New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1265511 | 122 (0.670) | 9 (0.060) | 9/224 | NT | 7.3% | intergenic (+19/‑154) | femA_1/dprA | Aminoacyltransferase FemA/DNA processing protein DprA |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1265527 | 120 (0.740) | intergenic (+35/‑138) | femA_1/dprA | Aminoacyltransferase FemA/DNA processing protein DprA |
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
ATTTTGGTGTTCAACAATTTAAAAAGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGATTACAAAA > USA300TCH1516_ALE/1265371‑1265651 | ttttGGTGTTCAACAATTTAAAAAGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGgaaat < 2:794468/141‑1 (MQ=255) tttGGTGTTCAACAATTTAAAAAGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACTAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGgaaatt < 4:459751/141‑1 (MQ=255) ttGGTGTTCAACAATTTAAAAAGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGgaaattg > 3:558874/1‑141 (MQ=255) tGGTGTTCAACAATTTAAAAAGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGgaaattga < 1:1263249/141‑1 (MQ=255) gtTCAACAATTTAAAAAGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAGAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGgaaattgaaatt < 3:184120/141‑1 (MQ=255) tCAACAATTTAAAAAGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAAtttt < 2:299457/141‑1 (MQ=255) caacaaTTTAAAAAGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTa < 2:4215/141‑1 (MQ=255) caacaaTTTAAAAAGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTa < 3:450657/141‑1 (MQ=255) aaaTTTAAAAATGGCTTTAATGCACATGATGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACAAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAGCTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAAt < 4:458393/140‑1 (MQ=255) aTTTAAAAAGGGTTTTAAGGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGGTTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGACAgaatttaaactttcaa < 4:578257‑M1/141‑17 (MQ=255) ttAAAAAGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAgaatttaaaatttcaatt < 1:1131469‑M1/141‑19 (MQ=255) aaaaaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttc < 4:378026‑M2/141‑5 (MQ=255) aaaaaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttc < 2:980401‑M2/141‑5 (MQ=255) aaaaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttcc < 2:1293063‑M2/141‑6 (MQ=255) aaaaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttcc < 2:1138719‑M2/141‑6 (MQ=255) aaaaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttcc < 1:62936‑M2/141‑6 (MQ=255) aaaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttcca < 1:330632‑M2/141‑7 (MQ=255) aaaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttcca < 3:184897‑M2/141‑7 (MQ=255) aaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTTATTGGTGATTTCAGTAAACAAGTAAGACGAATTCTATATAAAGTTGCAAAACTTATTTATAAAGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAgaatttaaaatttcaatttccaa < 4:408844‑M1/141‑24 (MQ=255) aaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaa > 2:1130602‑M2/1‑134 (MQ=255) aaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaa > 3:213349‑M2/1‑134 (MQ=255) aGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTATATTAtttccaac < 4:359412‑M2/141‑9 (MQ=255) tttAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatact > 4:289584‑M2/1‑128 (MQ=255) ttAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactt > 2:541901‑M2/1‑127 (MQ=255) ttAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactt > 3:580927‑M2/1‑127 (MQ=255) atatgTTGAAGAATTACTTGGTGGTTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAATGTTTAATTATACAGTATGTTGGAAAgaatttaaaatttcaatttccaacatactttataatt < 2:1037594‑M1/139‑38 (MQ=255) acaTGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACtt < 4:125330/141‑1 (MQ=255) caTGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACttt > 1:808842/1‑141 (MQ=255) aTGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACtttt < 3:129547/141‑1 (MQ=255) gaagaaTTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGt > 1:439642/1‑141 (MQ=255) gaagaaTTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGt < 1:310482/141‑1 (MQ=255) gaaTTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAg < 1:2444/141‑1 (MQ=255) attaattGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTa < 3:435687/141‑1 (MQ=255) ttaattGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAt > 1:222523/1‑141 (MQ=255) taattGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAtt < 2:1327317/141‑1 (MQ=255) taattGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAtt > 3:330187/1‑141 (MQ=255) attGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAtttt < 1:1417213/141‑1 (MQ=255) attGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAtttt < 1:335838/141‑1 (MQ=255) ttGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAttttt > 4:212387/1‑141 (MQ=255) ggTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAgaatttaaaatttcaatttccaac > 2:1142873‑M1/1‑85 (MQ=255) ggTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAgaatttaaaatttcaatttccaac < 1:1142873‑M1/109‑25 (MQ=255) ggTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTAc < 1:301230/141‑1 (MQ=255) gATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTcc > 1:1010573/1‑141 (MQ=255) tttCTTCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGATGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCtt > 4:328214/1‑141 (MQ=255) tttCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCtt < 1:860037/141‑1 (MQ=255) tttCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCtt < 2:1189119/141‑1 (MQ=255) tcatcaAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTaa > 2:485514/1‑141 (MQ=255) caAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATa > 3:450157/1‑141 (MQ=255) caAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATa > 1:664330/1‑141 (MQ=255) caAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATa < 4:185652/141‑1 (MQ=255) aaaCCAGTAGGTGCAATTCGATATATGTTTTCAAATCCGAGTTGTAAGGTTTAATTAGAAAGGATTGTTGAGATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATaa < 1:1164572/141‑1 (MQ=255) aaaCCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATaa > 1:1136529/1‑141 (MQ=255) aGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTTTTTTAGTTTTTTTACTCCTTAAAATAACATTACAtt > 4:298640/1‑140 (MQ=255) aGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATc > 2:1389193/1‑141 (MQ=255) ccAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGAc < 2:1403927/141‑1 (MQ=255) cAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACa > 1:1147990/1‑141 (MQ=255) aaTTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACaa < 1:467894/141‑1 (MQ=255) aTTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTATTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATAACATCGACAAt > 2:750081/1‑141 (MQ=255) ttCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATg > 2:1093519/1‑141 (MQ=255) ataAATTTGCAAAACTTATCTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAATTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGATAATGTTTTTg > 2:1282431/1‑141 (MQ=255) aaTTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAGTAACATTACATCGACAAGGTTTTTGTAt > 1:1307294/1‑141 (MQ=255) ttGCAAAACTTATTTATAAGATTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAg < 3:359412/141‑1 (MQ=255) tGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGa < 2:1574372/141‑1 (MQ=255) gCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGaa > 1:262171/1‑141 (MQ=255) aCTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAGTGTTTTTGTATTAGAAATGTa < 2:971133/141‑1 (MQ=255) ttatttatAAGGCTAAATTATAAATTATGTTGAAAATTTAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTaaa < 2:1156881/141‑1 (MQ=255) tatttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTaaaa < 1:1507871/141‑1 (MQ=255) tttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACa < 2:1157570/141‑1 (MQ=255) ttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACaa > 1:478320/1‑141 (MQ=255) ttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACaa > 1:596255/1‑141 (MQ=255) tataAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACaaa > 2:382790/1‑141 (MQ=255) aGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTGTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATa > 1:328376/1‑141 (MQ=255) gTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGa > 1:1468617/1‑141 (MQ=255) ttATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGa > 2:942868/1‑141 (MQ=255) ttATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGa < 1:528255/141‑1 (MQ=255) ataAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcaccaattaattcttcaacatgtgcat < 1:1326710‑M2/141‑109 (MQ=255) ataAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGAtt > 4:245489/1‑141 (MQ=255) taAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcaccaattaattcttcaacatgtgcatt < 3:479860‑M2/141‑110 (MQ=255) taAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGAttt < 1:106207/141‑1 (MQ=255) aaaGTATGTTGGAAAgaatttaaaatttcaatttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcaccaattaattcttcaacatgtgcatta > 4:565712‑M1/1‑15 (MQ=255) aaaGTATGTTGGAAAgaatttaaaatttcaatttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcaccaattaattcttcaacatgtgcatta > 2:1083168‑M1/1‑15 (MQ=255) aaaGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGAtttt > 3:610041/1‑141 (MQ=255) aaaGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGAtttt > 2:619320/1‑141 (MQ=255) aaaGTATGATGGAAAgaatttaaaatttcaatttccaacataatttataattaaacattataaataagttttacaaatttatatagaattggtattactggtttaatgaaatcaccaaataattcttagaaatgttcatta > 4:572785‑M1/1‑15 (MQ=255) aaGTATGTTAAAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTATAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAAAAAAAAAAAAAAATAGAATATGATTTTg < 4:104745/141‑1 (MQ=255) aGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATATAATATGATTTTGt > 4:432887/1‑141 (MQ=255) gTATGTTGGAAAgaatttaaaatttcaatttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcaccaattaattcttcaacatgtgcattaaaa < 1:817909‑M1/141‑130 (MQ=255) gTATGTTGAAAATTGAAATTGTAAATTCTTTCCAACATACTGATCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTa < 2:1347233/141‑1 (MQ=255) aTGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTTTTTTATTTTTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATg > 4:288017/1‑141 (MQ=255) tGTTGGAAAgaatttaaaatttcaatttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcaccaattaattcttcaacatgtgcattaaaaccc < 2:581103‑M1/141‑133 (MQ=255) gTTGGAAAgaatttaaaatttcaatttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcaccaattaattcttcaacatgtgcattaaaaccct < 2:860037‑M1/141‑134 (MQ=255) gTTGGAAAgaatttaaaatttcaatttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcaccaattaattcttcaacatgtgcattaaaaccct > 3:588948‑M1/1‑8 (MQ=255) gTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGAt < 1:922725/141‑1 (MQ=255) ttGGAAAgaatttaaaatttcaatttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcaccaattaattcttcaacatgtgcattaaaaccctt < 3:446427‑M1/141‑135 (MQ=255) ggAAAgaatttaaaatttcaatttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcaccaattaattcttcaacatgtgcattaaaaccctttt < 3:119938‑M1/141‑137 (MQ=255) ggAAAgaatttaaaatttcaatttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcaccaattaattcttcaacatgtgcattaaaaccctttt > 4:185322‑M1/1‑5 (MQ=255) ggAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGATTAc > 1:670522/1‑141 (MQ=255) aagaatttaaaatttcaatttccaacatactttataattaaagcttataaataagttctgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcaccaattaattcttcaacatgtgcattaaaaccctttttaa < 1:572332‑M1/141‑140 (MQ=255) attgaaattTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGATTACaaaa > 1:919383/1‑141 (MQ=255) agaatttaaaatttcaatttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcaccaattaattcttcaacatgtgcattaaaaccctttttaaa < 2:1003765‑M1/141‑141 (MQ=255) | ATTTTGGTGTTCAACAATTTAAAAAGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGATTACAAAA > USA300TCH1516_ALE/1265371‑1265651 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |