New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1265511 | 122 (0.670) | 9 (0.060) | 9/224 | NT | 7.3% | intergenic (+19/‑154) | femA_1/dprA | Aminoacyltransferase FemA/DNA processing protein DprA |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1265527 | 120 (0.740) | intergenic (+35/‑138) | femA_1/dprA | Aminoacyltransferase FemA/DNA processing protein DprA |
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
ATTTAAAAAGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGATTACAAAAAGGAGTTGATTTAT > USA300TCH1516_ALE/1265387‑1265665 | aTTTAAAAAGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTc < 1:301602/141‑1 (MQ=255) ttAAAAAGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAGAACTTATTTATAAGCTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtt < 1:572332‑M2/141‑3 (MQ=255) aaaaaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttc < 2:980401‑M2/141‑5 (MQ=255) aaaaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttcc < 1:62936‑M2/141‑6 (MQ=255) aaaaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttcc > 4:185322‑M2/1‑136 (MQ=255) aaaaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttcc < 3:119938‑M2/141‑6 (MQ=255) aaaaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttcc < 2:1293063‑M2/141‑6 (MQ=255) aaaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttcca < 3:184897‑M2/141‑7 (MQ=255) aaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaa < 3:446427‑M2/141‑8 (MQ=255) aaGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaa > 2:1130602‑M2/1‑134 (MQ=255) aGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTATATTAtttccaac < 4:359412‑M2/141‑9 (MQ=255) aGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaac > 3:588948‑M2/1‑133 (MQ=255) aGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaac < 2:860037‑M2/141‑9 (MQ=255) gggTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaaca < 2:581103‑M2/141‑10 (MQ=255) tttAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatact > 4:289584‑M2/1‑128 (MQ=255) ttAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactt > 3:580927‑M2/1‑127 (MQ=255) tAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatacttt > 2:1083168‑M2/1‑126 (MQ=255) tAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatacttt > 4:565712‑M2/1‑126 (MQ=255) aTGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTCATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTc < 1:331385/141‑1 (MQ=255) gCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCAc < 3:178927/141‑1 (MQ=255) gCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCAc < 4:443125/141‑1 (MQ=255) acaTGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACtt < 4:125330/141‑1 (MQ=255) gaagaaTTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGt > 1:439642/1‑141 (MQ=255) gaagaaTTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGt < 1:310482/141‑1 (MQ=255) gaaTTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTaatacag > 1:920775/1‑136 (MQ=255) gaaTTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAg < 1:2444/141‑1 (MQ=255) ttaattGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAt > 1:222523/1‑141 (MQ=255) taattGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAtt > 3:330187/1‑141 (MQ=255) attGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAtttt < 1:335838/141‑1 (MQ=255) ttGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAttttt > 4:212387/1‑141 (MQ=255) ttGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAttttt > 2:349507/1‑141 (MQ=255) tGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTa < 1:1154355/141‑1 (MQ=255) ggTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCATTTTTTAAGTCAGTATTTTTAc > 1:1424814/1‑141 (MQ=255) ggTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTAc < 1:1360866/141‑1 (MQ=255) gATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTcc > 1:1010573/1‑141 (MQ=255) aTTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCt > 3:450212/1‑141 (MQ=255) aTTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCt < 2:632998/141‑1 (MQ=255) aTTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCt < 1:259257/141‑1 (MQ=255) tttCTTCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGATGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCtt > 4:328214/1‑141 (MQ=255) tttCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCtt < 2:1189119/141‑1 (MQ=255) tttCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCtt < 1:860037/141‑1 (MQ=255) tcatcaAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTaa > 2:485514/1‑141 (MQ=255) tcatcaAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTaa < 1:418928/141‑1 (MQ=255) catcaAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTaaa > 1:556415/1‑141 (MQ=255) atcaAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTaaaa > 3:540296/1‑141 (MQ=255) tcaAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGGTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAAt < 1:481253/141‑1 (MQ=255) aaaCCAGTAGGTGCAATTCGATATATGTTTTCAAATCCGAGTTGTAAGGTTTAATTAGAAAGGATTGTTGAGATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATaa < 1:1164572/141‑1 (MQ=255) aaaCCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATaa > 1:1136529/1‑141 (MQ=255) tAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTCAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTAcc > 1:865039/1‑140 (MQ=255) aGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTTTTTTAGTTTTTTTACTCCTTAAAATAACATTACAtt > 4:298640/1‑140 (MQ=255) aGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATc > 2:1389193/1‑141 (MQ=255) ccAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGAc < 2:1403927/141‑1 (MQ=255) ccAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGAc < 4:401369/141‑1 (MQ=255) ccAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGAc < 4:175942/141‑1 (MQ=255) aaTTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACaa < 1:467894/141‑1 (MQ=255) cTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGtt < 2:441864/141‑1 (MQ=255) cTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGtt < 2:696395/141‑1 (MQ=255) ataAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTg > 1:810882/1‑141 (MQ=255) ataAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTg < 2:114222/141‑1 (MQ=255) aaTTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAGTAACATTACATCGACAAGGTTTTTGTAt > 1:1307294/1‑141 (MQ=255) aTTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTAtt < 2:1328956/141‑1 (MQ=255) ttGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAg > 1:1306038/1‑141 (MQ=255) ttGCAAAACTTATTTATAAGATTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAg < 3:359412/141‑1 (MQ=255) tGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGa < 2:1574372/141‑1 (MQ=255) aCTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAGTGTTTTTGTATTAGAAATGTa < 2:971133/141‑1 (MQ=255) aCTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTa < 1:673399/141‑1 (MQ=255) ttatttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTaaa < 2:1306038/141‑1 (MQ=255) tatttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTaaaa < 1:1507871/141‑1 (MQ=255) tttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGTAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACa < 2:1156949/141‑1 (MQ=255) tttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACa < 2:1157570/141‑1 (MQ=255) ttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACaa > 2:1355864/1‑141 (MQ=255) ttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACaa > 1:478320/1‑141 (MQ=255) ttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACACACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACaa > 4:210213/1‑141 (MQ=255) tataAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACaaa > 2:382790/1‑141 (MQ=255) aGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTGTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATa > 1:328376/1‑141 (MQ=255) gTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGa > 1:1468617/1‑141 (MQ=255) aaTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactgtataattaaacattataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaaccaccaagtaattcttcaacatat < 2:1037594‑M2/141‑105 (MQ=255) ttATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGa > 2:942868/1‑141 (MQ=255) ataAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGAtt > 4:245489/1‑141 (MQ=255) ataAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGAtt < 3:408731/141‑1 (MQ=255) taAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGAttt < 1:106207/141‑1 (MQ=255) aaaGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGAtttt > 3:610041/1‑141 (MQ=255) aaGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTg < 3:444019/141‑1 (MQ=255) aaGTATGTTAAAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTATAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAAAAAAAAAAAAAAATAGAATATGATTTTg < 4:104745/141‑1 (MQ=255) aTGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTTTTTTATTTTTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATg > 4:288017/1‑141 (MQ=255) gTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcacc < 1:1142873‑M2/109‑86 (MQ=255) gTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcacc > 2:1142873‑M2/1‑24 (MQ=255) gTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGAt < 1:922725/141‑1 (MQ=255) ttGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactttataattaaactttataaataagttttgcaactttatatagaattcgtcttacttgtttactgaaatcaccaataaattcttcaacatgtgcattaaaaccctt < 4:408844‑M2/141‑119 (MQ=255) ggAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGATTAc > 1:670522/1‑141 (MQ=255) aattgaaattTTAAATTCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcaccaattaattcttcaacatgtgcattaaaaccctttttaa < 1:1131469‑M2/141‑124 (MQ=255) aattgaaattTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGATTACaaa < 1:284920/141‑1 (MQ=255) ttgaaagtTTAAATTCtgtccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaaccaccaattaattcttcaacatgtgccttaaaaccctttttaaat < 4:578257‑M2/141‑126 (MQ=255) gaaattTTAAATTCtttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattggtcttactggtttgatgaaatcaccaattaattcttcaacatgtgcattaaaaccctttttaaattg < 2:771603‑M2/141‑128 (MQ=255) attTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGATTACAAAAAGGAGt < 2:1002995/141‑1 (MQ=255) aaaTTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGATTACAAAAAGGAGTTGAtt > 3:596095/1‑141 (MQ=255) aTTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGATTACAAAAAGGAGTTGATTTa < 1:1628706/141‑1 (MQ=255) aTTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGATTACAAAAAGGAGTTGATTTa < 4:558874/141‑1 (MQ=255) aTTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACAGCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGATTACAAAAAGGAGTTGATTTa < 3:63756/141‑1 (MQ=255) ttCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGATTACAAAAAGGAGTTGATTTAt > 2:1492778/1‑141 (MQ=255) | ATTTAAAAAGGGTTTTAATGCACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGATTTTGTATGATTACAAAAAGGAGTTGATTTAT > USA300TCH1516_ALE/1265387‑1265665 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |