| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2850817 = | 282 (0.980) | 8 (0.030) | 7/132 | NT | 3.6% | intergenic (+16/+103) | pcp/USA300HOU_RS14605 | Pyrrolidone‑carboxylate peptidase/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2850866 = | 195 (0.820) | intergenic (+65/+54) | pcp/USA300HOU_RS14605 | Pyrrolidone‑carboxylate peptidase/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 380 total aligned reads displayed.
GCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCT > USA300TCH1516_ALE/2850727‑2850907 | tttgtaaattttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcc > 2:5301746‑M1/91‑91 (MQ=255)tttgtaaattttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcc > 1:1661409‑M1/91‑91 (MQ=255)gCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCacaaac > 1:1815003/1‑91 (MQ=255) ttgtaaattttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCa < 1:3672200‑M1/2‑1 (MQ=255) cAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCacaaaca < 1:2703484/91‑1 (MQ=255) taaattttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCaaaa < 2:1463729‑M1/5‑1 (MQ=255) aaattttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAg > 2:3669503‑M1/86‑91 (MQ=255) ttGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGTCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGc < 2:5231940/91‑1 (MQ=255) aattttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGc < 1:4594184‑M1/7‑1 (MQ=255) tGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCa > 1:3593866/1‑91 (MQ=255) ttttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCAc < 1:5015676‑M1/9‑1 (MQ=255) ttttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCAc < 2:1711243‑M1/9‑1 (MQ=255) aCTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCacaaac > 2:4292044/1‑82 (MQ=255) aCTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCAcc > 2:4063122/1‑91 (MQ=255) aCTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCAcc > 2:1105515/1‑91 (MQ=255) aCTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCAcc < 1:2108587/91‑1 (MQ=255) aCTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCAcc < 2:2018946/91‑1 (MQ=255) ttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCAccc > 1:2549388‑M1/81‑91 (MQ=255) ttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCAccc < 2:2437454‑M1/11‑1 (MQ=255) cTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCAccc < 2:1957413/91‑1 (MQ=255) tGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCt < 1:2072508/91‑1 (MQ=255) tGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCt < 2:5102968/91‑1 (MQ=255) aggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTa < 2:3291774‑M1/13‑1 (MQ=255) aggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTa < 2:5607401‑M1/13‑1 (MQ=255) ggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTaa < 2:1765264‑M1/14‑1 (MQ=255) ggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTaa < 1:1058830‑M1/14‑1 (MQ=255) cAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTaa > 2:2089778/1‑91 (MQ=255) aGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAAt < 1:531830/91‑1 (MQ=255) gCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTGTAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAAtt < 2:846944/91‑1 (MQ=255) gCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAAtt > 2:4951135/1‑91 (MQ=255) ttGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGtt > 2:2802512/1‑91 (MQ=255) tGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTa > 2:4775752/1‑91 (MQ=255) tGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTa < 2:58715/91‑1 (MQ=255) gAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAg > 1:4373464/1‑91 (MQ=255) aaGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATGAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGt > 2:1428309/1‑91 (MQ=255) aGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAACGCACCCTAATTTGTTAGtt > 1:4337142/1‑91 (MQ=255) aGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGtt < 2:3371623/91‑1 (MQ=255) cTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTa > 1:3756627/1‑91 (MQ=255) tttCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGt < 1:3416310/91‑1 (MQ=255) ttCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACATACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTc < 1:5524621/91‑1 (MQ=255) ttCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTc < 1:1181229/91‑1 (MQ=255) tCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCt < 1:2166980/91‑1 (MQ=255) cTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTa > 1:1954421/1‑91 (MQ=255) cTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTGAGTTTAAGTCTa > 2:3748254/1‑91 (MQ=255) cTAATGATGAGGATTCACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTa > 1:3164908/1‑91 (MQ=255) tgaGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAg > 2:7464/1‑91 (MQ=255) tgaGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAg > 1:260114/1‑91 (MQ=255) tgaGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAg < 1:5439302/91‑1 (MQ=255) tgaGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAg < 2:4142693/91‑1 (MQ=255) gaGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAgg < 2:2258118/91‑1 (MQ=255) aGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAggg > 2:273158/1‑91 (MQ=255) tACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCttt > 2:1016436/1‑91 (MQ=255) tACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCttt < 1:235685/91‑1 (MQ=255) tagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCtttt > 1:4177250‑M1/44‑91 (MQ=255) cacCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTg > 2:380118/1‑91 (MQ=255) cacCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTg > 1:5274344/1‑91 (MQ=255) cacCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTg > 2:2416785/1‑91 (MQ=255) ccTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGga > 2:487525/1‑91 (MQ=255) cTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGCGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGgat > 1:5517138/1‑91 (MQ=255) ccTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTg > 2:5070078/1‑91 (MQ=255) ccTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTg > 1:1007916/1‑91 (MQ=255) ccTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGAGCTTTTGGATGATTg > 2:5259991/1‑91 (MQ=255) cTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTgg > 2:4347020/1‑91 (MQ=255) cTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTgg < 1:791708/91‑1 (MQ=255) tGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGt > 2:3962942/1‑91 (MQ=255) gggCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGta < 2:4568742/91‑1 (MQ=255) gggCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGta < 2:1521514/91‑1 (MQ=255) ggCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGtat > 1:3307241/1‑91 (MQ=255) gCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGtata > 2:3635646/1‑91 (MQ=255) gCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGtata > 1:4541244/1‑91 (MQ=255) cacaACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATAc < 1:2795442/91‑1 (MQ=255) caACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAg < 1:2452158/91‑1 (MQ=255) caACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAg > 2:4248072/1‑91 (MQ=255) aaCGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGt > 1:36802/1‑91 (MQ=255) aCGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGtt < 2:5024573/91‑1 (MQ=255) cGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGttt > 1:4880410/1‑91 (MQ=255) cGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGttt > 1:692894/1‑91 (MQ=255) ggAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGtttt > 1:3048033/1‑91 (MQ=255) ggAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGtttt < 1:3088906/91‑1 (MQ=255) ggAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGtttt < 1:148039/91‑1 (MQ=255) aaTAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTAc < 2:4659095/91‑1 (MQ=255) tAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACta > 2:3571277/1‑91 (MQ=255) gTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACtata > 1:1550746/1‑91 (MQ=255) gTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACtata > 2:5338364/1‑91 (MQ=255) gTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACtata > 2:2924169/1‑91 (MQ=255) ataAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatg < 1:3547178/91‑1 (MQ=255) ataAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatg > 1:3917071/1‑91 (MQ=255) aaGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgat > 1:30099/1‑91 (MQ=255) aGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgatg < 2:4496409/91‑1 (MQ=255) aGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgatg < 2:4793400/91‑1 (MQ=255) cacaAACAAAAGCATCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAGCTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTAtt < 1:4685942/91‑1 (MQ=255) cacaAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTAtt > 1:4500987/1‑91 (MQ=255) acaaacaaAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTAttt > 2:3087384/1‑91 (MQ=255) acaaacaaAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTGACTATAATGATGTAttt < 1:4276458/91‑1 (MQ=255) caaacaaaAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTAtttt > 1:511698/1‑91 (MQ=255) caaacaaaAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTAtttt > 1:2866325/1‑91 (MQ=255) aacaaaAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAg > 2:173904/1‑91 (MQ=255) acaaaAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGc > 2:3913225/1‑91 (MQ=255) CAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCt < 1:1232822‑M1/91‑1 (MQ=255) CAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCt > 1:573986‑M1/1‑91 (MQ=255) | GCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAACTTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCT > USA300TCH1516_ALE/2850727‑2850907 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |