| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 3,966,174 | IS1 (–) +9 bp | intergenic (+84/‑235) | trxA → / → rho | thioredoxin 1/transcription termination factor |
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| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 47 (1.080) | 27/298 | 0.3 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3966182 | 0 (0.000) | intergenic (+92/‑235) | trxA/rho | thioredoxin 1/transcription termination factor | |||||
GTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCTCCTGTGACCAGGCAGCGAAAAGACATGAGTCGATG > NC_000913/3966034‑3966331 | gTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTgg < 2:223458‑M2/151‑3 (MQ=255) tGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTgg > 2:355746‑M2/1‑148 (MQ=255) gatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCttatta > 2:255313‑M2/138‑151 (MQ=255) 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cAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCTCCTGTGACCAGGCAGCGAAAAGACATg < 1:56895‑M2/150‑1 (MQ=255) cATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCTCCTGTGACCAGGCAGCGAAAAGACATGAGt > 1:321344/1‑151 (MQ=255) ccTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCTCCTGTGACCAGGCAGCGAAAAGACATGAGTCGAt > 1:156550/1‑151 (MQ=255) ccTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCTCCTGTGACCAGGCAGCGAAAAGACATGAGTCGAt > 2:294618/1‑151 (MQ=255) cTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattc > 1:132310‑M2/1‑2 (MQ=255) | GTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCTCCTGTGACCAGGCAGCGAAAAGACATGAGTCGATG > NC_000913/3966034‑3966331 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |