Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,293,015 | IS1 (–) +8 bp | intergenic (‑93/‑505) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 291401 | NA (NA) | 163 (1.010) | 88/196 | 0.5 | 97.4% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | 1293015 = | 4 (0.030) | intergenic (‑93/‑512) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1050545 | NA (NA) | 159 (0.990) | 91/196 | 0.4 | 97.3% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1293022 | 4 (0.030) | intergenic (‑100/‑505) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
GTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCAC > NC_000913/1292924‑1293117 | tgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTg > 1:1554964‑M2/92‑99 (MQ=255) agtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGgg > 1:1208490‑M2/1‑97 (MQ=255) aacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGtt < 1:3552169‑M2/10‑1 (MQ=255) caggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCt > 1:626605‑M2/88‑99 (MQ=255) aaTCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaa < 1:3114195‑M2/99‑6 (MQ=255) aTCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaat > 2:1455213‑M2/1‑93 (MQ=255) aTCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaat > 2:3367564‑M2/1‑93 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTa > 2:2784827‑M2/85‑99 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTa > 2:1769968‑M2/85‑99 (MQ=255) ctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatga < 1:4071420‑M2/99‑9 (MQ=255) ctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAt < 2:2701449/99‑1 (MQ=255) ctcAAACTAAAATCGGGGAGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGgctaatga > 2:219210‑M2/1‑91 (MQ=255) ggacagctgatagacacagaagccactgtagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTAttt > 2:2966150‑M2/82‑99 (MQ=255) ggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTAttt < 1:1684145‑M2/18‑1 (MQ=255) gacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTAtttt > 1:4028427‑M2/81‑99 (MQ=255) cTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaa > 2:1327059‑M2/1‑85 (MQ=255) agctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTtgtg > 2:3939341‑M2/78‑99 (MQ=255) ttATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaac > 2:1596278‑M2/1‑84 (MQ=255) ttATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaac > 2:1969789‑M2/1‑84 (MQ=255) atatTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGCATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgccg > 1:2470611/1‑99 (MQ=255) atagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgccgcc > 1:1283840‑M2/73‑99 (MQ=255) atagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgccgcc > 2:295101‑M2/73‑99 (MQ=255) atTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttat > 1:1802543‑M2/1‑80 (MQ=255) tagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCa < 2:1529607‑M2/28‑1 (MQ=255) tagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCa > 2:2130653‑M2/72‑99 (MQ=255) tagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCa > 2:2922374‑M2/72‑99 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaa > 2:1208748‑M2/71‑99 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaa > 1:3297366‑M2/71‑99 (MQ=255) gaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaat < 2:226860‑M2/30‑1 (MQ=255) aaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaata > 2:3438616‑M2/69‑99 (MQ=255) tggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagt < 2:2463230‑M2/99‑27 (MQ=255) agaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataaata > 1:559750‑M2/65‑99 (MQ=255) ctttgTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgt < 2:3756993‑M2/98‑29 (MQ=255) tttGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgtt > 1:3617848‑M2/1‑70 (MQ=255) aagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATc > 2:835157‑M2/63‑99 (MQ=255) agccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTGGTGCCGCCAATAAATATCt < 2:436783‑M2/38‑1 (MQ=255) tgttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgtttt > 2:2567108‑M2/1‑68 (MQ=255) gttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgtttta > 1:2945580‑M2/1‑67 (MQ=255) ccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTCCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCttt < 1:3955856‑M2/40‑1 (MQ=255) ttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttat > 2:1890715‑M2/1‑66 (MQ=255) cactggagcacctcaaagacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCtttt < 2:110234‑M2/41‑1 (MQ=255) cactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCtttt > 2:2824955‑M2/59‑99 (MQ=255) aGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt > 1:1043838‑M2/1‑63 (MQ=255) ggTAATAATAGAGCCTTAGATTCAGTTGTGCAATAGCCATGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttc > 2:2428901‑M2/1‑62 (MQ=255) gagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaa < 1:3786501‑M2/46‑1 (MQ=255) gTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttca < 1:3498940‑M2/99‑39 (MQ=255) aataatAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcaga < 1:1111927‑M2/99‑41 (MQ=255) ataataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagat > 2:1500064‑M2/1‑58 (MQ=255) cctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTa < 2:2664136‑M2/51‑1 (MQ=255) cctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTa > 2:3253740‑M2/49‑99 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAg > 1:1762831‑M2/48‑99 (MQ=255) ataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataat > 1:2798432‑M2/1‑55 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGc < 1:2012497‑M2/53‑1 (MQ=255) gagCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcc > 2:2336673‑M2/1‑52 (MQ=255) gagCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcc < 1:2978415‑M2/99‑48 (MQ=255) aaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCa > 1:684331‑M2/45‑99 (MQ=255) aaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCa > 1:2894956‑M2/45‑99 (MQ=255) aaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCa > 1:660440‑M2/45‑99 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga < 2:3480292‑M2/99‑51 (MQ=255) aacaccatcatacactaaaacagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGaa < 2:1134911‑M2/58‑1 (MQ=255) cTTAAATTCGGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgat > 2:1415165‑M2/1‑48 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatg < 2:1166058‑M2/99‑53 (MQ=255) caccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGaaaa < 1:417075‑M2/60‑1 (MQ=255) ccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCCTAAAATTAGCCAGAAACGa < 2:1005941‑M2/62‑1 (MQ=255) catcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATACCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAc > 2:802529‑M2/37‑99 (MQ=255) tcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAcgc < 2:647896‑M2/65‑1 (MQ=255) catacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAcgcg > 1:3202453‑M2/34‑99 (MQ=255) aGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc > 2:48093‑M2/1‑39 (MQ=255) aGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc < 1:365198‑M2/99‑61 (MQ=255) aGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc > 2:3305859‑M2/1‑39 (MQ=255) gTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca < 2:1181792‑M2/99‑62 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCa > 1:2194415‑M2/31‑99 (MQ=255) ttGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcat > 1:1319673‑M2/1‑37 (MQ=255) tgtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatg > 1:2275725‑M2/1‑36 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCata > 2:3030990‑M2/29‑99 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCata > 2:3686267‑M2/29‑99 (MQ=255) gtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgc > 1:3684263‑M2/1‑35 (MQ=255) tgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgca < 2:1863183‑M2/99‑66 (MQ=255) aaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAg < 1:1901099‑M2/74‑1 (MQ=255) aaatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAg < 1:2601698‑M2/74‑1 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGc < 2:1681852‑M2/75‑1 (MQ=255) atcagtaagttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGcc < 1:896340‑M2/76‑1 (MQ=255) gCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac < 2:892316‑M2/99‑73 (MQ=255) taagttggcagcatctccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCACATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAtt < 2:3865022‑M2/81‑1 (MQ=255) gttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTac < 1:1011387‑M2/84‑1 (MQ=255) ttggcagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTaca > 2:684097‑M2/15‑99 (MQ=255) aTGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttt > 1:3178527‑M2/1‑20 (MQ=255) tctaaGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttg > 1:790377‑M2/3‑19 (MQ=255) gTAAGGATGTCAAAATTGggtaatgactccagcttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttga > 1:3443644‑M2/1‑18 (MQ=255) cagcatcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCga < 2:3141100‑M2/89‑1 (MQ=255) catcaccCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgatga > 2:2548416‑M2/8‑99 (MQ=255) aGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa > 2:959844‑M2/1‑15 (MQ=255) aGGAATTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgaaga < 2:774428‑M2/99‑85 (MQ=255) tcaccTAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCTCTTTTTACACCGATGCtt > 2:716194‑M2/6‑99 (MQ=255) aaTTCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacga < 1:2401118‑M2/99‑88 (MQ=255) tCAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag < 1:3462739‑M2/99‑91 (MQ=255) cAAAATTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc > 1:1438377‑M2/1‑8 (MQ=255) cAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCgca < 1:1347795/99‑1 (MQ=255) cAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCgca > 1:2674350/1‑99 (MQ=255) aaaaTTGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcg < 1:3367503‑M2/99‑93 (MQ=255) | GTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCAC > NC_000913/1292924‑1293117 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |