| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 1620217 = | 6961 (127.430) | 14 (0.270) | 9/282 | 2.6 | 0.21% | intergenic (+10/+21) | marB/eamA | periplasmic mar operon regulator/cysteine and O‑acetyl‑L‑serine efflux system |
| ? | NC_000913 | 1620235 = | 6558 (126.060) | intergenic (+28/+3) | marB/eamA | periplasmic mar operon regulator/cysteine and O‑acetyl‑L‑serine efflux system | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 7387 total aligned reads displayed.
CCAGTTGTTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTT > NC_000913/1620067‑1620367 | ccgtagtaggactggcaagtgcggcactattgttggatgaacgcttaacgggtctgcaatttttaggtgcggtgctcattatgaccgggctgtatatcaatgtatttggcttgcggtggcgtaaagcggtaaaggtgggaagttaataag < 1:858434‑M1/1‑1 (MQ=255) ccgtagtaggactggcaagtgcggcactattgttggatgaacgcttaacgggtctgcaatttttaggtgcggtgctcattatgaccgggctgtatatcaatgtatttggcttgcggtggcgtaaagcggtaaaggtgggaagttaataaGc > 1:540664‑M1/150‑151 (MQ=255) ccgtagtaggactggcaagtgcggcactattgttggatgaacgcttaacgggtctgcaatttttaggtgcggtgctcattatgaccgggctgtatatcaatgtatttggcttgcggtggcgtaaagcggtaaaggtgggaagttaataaGc > 2:837661‑M1/150‑151 (MQ=255) ccgtagtaggactggcaagtgcggcactattgttggatgaacgcttaacgggtctgcaatttttaggtgcggtgctcattatgaccgggctgtatatcaatgtatttggcttgcggtggcgtaaagcggtaaaggtgggaagttaataaGc > 1:59225‑M1/150‑151 (MQ=255) gttgttACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGcc > 2:525189/1‑150 (MQ=255) ttgttACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGccc > 2:644240/1‑150 (MQ=255) ttgttACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGcc < 2:772794/149‑1 (MQ=255) tagtaggactggcaagtgcggcactattgttggatgaacgcttaacgggtctgcaatttttaggtgcggtgctcattatgaccgggctgtatatcaatgtatttggcttgcggtggcgtaaagcggtaaaggtgggaagttaataaGccc < 1:476200‑M1/4‑1 (MQ=255) tagtaggactggcaagtgcggcactattgttggatgaacgcttaacgggtctgcaatttttaggtgcggtgctcattatgaccgggctgtatatcaatgtatttggcttgcggtggcgtaaagcggtaaaggtgggaagttaataaGccc < 1:144461‑M1/4‑1 (MQ=255) tagtaggactggcaagtgcggcactattgttggatgaacgcttaacgggtctgcaatttttaggtgcggtgctcattatgaccgggctgtatatcaatgtatttggcttgcggtggcgtaaagcggtaaaggtgggaagttaataaGccc < 1:91185‑M1/4‑1 (MQ=255) gttACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGa > 2:618015/1‑151 (MQ=255) gtaggactggcaagtgcggcactattgttggatgaacgcttaacgggtctgcaatttttaggtgcggtgctcattatgaccgggctgtatatcaatgtatttggcttgcggtggcgtaaagcggtaaaggtgggaagttaataaGCCCCGa < 2:707078‑M1/7‑1 (MQ=255) ttACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAc < 1:753529/151‑1 (MQ=255) aCTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAATGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGGGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACAt < 1:624298/151‑1 (MQ=255) cttcttGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACAtc < 1:303090/151‑1 (MQ=255) gtgCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCgggg > 1:573896/1‑151 (MQ=255) tGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCttatta > 1:460726/1‑151 (MQ=255) gTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTaa > 1:213840/1‑151 (MQ=255) 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aaTCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAg < 2:235295/151‑1 (MQ=255) tCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCg < 2:107043/151‑1 (MQ=255) cAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGt > 2:140893/1‑151 (MQ=255) acacGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGTTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGtt > 2:312169/1‑150 (MQ=255) cGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATc < 2:659523/151‑1 (MQ=255) gCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATc > 1:786730/1‑150 (MQ=255) gCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATc > 2:73750/1‑150 (MQ=255) gCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATc > 1:414165/1‑150 (MQ=255) cTATGTAGTTTGTTTTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAAGTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATcc < 2:401817/150‑1 (MQ=255) gTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCcaacaa > 1:196349/1‑151 (MQ=255) 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tGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGc < 2:559926/151‑1 (MQ=255) | CCAGTTGTTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTT > NC_000913/1620067‑1620367 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |