=255) cTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGa < 1:205080/238‑1 (MQ=255) tACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCTTTAATATCACTGACCACCCCAGACGCCCCAGCTGTCGCAAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGAAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGaca < 2:834494/239‑1 (MQ=255) aactTGGTTGGCTGGGTCGGCTTTAATATCTCTGCCCCCCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATCCCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTAAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAAAAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGACACTa < 2:140173/239‑1 (MQ=255) aGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGt < 1:536353/116‑1 (MQ=255) aGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGt > 2:536353/1‑116 (MQ=255) tGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAAc > 2:786685/1‑147 (MQ=255) tGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAAc < 1:786685/147‑1 (MQ=255) gccGTCGGCTTTAATACCACTGCCCACCACAGATGCGCAAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATCCCTGCCCCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGTTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCATTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGACACTACCAGGTATAg < 2:58039/235‑1 (MQ=255) gCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCGGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGACACTACCAGGTATAGCAg > 1:333045/1‑239 (MQ=255) ccaccaCAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTGATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACAt > 2:791413/1‑120 (MQ=255) ccaccaCAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTGATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACAt < 1:791413/120‑1 (MQ=255) gcCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGACACTACCAGGTATAGCAGATAAAGAGAGGATTATTTCGCTGCAATGAGCcggg < 1:923607/239‑1 (MQ=255) ccAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATCCCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGACACTACCAGGTATAGCAGATAAAGAGAGGatta < 2:1128898/218‑1 (MQ=255) ccAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGACACTACCAGGTATAGCAGATAAAGAGAGGatta > 1:1128898/1‑218 (MQ=255) tGTCGGGAAGTTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCGGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGACACTACCAGGTATAGCAGATAAAGAGAGGATTATTTCGCTGCAATGAGCcgggcggg < 2:478458/237‑1 (MQ=255) aTGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCGGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGACACTACCAGGTATAGCAGATAAAGAGAGGATTATTTCGCTGCAATGAGCCGGGCGGGAATAATAAGa < 2:333045/239‑1 (MQ=255) ttCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGACACTACCAGGTATAGCAGATAAAGAGAGGATTATTTCg < 2:419030/197‑1 (MQ=255) ttCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGACACTACCAGGTATAGCAGATAAAGAGAGGATTATTTCg > 1:419030/1‑197 (MQ=255) tttttCCCAATACCTCCCCCCGCCCCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGATCTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGACACTAcc < 2:244824/163‑1 (MQ=255) aaTACCTGCACCCGCACCTGTAAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGACACTACCAGGTATAGCAGATAAAGAGAGGATTATTTCGCTGCAATGAGCCGGGCGGGAATAATAAGATTGCGTGAATGCGTCTCTTCAt < 1:747774/239‑1 (MQ=255) tACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGACACTACCAGGTATAGCa > 1:244824/1‑165 (MQ=255) | CACCGCCACCGGCGTTGTTAACCAGAATATCAACTTTACCCAGCTTACTGATAGCAAAGTCTGCCAGTGCAGAGAGTTCCTGTTCGGAAGTAATATCACAACGGCAGGCAAATGCCTGACCACCCAGTTGTTGAATTTCGTCTACAACATGGTTAGCTGCGTCGGCGTTAATATCACTGACCACCACAGATGCGCCAGCTGTCGCGAATGTAATGGCGATTTCTTTACCAATACCTGCACCCGCACCTGTGAT‑GATGGCGCATTTTCCGTCGAGTCTCAGGTTGTCAGAATTAAACACATAAACCTCCTGTGAACTTCAGTAAAAATAAAAGGCACCGCCTGTGTGCCACATTTTTTATCATTAACCTTGAGGAAAGGACACTACCAGGTATAGCAGATAAAGAGAGGATTATTTCGCTGCAATGAGCCGGGCGGGAATAATAAGATTGCGTGAATGCGTCTCTTCAT > NC_000913/1697743‑1698210 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |