| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2746384 = | 272 (0.950) | 11 (0.040) | 8/140 | NT | 4.8% | intergenic (‑632/+53) | mqo2/acsA_2 | putative malate:quinone oxidoreductase 2/Acetyl‑coenzyme A synthetase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2746429 = | 200 (0.800) | intergenic (‑677/+8) | mqo2/acsA_2 | putative malate:quinone oxidoreductase 2/Acetyl‑coenzyme A synthetase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 331 total aligned reads displayed.
ATTTTAATATTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAACACGACGAATTTTACCTGAGTTT > USA300TCH1516_ALE/2746339‑2746518 | aTTTTAATATTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCttt > 2:3632979/1‑91 (MQ=255)aTTTTAATATTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCttt > 2:5052260/1‑91 (MQ=255)aTTTTAATATTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCttt > 1:1855172/1‑91 (MQ=255) ttttAATATTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTg > 1:1077658/1‑91 (MQ=255) ttttAATATTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTg < 2:4217042/91‑1 (MQ=255) ttttAATATTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTg > 1:1820231/1‑91 (MQ=255) tttAATATTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGc > 2:2834296/1‑91 (MQ=255) ttAATATTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCt > 2:1480216/1‑91 (MQ=255) ttAATATTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCt < 1:1839801/91‑1 (MQ=255) tAATATTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTa > 2:4126215/1‑91 (MQ=255) aaTATTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTAt > 1:3458453/1‑91 (MQ=255) atatTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATg > 2:25107/1‑91 (MQ=255) tatTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGt > 1:1450470/1‑91 (MQ=255) atTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGtt < 1:1701193/91‑1 (MQ=255) ttATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTa < 2:100360/91‑1 (MQ=255) tataACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTat > 1:854330/1‑91 (MQ=255) ataACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTatt > 2:4591372/1‑91 (MQ=255) agaaCTAGACGACAAAGAACATCATCAATAAACACGCAGTCCAGTGCGTATCATCGAACCTTACGCATTGCACTGCTTTGCTATGTTTatt > 2:4712750/3‑91 (MQ=255) cTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTattgatt < 1:3646835/91‑1 (MQ=255) cTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTattgatt < 1:3531001/91‑1 (MQ=255) aGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGc < 1:817764/91‑1 (MQ=255) gacgacAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCt < 1:2898538/91‑1 (MQ=255) gacgacAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCt > 2:213580/1‑91 (MQ=255) acgacAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTa > 2:1200690/1‑91 (MQ=255) cgacAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTAt < 2:1824313/91‑1 (MQ=255) cAAAGAACATCATAAATAGACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCtt < 1:5556071/91‑1 (MQ=255) cAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCtt < 2:4615467/91‑1 (MQ=255) cAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCtt > 1:3066800/1‑91 (MQ=255) aaaGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCttt < 1:2026849/91‑1 (MQ=255) aGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCttttt > 2:698810/1‑91 (MQ=255) gAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTttg > 2:3053798/1‑91 (MQ=255) gAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTttg < 2:342683/91‑1 (MQ=255) catcatAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTttgttg < 1:3629613/91‑1 (MQ=255) atcatAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTttgttgt > 2:3467603/1‑91 (MQ=255) tcttaaataaaCAAGCAGTCTAGTGCGTATCATCATACCTTACGGATTGGACTGCTATGCTATGTGTATTGATTGCTATCTTTttgttgtt < 2:4729620/88‑1 (MQ=255) tcatAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGTATGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTttgttgtt > 2:1734959/1‑91 (MQ=255) tcatAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATCGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTttgttgtt > 1:5018680/1‑91 (MQ=255) catAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATCCCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTCTttgttgttg > 2:2615594/1‑91 (MQ=255) catAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTttgttgttg > 1:712298/1‑91 (MQ=255) catAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTttgttgttg < 1:1656091/91‑1 (MQ=255) catAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTttgttgttg > 1:2441839/1‑91 (MQ=255) ataaataaACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGc < 2:5549247/91‑1 (MQ=255) ataaataaACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGc < 1:2828568/91‑1 (MQ=255) aaataaaCAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCa > 2:2545343/1‑91 (MQ=255) ataaaCAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCAtt < 1:3838905/91‑1 (MQ=255) taaaCAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCAttt > 1:3181035/1‑91 (MQ=255) taaaCAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCAttt < 2:1121616/91‑1 (MQ=255) taaaCAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTCTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGCTGTTGCCAttt > 2:5635604/1‑91 (MQ=255) aaaCAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCAtttt > 2:3342669/1‑91 (MQ=255) aaCAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCAttttt < 1:1525646/91‑1 (MQ=255) cAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCt > 1:587131/1‑91 (MQ=255) cAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCt < 1:2527656/91‑1 (MQ=255) cAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCt > 2:5372850/1‑91 (MQ=255) cAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCt > 1:4399892/1‑91 (MQ=255) AAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTa < 1:1925150‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTAt < 2:907653‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTAt > 2:1024308‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTAt < 1:2212663‑M1/91‑1 (MQ=255) GCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTAtt < 2:4965271‑M1/91‑1 (MQ=255) GCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTAtt < 2:2920711‑M1/91‑1 (MQ=255) gtccaatgcgtaaggtatgatgatacgcactggactgcttTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCa > 1:1004484‑M2/41‑91 (MQ=255) tccaatgcgtaaggtatgatgatacgcactggactgcttTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAg > 1:3997767‑M2/40‑91 (MQ=255) TCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAg < 1:347509‑M1/91‑1 (MQ=255) TCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAg > 1:4251955‑M1/1‑91 (MQ=255) CCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGc > 2:1657081‑M1/1‑91 (MQ=255) AGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCAt < 2:1359857‑M1/91‑1 (MQ=255) AGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCAt > 1:4626518‑M1/1‑91 (MQ=255) gTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCAtc < 1:2506026/91‑1 (MQ=255) tGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCAtct > 1:3707380/1‑91 (MQ=255) gcgtaaggtatgatgatacgcactggactgcttTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCAtctc > 1:3368082‑M2/34‑91 (MQ=255) cgtaaggtatgatgatacgcactggactgcttTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCg > 2:80826‑M2/33‑91 (MQ=255) cGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCg < 2:1894545/91‑1 (MQ=255) cGTATCATCAGACCTTTCGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTATTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCg < 2:4490085/91‑1 (MQ=255) gtaaggtatgatgatacgcactggactgcttTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGt > 2:5215483‑M2/32‑91 (MQ=255) gTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGt > 1:4803965/1‑91 (MQ=255) gTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGt < 1:2162724/91‑1 (MQ=255) gTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGt < 2:2163365/91‑1 (MQ=255) gTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGt < 1:2937564/91‑1 (MQ=255) tATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTa > 2:2268672/1‑91 (MQ=255) tATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTa < 2:2350823/91‑1 (MQ=255) tcatcaTACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGt > 1:4874956/1‑91 (MQ=255) tcatcaTACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGt < 2:3894844/91‑1 (MQ=255) catACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCaa < 2:4324507/91‑1 (MQ=255) catACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCaa < 1:2781151/91‑1 (MQ=255) atACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAac < 1:1300243/91‑1 (MQ=255) cTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAACacga < 1:1580671/91‑1 (MQ=255) aCGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAACAcgacga > 1:5460776/1‑91 (MQ=255) cGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTTATCATCTCGTAGTTCAACACGACGaa > 2:4359488/1‑91 (MQ=255) gCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTCGCCATTTTTCTATTTCAGCCTCTCGTAGTTCAACACGACGAAt > 2:3089113/1‑91 (MQ=255) aTTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAACACGACGAAttt > 2:4503944/1‑91 (MQ=255) ggactgcttTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAACACGACGAATTTTAc > 2:3566520‑M2/10‑91 (MQ=255) gactgcttTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAACACGACGAATTTTAcc > 1:1209252‑M2/9‑91 (MQ=255) actgcttTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAACACGACGAATTTTACCt < 1:5186281‑M2/84‑1 (MQ=255) ctgcttTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAACACGACGAATTTTACCTg < 2:374148‑M2/85‑1 (MQ=255) cttTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAACACGACGAATTTTACCTGAGt > 2:2468577‑M2/4‑91 (MQ=255) cttTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAACACGACGAATTTTACCTGAGt > 1:1308535‑M2/4‑91 (MQ=255) cttTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAACACGACGAATTTTACCTGAGt < 1:375736‑M2/88‑1 (MQ=255) cttTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTGCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAACACGACGAATTTTACCTGAGt < 2:4033253‑M2/88‑1 (MQ=255) ttTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAACACGACGAATTTTACCTGAGtt > 2:1921887‑M2/3‑91 (MQ=255) tTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAACACGACGAATTTTACCTGAGttt > 2:863729‑M2/2‑91 (MQ=255) | ATTTTAATATTTATAACTAGACGACAAAGAACATCATAAATAAACAAGCAGTCCAGTGCGTATCATCATACCTTACGCATTGGACTGCTTTGCTATGTTTATTGATTGCTATCTTTTTGTTGTTGCCATTTTTCTATTTCAGCATCTCGTAGTTCAACACGACGAATTTTACCTGAGTTT > USA300TCH1516_ALE/2746339‑2746518 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |