| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012417 | = 997 | 4013 (0.450) | 216 (0.030) | 45/138 | NT | 5.9% | intergenic (+9/+6) | USA300HOU_RS14890/USA300HOU_RS15665 | replication protein/hypothetical protein |
| ? | NC_012417 | = 1001 | 3435 (0.440) | intergenic (+13/+2) | USA300HOU_RS14890/USA300HOU_RS15665 | replication protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 12048 total aligned reads displayed.
GAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGA > NC_012417/907‑1087 | gaAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGT > 1:2181313‑M1/1‑91 (MQ=255) aaGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAACATTATTATTTAAGACATTAgtg > 2:3132599/1‑91 (MQ=255) aaGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAgtg > 1:1503661/1‑91 (MQ=255) ttatttttgtgacactacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaAAGACATTAGTGTTGACt > 2:397798‑M1/74‑91 (MQ=255) aaaCAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGact > 2:899659‑M2/1‑88 (MQ=255) aaaCAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGact > 1:5653405‑M2/1‑88 (MQ=255) aaaCAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGact < 1:1380983‑M2/91‑4 (MQ=255) aacaacAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGacta > 2:1410190‑M2/1‑87 (MQ=255) aacaacAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGacta < 1:2083012‑M2/91‑5 (MQ=255) acaacaGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTcaacactaa < 2:1497559‑M1/91‑10 (MQ=255) acaacaGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGactaa < 2:4950528‑M2/91‑6 (MQ=255) caacaGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGactaat > 1:777192‑M2/1‑85 (MQ=255) caGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGactaatgtc < 1:4635401‑M2/91‑10 (MQ=255) aCGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCttt > 2:4081957/1‑91 (MQ=255) aCGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCttt > 2:5259897/1‑91 (MQ=255) agaagaaAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTttg > 1:1682626/1‑91 (MQ=255) agaagaaAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTttg < 1:3582197/91‑1 (MQ=255) agaaaaaAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTttg < 2:4265935/91‑1 (MQ=255) gaagaaAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTttgt < 1:5161515/91‑1 (MQ=255) aagaaAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTttgtt < 1:4101663/91‑1 (MQ=255) aagaaAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTttgtt < 1:42327/91‑1 (MQ=255) agaaAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAACAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTttgttg > 1:4343528/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGa < 2:1299893/90‑1 (MQ=255) aaGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGAtttt > 2:118863/1‑91 (MQ=255) aaGCACATTCAATTACCGCAAGTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGAtttt < 2:3243793/91‑1 (MQ=255) aGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGAttttt < 1:1002383/91‑1 (MQ=255) aGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGAttttt < 2:793680/91‑1 (MQ=255) gCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGAtttttt > 1:5562615/1‑91 (MQ=255) acaTTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTtat < 2:1083954/91‑1 (MQ=255) tCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATaaaa < 2:2117526/91‑1 (MQ=255) cAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATaaaaa < 1:1791114/91‑1 (MQ=255) cAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATaaaaa > 1:443433/1‑91 (MQ=255) cAATTACCGCAATTTGGAATTTAGTAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGAATAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATaaaaa < 2:5571735/91‑1 (MQ=255) ccGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTttgttg < 1:3887499/71‑1 (MQ=255) cGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTG < 1:3300899‑M1/91‑1 (MQ=255) cGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTG > 1:5361937‑M1/1‑91 (MQ=255) gCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGT < 1:4526936‑M1/91‑1 (MQ=255) cAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTC < 2:201824‑M1/91‑1 (MQ=255) aaTTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCT < 2:50678‑M1/91‑1 (MQ=255) aaTTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCT < 1:1204258‑M1/91‑1 (MQ=255) aaTTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCT > 2:2803111‑M1/1‑91 (MQ=255) aTTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTT > 1:4003951‑M1/1‑91 (MQ=255) ggAATTTCGAAAAGCACAATTATTATTTAAGACATTCGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTT > 1:2285850‑M1/1‑91 (MQ=255) gAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGCGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTT > 2:4638810‑M1/1‑91 (MQ=255) aaTTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTT < 1:349577‑M1/91‑1 (MQ=255) aTTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTG > 1:158369‑M1/1‑91 (MQ=255) ttCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTG < 2:3476330‑M1/91‑1 (MQ=255) ttCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTG < 1:3107774‑M1/91‑1 (MQ=255) cGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGAC < 1:3009681‑M1/91‑1 (MQ=255) cGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGAC < 1:4834722‑M1/91‑1 (MQ=255) aaaaGCCAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACaa < 2:5167538/91‑1 (MQ=255) aaaaGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACaa < 1:3689123/91‑1 (MQ=255) aaaGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACaaa < 1:1296102/91‑1 (MQ=255) aGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATg < 2:3862791/91‑1 (MQ=255) aGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTATATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATg < 2:5446473/91‑1 (MQ=255) gCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGc < 1:3794003/91‑1 (MQ=255) cAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCt < 1:1883840/91‑1 (MQ=255) aaaaTTATAAGTTAAGACATTAGTcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctt < 1:2825876‑M1/91‑68 (MQ=255) aaaTTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCtgt < 1:2398066/91‑1 (MQ=255) aaTTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCtgta < 2:1800705/91‑1 (MQ=255) attattattTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTTATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGATATATGCtgtat > 2:59356/1‑91 (MQ=255) tattattTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCtgtatgt < 1:2712994/91‑1 (MQ=255) attattTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACActacatacagcat < 1:979932‑M1/91‑14 (MQ=255) attattTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCtgtatgta < 1:338376/91‑1 (MQ=255) attattTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCtgtatgta > 1:259540/1‑91 (MQ=255) attattTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCtgtatgta < 2:3016285/91‑1 (MQ=255) ttattTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAg > 2:2523172/1‑91 (MQ=255) ttattTAAGACACTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAg < 2:3753476/91‑1 (MQ=255) tATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGt > 2:2911238‑M2/1‑90 (MQ=255) tATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGt < 1:882404‑M2/91‑2 (MQ=255) tATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGt < 2:2619021‑M2/91‑2 (MQ=255) aTTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtg < 2:3577545‑M2/91‑3 (MQ=255) aTTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtg > 1:5048546‑M2/1‑89 (MQ=255) tAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtca > 1:3204078‑M2/1‑86 (MQ=255) tAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtca > 2:3664300‑M2/1‑86 (MQ=255) aaaGACATTAGTGTTGACTAGTGTCTTTTTTGTTGTTTTTTTATGAAAAAGTACTGCCTTATTTTAGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTca < 2:4733500/90‑1 (MQ=18) aaGACATTAGTcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtc < 1:2908882‑M1/91‑81 (MQ=255) AGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTcaca > 2:1918531‑M1/1‑91 (MQ=255) aCATTAGTcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtctgt > 2:2699223‑M1/1‑8 (MQ=255) aCATTAGTcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtctgt > 2:4840156‑M1/1‑8 (MQ=255) aCATTAGTGTTGTCTAGTGTCTTTTTTGTTGATGTTTTATAAAAAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAAGGCGGTATGTAGTGTCACaaa < 1:2488/91‑1 (MQ=18) cATTAGTcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtctgtt > 1:1982745‑M1/1‑7 (MQ=255) cATTAGTcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtctgtt > 2:157617‑M1/1‑7 (MQ=255) aTTAGTcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtctgttg > 2:69114‑M1/1‑6 (MQ=255) aTTAGTcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtctgttg > 2:2214503‑M1/1‑6 (MQ=255) ATTAGTATTGACTAATGTTTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACaaaaa > 1:4727020‑M1/1‑91 (MQ=255) ttAGTcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtctgttgt < 2:4556390‑M1/91‑87 (MQ=255) TTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAAt < 2:1691422‑M1/91‑1 (MQ=255) TTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAAt < 2:2424125‑M1/91‑1 (MQ=255) tAGTcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtctgttgtt > 1:5265502‑M1/1‑4 (MQ=255) tAGTcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtctgttgtt > 1:668836‑M1/1‑4 (MQ=255) aGTcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtctgttgttt < 1:1111295‑M1/91‑89 (MQ=255) aGTcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtctgttgttt < 2:4452322‑M1/91‑89 (MQ=255) AGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTGGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATaa > 2:3358353‑M1/1‑91 (MQ=255) gTcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtctgttgtttt < 1:4938938‑M1/91‑90 (MQ=255) gTcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtctgttgtttt < 2:4184098‑M1/91‑90 (MQ=255) tgtTGactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtctgttgtttta < 1:5458329‑M2/91‑87 (MQ=255) tcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctttttcttcttcgtctgttgtttta > 2:2311687‑M1/1‑1 (MQ=255) TGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGa > 2:535258‑M1/1‑91 (MQ=255) TGTTGACTAATGTCTCTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGa > 2:4353336‑M1/1‑91 (MQ=255) | GAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGA > NC_012417/907‑1087 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |