New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1218916 = | 28 (0.670) | 6 (0.160) | 5/254 | 3.6 | 22.6% | intergenic (+65/‑67) | ycgG/ymgF | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase/inner membrane division septum protein |
? | NC_000913 | 1218997 = | 16 (0.430) | coding (15/219 nt) | ymgF | inner membrane division septum protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
ACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCACCCTCCTGGTCATCCTTATTGCAAAACCCAGTACCGGGCTGGGAGAAGTGCTTGTGACGATAAATTTGCTTAATGCCCTTGTTTGGCTGGCGATCAATCTGGTTAATCGATTAAGAGAAAGACTCGTCAACCACAGGGATCAGCAATAATCTTTCAGTTTCTCACTGT > NC_000913/1218799‑1219220 | aCCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCtata > 3:217865/1‑224 (MQ=255) aCCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCtata < 4:217865/224‑1 (MQ=255) ggTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCACCCTCCTGGTCATCCTTATTGCAAAAcc < 3:472057/239‑1 (MQ=255) tgtAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCActct > 1:189160/1‑139 (MQ=255) tgtAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCActct < 2:189160/139‑1 (MQ=255) gACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCtata < 3:468793/134‑1 (MQ=255) gACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCtata > 4:468793/1‑134 (MQ=255) cTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCa > 3:42917/1‑159 (MQ=255) cTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCa < 4:42917/159‑1 (MQ=255) tgtttgCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCACCCTCCTGGTCATCCTTATTGCAAAACCCAGTACCGGGCTGGGAGAAGTGCTTGTGACGATAAATTTGCTTAATGCCCTTGTTTGGCTGGCGATCAATCTGGTTAATCGATTAAGAGAAAg > 1:179121/1‑239 (MQ=255) tGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCACCCTCCTGGTCATCCt < 3:3639/117‑1 (MQ=255) tGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCACCCTCCTGGTCATCCt > 4:3639/1‑117 (MQ=255) agtagCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCACCCTCCTGGt < 1:26179/86‑1 (MQ=255) agtagCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCACCCTCCTGGt > 2:26179/1‑86 (MQ=255) cATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCACCCTCCTGGTCATCCTTATTGCAAAACCCAGTACCGGGCTGGGAGAAGTGCTTGTGACGATAAATTTGCTTAATGCCCTTGTTTGGCTGGCGATCAATCTGGTTAATCGATTAAGAGAAAGACTCGTCAACCACAGGGATCAGCAATAATCTTTCAGTTtctc > 4:59382/1‑234 (MQ=255) cATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCACCCTCCTGGTCATCCTTATTGCAAAACCCAGTACCGGGCTGGGAGAAGTGCTTGTGACGATAAATTTGCTTAATGCCCTTGTTTGGCTGGCGATCAATCTGGTTAATCGATTAAGAGAAAGACTCGTCAACCACAGGGATCAGCAATAATCTTTCAGTTtctc > 3:447114/1‑234 (MQ=255) aTGAACAATAGTAATAATCTTGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCACCCTCCTGGTCATCCTTATTGCAAAACCCAGTACCGGGCTGGGAGAAGTGCTTGTGACGATAAATTTGCTTAATGCCCTTGTTTGGCTGGCGATCAATCTGGTTAATCGATTAAGAGAAAGACTCGTCAACCACAGGGATCAGCAATAATCTTTCAGTTTCTCACTGt < 4:447114/238‑1 (MQ=255) | ACCTGGTCAAAATTATCCTTTCTAAACCGAAGGTGAAGGTTGTGGTTGAGTGAAAATTGATCAGTAAGGCCATAGTGCGGTGTAATTATAGACAGCTAATTAGCTCGTTGCCTCTTGTTACTATTGTTCATTATTTTGTTTGCTATAATTGTTTGAAAGTTTTGACAGGATTGCCATTAGTAGCATGAACAATAGTAATAATCTGGATTATTTCACTCTCTATATCATATTTTCCATTGCATTTATGCTGATCACCCTCCTGGTCATCCTTATTGCAAAACCCAGTACCGGGCTGGGAGAAGTGCTTGTGACGATAAATTTGCTTAATGCCCTTGTTTGGCTGGCGATCAATCTGGTTAATCGATTAAGAGAAAGACTCGTCAACCACAGGGATCAGCAATAATCTTTCAGTTTCTCACTGT > NC_000913/1218799‑1219220 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |