New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1218916 = | 28 (0.670) | 6 (0.160) | 5/254 | 3.6 | 22.6% | intergenic (+65/‑67) | ycgG/ymgF | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase/inner membrane division septum protein |
? | NC_000913 | 1218997 = | 16 (0.430) | coding (15/219 nt) | ymgF | inner membrane division septum protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
TCGCTGAAGGTGTCGAAACGAAAGAACAACTTGACTATCTGAACCAAAATTATATCACATTTCAGCAGGGTTATTATTTCTATAAACCTGTTACATACATCGACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCACCCTCCTGGTCATCCTTATTGCAAAACC > NC_000913/1218697‑1219080 | tcgCTGAAGGTGTCGAAACGAAAGAACAACTTGACTATCTGAACCAAAATTATATCACATTTCAGCAGGGTTATTATTTCTATAAACCTGTTACATACATCGACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTAtttt > 3:379136/1‑239 (MQ=255) gAAGGTGTCGAAACGAAAGAACAACTTGACTATCTGAACCAAAATTATATCACATTTCAGCAGGGTTATTATTTCTATAAACCTGTTACATACATCGACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTAtt > 1:102363/1‑222 (MQ=255) gAAGGTGTCGAAACGAAAGAACAACTTGACTATCTGAACCAAAATTATATCACATTTCAGCAGGGTTATTATTTCTATAAACCTGTTACATACATCGACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTAtt < 2:102363/222‑1 (MQ=255) tCTGAACCAAAATTATATCACATTTCAGCAGGGTTATTATTTCTATAAACCTGTTACATACATCGACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGc < 4:379136/239‑1 (MQ=255) atCACATTTCAGCAGGGTTATTATTTCTATAAACCTGTTACATACATCGACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAAc < 1:188962/239‑1 (MQ=255) tCTATAAACCTGTTACATACATCGACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGc < 4:412693/208‑1 (MQ=255) tCTATAAACCTGTTACATACATCGACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGc > 3:412693/1‑208 (MQ=255) tCTATAAACCTGTTACATACATCGACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATg > 4:398648/1‑211 (MQ=255) tCTATAAACCTGTTACATACATCGACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATg < 3:398648/211‑1 (MQ=255) gTTACATACATCGACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATg < 4:474330/200‑1 (MQ=255) gTTACATACATCGACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATg > 3:474330/1‑200 (MQ=255) cGACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATg < 3:127953/189‑1 (MQ=255) cGACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATg > 4:127953/1‑189 (MQ=255) aCCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCtata > 3:217865/1‑224 (MQ=255) aCCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCtata < 4:217865/224‑1 (MQ=255) aaggtgaaggtTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCa > 2:38851/1‑101 (MQ=255) aaggtgaaggtTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCa < 1:38851/101‑1 (MQ=255) ggTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCACCCTCCTGGTCATCCTTATTGCAAAAcc < 3:472057/239‑1 (MQ=255) tgtAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTAtt > 4:293256/1‑45 (MQ=255) tgtAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTAtt < 3:293256/45‑1 (MQ=255) tgtAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCActct < 2:189160/139‑1 (MQ=255) tgtAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCActct > 1:189160/1‑139 (MQ=255) gACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCtata > 4:468793/1‑134 (MQ=255) gACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCtata < 3:468793/134‑1 (MQ=255) cTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGta < 3:481243/102‑1 (MQ=255) cTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGta > 4:481243/1‑102 (MQ=255) cTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCa < 4:42917/159‑1 (MQ=255) cTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCa > 3:42917/1‑159 (MQ=255) | TCGCTGAAGGTGTCGAAACGAAAGAACAACTTGACTATCTGAACCAAAATTATATCACATTTCAGCAGGGTTATTATTTCTATAAACCTGTTACATACATCGACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCACCCTCCTGGTCATCCTTATTGCAAAACC > NC_000913/1218697‑1219080 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |