| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2854319 | 334 (1.160) | 10 (0.040) | 9/150 | NT | 2.9% | intergenic (+17/+396) | yflS/USA300HOU_RS14625 | Putative malate transporter YflS/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2854338 | 359 (1.330) | intergenic (+36/+377) | yflS/USA300HOU_RS14625 | Putative malate transporter YflS/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 475 total aligned reads displayed.
TATTAGGTTTCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTATCCT > USA300TCH1516_ALE/2854229‑2854409 | tatTAGGTTTCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGC < 2:4659782‑M1/91‑1 (MQ=255) atTAGGTTTCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCt < 2:3471074/91‑1 (MQ=255) tAGGTTTCGTCTGCTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCg < 2:3645031/91‑1 (MQ=255) aGGTTTCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGa > 1:5006330/1‑91 (MQ=255) ggTTTCGTCTACTATATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGaa > 2:1205540/1‑91 (MQ=255) ttCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAAtct < 1:3360515/91‑1 (MQ=255) tCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAAtctc < 1:1209151/91‑1 (MQ=255) tCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAAtctc > 1:5644246/1‑91 (MQ=255) cGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCa < 1:3221088/91‑1 (MQ=255) cGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCa < 2:760699/91‑1 (MQ=255) gTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCAt < 2:379502/91‑1 (MQ=255) gTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCAt > 2:2919013/1‑91 (MQ=255) tACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGa < 2:1810986/91‑1 (MQ=255) tACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGa > 2:2078788/1‑91 (MQ=255) cTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGAtt < 1:5469952/91‑1 (MQ=255) tttATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGAttt < 1:1811789/91‑1 (MQ=255) attatCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGg < 1:456383‑M2/91‑2 (MQ=255) ttatCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGgc < 1:4942263‑M2/91‑3 (MQ=255) ttatCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGgc > 1:5166157‑M2/1‑89 (MQ=255) tatCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGgcg > 2:4098631‑M2/1‑88 (MQ=255) tatCCGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGgcg < 1:5316511‑M2/91‑4 (MQ=255) atCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGgcgc > 2:4719037‑M2/1‑87 (MQ=255) tCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGgcgct < 1:2091523‑M2/91‑6 (MQ=255) tCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGgcgct > 2:5003269‑M2/1‑86 (MQ=255) cTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCtt > 1:5571911/1‑91 (MQ=255) cTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCtt > 2:2557404/1‑91 (MQ=255) tGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCttt > 2:147904/1‑91 (MQ=255) gggATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATAGTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCttt < 2:2182423/90‑1 (MQ=255) ggATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCtttt > 1:843558/1‑91 (MQ=255) ggATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCtttt < 1:2543760/91‑1 (MQ=255) gATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCttttt > 1:2369213/1‑91 (MQ=255) aTTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTa < 1:3127942/91‑1 (MQ=255) tGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAAt > 1:100414/1‑91 (MQ=255) ggTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAAtt < 2:5434094/91‑1 (MQ=255) gTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAAttt < 2:131044/91‑1 (MQ=255) gTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAAttt < 2:5088968/91‑1 (MQ=255) gTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGATATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAAttt > 1:4383445/1‑91 (MQ=255) tttAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTg < 1:2304716/91‑1 (MQ=255) tttAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAAGCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTg < 2:5411247/91‑1 (MQ=255) ttAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGt < 1:1715090/91‑1 (MQ=255) tAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTa > 2:4321115/1‑91 (MQ=255) aTCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTATAAAATATTTAAATTAGAGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTCGTATTTa > 1:4484148/1‑91 (MQ=255) cACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTaaa > 1:5123397/1‑91 (MQ=255) cACTTAGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTaaa > 2:5528778/1‑91 (MQ=255) aCTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTTGAATCTCATTCATTTTGGCGCTTTTTAATTTGTATTTaaaa > 2:5595840/1‑91 (MQ=255) aCTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTaaaa > 1:2152181/1‑91 (MQ=255) aCTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTaaaa > 2:3587686/1‑91 (MQ=255) aCTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTaaaa < 1:4693031/91‑1 (MQ=255) aCTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTaaaa > 2:3548898/1‑91 (MQ=255) cTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAAt < 1:1510715/91‑1 (MQ=255) tGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCaa > 1:5376782/1‑91 (MQ=255) ggATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAAc > 2:4543096/1‑91 (MQ=255) ggATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAAc > 1:3879576/1‑91 (MQ=255) ggATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAAc > 2:1051989/1‑91 (MQ=255) gATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAAcc > 1:4292050/1‑91 (MQ=255) aTGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCt < 1:240154/91‑1 (MQ=255) tGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCtt > 1:3536661/1‑91 (MQ=255) aaaGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTg < 2:2712314/91‑1 (MQ=255) aaGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTTATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGc > 2:4377395/1‑91 (MQ=255) aaGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGc < 1:2489062/91‑1 (MQ=255) aaGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGc < 2:1694642/91‑1 (MQ=255) aGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCt > 1:3004003/1‑91 (MQ=255) aaTTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTaaa < 2:3242428/91‑1 (MQ=255) aaTTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTaaa < 1:4756523/91‑1 (MQ=255) aaTTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTaaa > 1:3741475/1‑91 (MQ=255) gTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAg > 2:851885/1‑91 (MQ=255) tataTTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGa < 2:1554637/91‑1 (MQ=255) atatTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGAc < 1:2627803/91‑1 (MQ=255) atatTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGAc < 1:2575330/91‑1 (MQ=255) ttttAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTcc < 1:3944496/91‑1 (MQ=255) ttAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCt < 1:4798140/91‑1 (MQ=255) tAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCtt > 1:4642971/1‑91 (MQ=255) aaaaTATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCttt > 2:239390/1‑91 (MQ=255) aaaaTATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCttt > 2:4039727/1‑91 (MQ=255) aaTATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTTATTTGGgcgctaatttaaatattttaaaatataccaattactttcatccaaagtgatccta < 2:4264631‑M2/91‑56 (MQ=255) tatTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTaa < 1:68331/91‑1 (MQ=255) tatTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTaa > 1:4078538/1‑91 (MQ=255) atTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTaaa > 2:604316/1‑91 (MQ=255) atTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTaaa > 2:1971828/1‑91 (MQ=255) ttAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAAt < 1:1329216/91‑1 (MQ=255) tAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATa > 1:5415483/1‑91 (MQ=255) tAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATa > 2:4901843/1‑91 (MQ=255) tAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATa > 1:2899806/1‑91 (MQ=255) aaaTTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATAc > 2:5365541/1‑91 (MQ=255) aaTTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACg > 2:458756/1‑91 (MQ=255) ttAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGtt < 1:1997049/91‑1 (MQ=255) tAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGttt < 2:2234755/91‑1 (MQ=255) aGCGCccaaatcaatgagattcgagcgctaatttaaatattttaaaatataccaattactttcatccaaagtgatcctaaaccaatccaga > 2:2290894‑M1/1‑5 (MQ=255) aGCGCccaaatcaatgagattcgagcgctaatttaaatattttaaaatataccaattactttcatccaaagtgatcctaaaccaatccaga > 1:1417983‑M1/1‑5 (MQ=255) aGCGCccaaatcaatgagattcgagcgctaatttaaatattttaaaatataccaattactttcatccaaagtgatcctaaaccaatccaga > 2:4959247‑M1/1‑5 (MQ=255) cgcccaaatcaatgagattcgagcgctaatttaaatattttaaaatataccaattactttcatccaaagtgatcctaaaccaatccagata > 2:675506‑M1/1‑3 (MQ=255) cgcccaaatcaatgagattcgagcgctaatttaaatattttaaaatataccaattactttcatccaaagtgatcctaaaccaatccagata > 1:2744‑M1/1‑3 (MQ=255) cgcTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTATc > 2:3160365/1‑91 (MQ=255) cgcTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTATc > 1:1921202/1‑91 (MQ=255) cgcTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTATc > 2:4844827/1‑91 (MQ=255) cgcTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTATc > 1:933569/1‑91 (MQ=255) cccaaatcaatgagattcgagcgctaatttaaatattttaaaatataccaattactttcatccaaagtgatcctaaaccaatccagataat > 2:3935538‑M1/1‑1 (MQ=255) cTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTATCCt < 1:3432047/91‑1 (MQ=255) cTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTATCCt > 1:4216608/1‑91 (MQ=255) cTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTATCCt > 1:1065237/1‑91 (MQ=255) | TATTAGGTTTCGTCTACTTTATTATCTGGATTGGTTTAGGATCACTTTGGATGAAAGTAATTGGTATATTTTAAAATATTTAAATTAGCGCTCGAATCTCATTGATTTGGGCGCTTTTTAATTTGTATTTAAAATCAACCTTTGCTAAATCAAGACTCCCTTTTTAAAATACGTTTATCCT > USA300TCH1516_ALE/2854229‑2854409 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |