| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2850817 = | 230 (1.260) | 9 (0.060) | 7/226 | NT | 4.5% | intergenic (+16/+103) | pcp/USA300HOU_RS14605 | Pyrrolidone‑carboxylate peptidase/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2850866 = | 180 (1.110) | intergenic (+65/+54) | pcp/USA300HOU_RS14605 | Pyrrolidone‑carboxylate peptidase/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
AGGTCATTGGTAAACCCGATACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATG > USA300TCH1516_ALE/2850677‑2850957 | ggTCATTGGTAAACCCGATACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCacaaaca > 4:611376/1‑141 (MQ=255) ggTCATTGGTAAACCCGATACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCacaaaca > 4:102723/1‑141 (MQ=255) gTCATTGGTAAACCCGATACACCATCTATGCCATTAGAAAAGCTAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCacaaacaa > 2:576078/1‑141 (MQ=255) tCATTGGTAAACCCGATACACAATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCAcaaacaaa > 2:405884/1‑141 (MQ=255) agtaagtatactcatcattctaaatatagcatttattatttatacatttgtaaattttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCaaaa < 2:1331906‑M1/5‑1 (MQ=255) agtaagtatactcaacattataaatatagcatttattatttatacatttgtaaattttaagaagtaaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCaaaa > 2:213208‑M1/137‑141 (MQ=255) gtaagtatactcatcattctaaatatagcatttattatttatacatttgtaaattttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAg > 4:334779‑M1/136‑141 (MQ=255) ttGGTAAACCCGATACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGc > 2:539536/1‑141 (MQ=255) ggTAAACCCGATACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCAc > 1:683673/1‑141 (MQ=255) gtatattcatcattctaaatatatcaattattatttatacatttgtaaattttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCAcc > 2:263447‑M1/132‑141 (MQ=255) gtatactcatcattctaaatatagcatttattatttatacatttgtaaattttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCAcc > 1:1444803‑M1/132‑141 (MQ=255) gTAAACCCGATACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCAcc < 1:806879/141‑1 (MQ=255) atactcatcattctaaatatagcatttattatttatacatttgtaaattttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCacccc > 1:1571803‑M1/130‑140 (MQ=255) aaaCCCGATACACCATCTATGCCATTATAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCt < 2:1234329/141‑1 (MQ=255) aCCCGATACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTaa < 2:175867/141‑1 (MQ=255) cccGATACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAAt > 4:449180/1‑141 (MQ=255) ccGATACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCAccagaatg > 2:60118/1‑135 (MQ=255) aTACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGt > 2:1438317/1‑141 (MQ=255) aTACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGt > 3:248176/1‑141 (MQ=255) aTACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGt > 1:1545170/1‑141 (MQ=255) cacCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAg > 3:276786/1‑141 (MQ=255) ccATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGtt < 2:823591/141‑1 (MQ=255) aTCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTa > 2:1079286/1‑141 (MQ=255) aTGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTc > 2:707390/1‑141 (MQ=255) tGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCt < 1:456408/141‑1 (MQ=255) gCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTa > 3:59549/1‑141 (MQ=255) aTTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑t > 4:220356/1‑141 (MQ=255) gAAAAGAGAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCGATTGGAGCTATTTCTAATGATGTGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTGATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAg < 2:487538/141‑1 (MQ=255) aaaaGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAgg > 3:650877/1‑141 (MQ=255) aaaGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAggg < 3:21496/141‑1 (MQ=255) aaGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGt < 1:984419/141‑1 (MQ=255) aaGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGt > 2:1196970/1‑141 (MQ=255) aGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTg < 1:888558/141‑1 (MQ=255) gATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTc < 2:1150160/127‑1 (MQ=255) aGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCttt < 2:672245/141‑1 (MQ=255) aGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCttt < 2:1256366/141‑1 (MQ=255) gTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGCGGATTTACCACTAGACCAGGCAACACAGGAATCCATATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCtttt < 1:1403207/141‑1 (MQ=255) gTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCtttt < 3:508838/141‑1 (MQ=255) gTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCtttt > 1:1124362/1‑141 (MQ=255) acatttgtaaattttaggaagttaaaaaaagaagactaaacaatgtcgtttagctaaaatacatcattatagtaaaactgtataccaatcatcCAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCtttt > 1:163108‑M1/94‑141 (MQ=255) tGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTgg < 4:385443/141‑1 (MQ=255) gCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGga > 1:202396/1‑141 (MQ=255) gCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGga < 3:30928/141‑1 (MQ=255) tGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTgg > 3:368747/1‑141 (MQ=255) tGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTgg > 1:1131939/1‑141 (MQ=255) gACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTCATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACCACGGCATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGt > 2:1575207/1‑141 (MQ=255) cTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGtat < 4:276786/141‑1 (MQ=255) tGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGtata < 1:711364/141‑1 (MQ=255) cATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGttt < 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aGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACtat > 1:418422/1‑141 (MQ=255) cTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATaa > 1:484323/1‑141 (MQ=255) tATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAat < 4:177364/141‑1 (MQ=255) aTTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatg > 1:569575/1‑141 (MQ=255) ttCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAatgat < 3:65691/141‑1 (MQ=255) cTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGt > 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1:1088690/141‑1 (MQ=255) cacaACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGtcttct > 4:131140/1‑141 (MQ=255) acaACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTcttctt > 1:334724/1‑141 (MQ=255) caACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCttt > 3:517740/1‑141 (MQ=255) caACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCttt > 2:1094878/1‑141 (MQ=255) caACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCttt < 1:1186525/141‑1 (MQ=255) 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4:496669/3‑141 (MQ=255) tGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAAtt < 1:374241/141‑1 (MQ=255) tGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAAtt < 1:1148812/141‑1 (MQ=255) gCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAAttt < 2:2822/141‑1 (MQ=255) gCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAAttt < 1:773660/141‑1 (MQ=255) cacaAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTa < 2:1525780/141‑1 (MQ=255) acaaacaaAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTACCTTCCTAAAATTTAc < 2:99544/141‑1 (MQ=255) CAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATg < 1:1656622‑M1/141‑1 (MQ=255) | AGGTCATTGGTAAACCCGATACACCATCTATGCCATTAGAAAAGATAGTTGCAGGTTTGACTGCAGCCATTGAAGCTATTTCTAATGATGAGGATTTACACCTAGCCCTGGGCACAACGGAATAGTTATAAGTGCACAAACAAAAGCACCCTAATTTGTTAGTTTAAGTCTAAC‑‑TTTAGGGTGCTTTTGGATGATTGGTATACAGTTTTACTATAATGATGTATTTTAGCTAAACGACATTGTTTAGTCTTCTTTTTTTAACTTCCTAAAATTTACAAATG > USA300TCH1516_ALE/2850677‑2850957 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |