New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000731 | = 4373 | 310 (0.270) | 234 (0.050) | 31/148 | NT | 21.6% | intergenic (+338/‑127) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0006/cadR | hypothetical protein/cadmium binding protein |
? | NC_012417 | = 1986 | 1408 (0.170) | intergenic (+219/+107) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 4975 total aligned reads displayed.
TGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAG > NC_012417/1896‑2073 | tGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGa < 2:797743/91‑1 (MQ=255) tGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGa < 1:1972289/91‑1 (MQ=255) gATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGATGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAc < 1:5348352‑M2/91‑2 (MQ=255) gATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAc > 2:4753023‑M2/1‑90 (MQ=255) gATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAc < 2:188198‑M2/91‑2 (MQ=255) gATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAc > 1:2460339‑M2/1‑90 (MQ=255) aTTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAcg > 1:3590745‑M2/1‑89 (MQ=255) aTCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAcgaat > 1:1114971‑M2/1‑86 (MQ=255) aTCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAcgaat > 1:1689621‑M2/1‑86 (MQ=255) aTCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAcgaat > 2:3744951‑M2/1‑86 (MQ=255) tCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAcgaatg > 1:1515760‑M2/1‑85 (MQ=255) tCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAcgaatg > 2:4947187‑M2/1‑85 (MQ=255) tCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAcgaatg > 1:3490481‑M2/1‑85 (MQ=255) tCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAACTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAcgaatg > 1:4253113‑M2/1‑85 (MQ=255) cATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGt < 1:2296317/91‑1 (MQ=255) cATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGt > 1:4036724/1‑91 (MQ=255) cATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGt < 1:330152/91‑1 (MQ=255) cATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGt > 1:2850338/1‑91 (MQ=255) aTGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTc < 2:4629171/91‑1 (MQ=255) aaGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGgc > 2:3319644‑M2/1‑89 (MQ=255) aaGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGgc < 2:2199932‑M2/91‑3 (MQ=255) aaGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGgc > 2:4036896‑M2/1‑89 (MQ=255) aGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGgca > 2:2975506‑M2/1‑88 (MQ=255) aGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGgca > 1:626528‑M2/1‑88 (MQ=255) gATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCAT < 1:2375134‑M1/91‑1 (MQ=255) gATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCAT < 1:4528234‑M1/91‑1 (MQ=255) ataataAGAAAGAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATA < 1:1769707‑M1/91‑1 (MQ=255) taataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAG > 2:1025717‑M1/1‑91 (MQ=255) taataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACAAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAG > 2:5564252‑M1/1‑91 (MQ=255) ataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGCACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCg > 2:5051079/1‑91 (MQ=255) ataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCg < 1:822993/91‑1 (MQ=255) ataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCg < 1:5534816/91‑1 (MQ=255) ataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCg > 1:4617096/1‑91 (MQ=255) ataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCg < 1:742597/91‑1 (MQ=255) ataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCg < 1:3401521/91‑1 (MQ=255) ataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCg > 1:3672632/1‑91 (MQ=255) ataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATATATTGATGTCGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCg > 2:5453888/1‑91 (MQ=255) taaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGt < 1:916649/91‑1 (MQ=255) taaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGt > 2:168509/1‑91 (MQ=255) taaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGt > 2:3651860/1‑91 (MQ=255) taaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGt < 2:4273926/91‑1 (MQ=255) aaaaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTg > 1:4435119/1‑91 (MQ=255) aaaaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTg < 1:4347051/91‑1 (MQ=255) aaaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCGGACGAATGTCGGCATAGCGTGa < 1:1422225/91‑1 (MQ=255) aaaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGa < 1:2048024/91‑1 (MQ=255) aaaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGa > 2:684565/1‑91 (MQ=255) aaaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGa > 2:1147271/1‑91 (MQ=255) aaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAg < 1:1215676‑M2/91‑2 (MQ=255) aaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAgc < 1:1882369‑M2/91‑3 (MQ=255) aTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAgcta > 2:394013‑M2/1‑87 (MQ=255) aTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAgcta > 1:5645771‑M2/1‑87 (MQ=255) tAGACGACGCATTTATGACGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAcgaatggtcggcttaatagctcacg > 2:2493402‑M2/1‑66 (MQ=255) tAGACGACGCATTAATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAgctat > 2:4380935‑M2/1‑86 (MQ=255) aGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAcgaatgtcggcttaatagctcacgct > 2:1565591‑M2/1‑65 (MQ=255) gacgacGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCCTAGCGTGAGCTATTa > 2:1993387/1‑91 (MQ=255) gacgacGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTa < 2:1351334/91‑1 (MQ=39) gacgacGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTa > 1:4133020/1‑91 (MQ=39) acgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACTCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTaa > 2:5285529/1‑91 (MQ=37) acgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTaa > 2:2394795/1‑91 (MQ=38) acgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTaa > 2:2842312/1‑91 (MQ=38) cgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAg > 2:1772141‑M2/1‑90 (MQ=255) cgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAg < 1:1321935‑M2/91‑2 (MQ=255) cgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAg < 1:482323‑M2/91‑2 (MQ=255) cgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAg > 1:2183670‑M2/1‑90 (MQ=255) cgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTACTGATGCTGAGCAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATCAAg < 2:1246154‑M2/91‑2 (MQ=255) gacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgc > 1:3917608‑M2/1‑89 (MQ=255) gacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgc > 1:1612936‑M2/1‑89 (MQ=255) gacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgc < 2:2586244‑M2/91‑3 (MQ=255) gacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgc > 2:3835388‑M2/1‑89 (MQ=255) acgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgcc < 2:536418‑M2/91‑4 (MQ=255) cgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAgccg > 2:4847662‑M2/1‑87 (MQ=255) ttATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCAt > 1:5067341/1‑91 (MQ=33) ttATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCAt > 2:4155216/1‑91 (MQ=34) ttATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCAt < 1:4892294/91‑1 (MQ=33) ttATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCAt > 2:2715817/1‑91 (MQ=34) ttATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCAt > 2:595402/1‑91 (MQ=34) tATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacatt > 1:4983578‑M2/1‑53 (MQ=255) aTGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTc > 1:2657802/1‑91 (MQ=34) aTGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTc > 2:34625/1‑91 (MQ=34) tGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCg < 1:2574111/91‑1 (MQ=33) tGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCg < 2:893716/91‑1 (MQ=34) gCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCgt > 2:318722/1‑90 (MQ=18) gCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGa < 1:3080071/91‑1 (MQ=34) gCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGa < 1:3016136/91‑1 (MQ=34) gCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGa < 2:2280658/91‑1 (MQ=33) gCCGAGAAAATTTAGTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACGAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGa < 1:4695289/91‑1 (MQ=16) gCCGAGAAAACTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGa < 1:5163951/91‑1 (MQ=21) cGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAca > 1:5427330‑M2/1‑89 (MQ=255) gagaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaa < 1:3190515‑M2/91‑4 (MQ=255) gagaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaa < 1:1005664‑M2/91‑4 (MQ=255) gagaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaa < 2:3081526‑M2/91‑4 (MQ=255) agaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaag < 2:5145341‑M2/91‑5 (MQ=255) agaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaag < 1:2758271‑M2/91‑5 (MQ=255) gaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaagt > 1:2942027‑M2/1‑86 (MQ=255) aaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGT‑‑gaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagttt > 2:211301‑M2/1‑41 (MQ=255) aaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaagttt > 2:3554165‑M2/1‑84 (MQ=255) aaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaagttt > 1:5266056‑M2/1‑84 (MQ=255) aaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaagtatt < 1:3797670‑M2/91‑9 (MQ=255) cTACACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGAGCGCTATTAAGCCGACCATTCGAcaagtttagttaagggttcttctcaacttcactaagt < 2:4486833‑M2/91‑38 (MQ=255) cAGACGAATGTCGgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttc < 2:1464157‑M2/91‑79 (MQ=255) | TGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAG > NC_012417/1896‑2073 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |