New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3777891 = | 91 (1.010) | 6 (0.070) | 6/402 | 6.7 | 5.7% | coding (493/1656 nt) | lldP | L‑lactate permease |
? | NC_000913 | 3778056 = | 113 (1.320) | coding (658/1656 nt) | lldP | L‑lactate permease | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
CGCCGCATTGCTGGTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGT > NC_000913/3777824‑3778289 | cgccgcATTGCTGGTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAag > 1:544078/1‑239 (MQ=255) tAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTgcgg > 1:791166/1‑239 (MQ=255) gccgGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCTTTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCAt < 2:566423/239‑1 (MQ=255) cgGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGCAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCg < 2:710021/239‑1 (MQ=255) cTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTACCAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTc < 2:428914/238‑1 (MQ=255) cTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTc < 1:6400/238‑1 (MQ=255) tgCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGt > 1:415563/1‑238 (MQ=255) tgCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTGGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCCCAGt > 2:686830/1‑238 (MQ=255) tAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGctct < 2:544078/238‑1 (MQ=255) cgcgCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCa < 2:693013/239‑1 (MQ=255) 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tttATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCt > 1:440318/1‑167 (MQ=255) tttATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCt < 2:440318/167‑1 (MQ=255) aTGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGGGATTTggg > 2:106686/1‑239 (MQ=255) cATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTgg > 1:201924/1‑161 (MQ=255) 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tGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGt > 2:304326/1‑223 (MQ=255) tGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGt < 1:304326/223‑1 (MQ=255) tGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGAc > 1:689214/1‑232 (MQ=255) tGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGAc > 1:546896/1‑232 (MQ=255) tGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGAc > 1:935276/1‑232 (MQ=255) tGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTCCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGAc > 1:965391/1‑232 (MQ=255) tGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGACTCGTTTACCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATTAc > 1:989914/1‑232 (MQ=255) ggCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACg < 2:965391/232‑1 (MQ=255) ggttATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGTTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCcac < 2:317997/236‑1 (MQ=255) gATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCcac < 2:689214/238‑1 (MQ=255) 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CGCCGCATTGCTGGTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGT > NC_000913/3777824‑3778289 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |