New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2478355 | 34 (0.820) | 5 (0.130) | 5/260 | 3.7 | 12.9% | coding (509/1338 nt) | dsdX | D‑serine transporter |
? | NC_000913 | = 2478636 | 36 (0.940) | coding (790/1338 nt) | dsdX | D‑serine transporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCC > NC_000913/2478164‑2478590 | gatGGTAGGGCTGATTTGTGGCATCAAGCTGGTTGTTGAAGTGGGCGGCGTGCTATTTATTCATCTGGGTTGTTGAAGTGCAATAAAAACGAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCTGCTGCTTTATATGGTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGCTTTCTGGTTg > 4:224466/3‑239 (MQ=255) cTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTg < 4:230554/216‑1 (MQ=255) cTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTg > 3:230554/1‑216 (MQ=255) tttgttGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGatat > 1:184852/1‑176 (MQ=255) tttgttGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGatat < 2:184852/176‑1 (MQ=255) aTTCCTCTGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACg > 3:431865/1‑236 (MQ=255) tGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACg > 1:52242/1‑229 (MQ=255) gCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGgcg > 4:488386/1‑133 (MQ=255) gCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGgcg < 3:488386/133‑1 (MQ=255) cATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCaaa > 4:304497/1‑239 (MQ=255) attattAAAGCTTGCCATTCCGGTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTg < 3:183373/199‑1 (MQ=255) taAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTcgc < 3:304497/239‑1 (MQ=255) tGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATgg > 2:49629/1‑137 (MQ=255) tGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATgg < 1:49629/137‑1 (MQ=255) cGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGA‑CGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTa > 4:42236/1‑175 (MQ=255) cGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGA‑CGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTa < 3:42236/175‑1 (MQ=255) cATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGgc > 3:211559/1‑239 (MQ=255) aTGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAAc > 1:195229/1‑239 (MQ=255) ggCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCtt > 4:421834/1‑139 (MQ=255) ggCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCtt < 3:421834/139‑1 (MQ=255) cTGCGTTGTTCCTCCATCTCCGGCTGCTTTAAATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCa < 2:52242/239‑1 (MQ=255) cTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGTTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTTATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCCCCa < 3:224466/239‑1 (MQ=255) gCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATa < 4:431865/239‑1 (MQ=255) ctccACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTAccc > 4:28488/1‑239 (MQ=255) ccACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCAt > 1:125373/1‑239 (MQ=255) ctTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGGGCAGATATAGGTTCGGTGATCGTCTAAGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAAcc < 4:94816/136‑1 (MQ=255) ttccAATAATCTTTGCGCAGATATCTTTTCTTTTATCTTCTACTTTTTTCTTTTTTTTCTTATTTCATCACTTATCTTTTTCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCcaca > 3:94816/3‑136 (MQ=255) tGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGTCGCAACGTTATTTACCATACTCCAACCCATTTGGCGGAGGTTGGTTTAAACGa > 4:411053/1‑239 (MQ=255) tGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGa > 3:155016/1‑239 (MQ=255) tGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGa > 2:21566/1‑239 (MQ=255) gCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTg > 4:390247/1‑127 (MQ=255) gCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTg < 3:390247/127‑1 (MQ=255) gCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGAt > 2:62302/1‑239 (MQ=255) aTAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGcc < 1:21566/239‑1 (MQ=255) | GCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCC > NC_000913/2478164‑2478590 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |