New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 798 total aligned reads displayed.
TGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCAGGAATTTAGAAAAACATGTGGAAGTTTTAAAGGATT > NC_012417/1040‑1320 | tatgataCAAATGCTTTAATTAGTAACAAAAAAATAAGACAAACTCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACATCTTTGTATTATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCt < 2:55411/135‑1 (MQ=255) tatgACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTAt < 2:237942/139‑1 (MQ=255) gtgACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATc < 1:216883/141‑1 (MQ=255) gtgACAAATGCTGTATGTAGTGACACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATc < 2:120758/141‑1 (MQ=255) gtgAAAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATc < 2:268720/141‑1 (MQ=255) tgACAAAGGCTGTATGTCGTCTCACAAACATAAAACAAAGGCAATATAAGGAGACACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCa < 1:41874/141‑1 (MQ=21) aaaTGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCAtttt < 2:204087/141‑1 (MQ=255) aaaGGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCAtttt < 2:87006/141‑1 (MQ=255) cTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTACAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCAAGACCTATCATTTTTGact > 1:53263/1‑139 (MQ=255) cTGGATGGAGTGTCACAAAAAAAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAAt < 2:273872/141‑1 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(MQ=255) aCCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAACAATCTCCTGGAGGAATTTAGAAAAACa > 1:127638/1‑141 (MQ=21) aCCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCAGTAATTTAGAAAAACa > 2:26511/1‑141 (MQ=255) aCCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCAGGAATTTAGAAAAACa < 1:98041/141‑1 (MQ=255) cccTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGAAGTAATTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCAGGAATTTAGAAAAACAtg > 1:70832/1‑141 (MQ=255) cccTGGAATTTCGGGCTTTGCCAGACCTAGCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCATACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTATAAAAAAAAAAAAAAAAACGCCCTGCAGGAATTTAGAAAAACAtg < 2:34959/141‑1 (MQ=18) cTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCAGGAGTTTAGAAAAACAtgtg > 1:276661/1‑141 (MQ=255) ggAATTTCTGGCTTTGCCAGGACTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCAGGAATTTAGAAAAACATGTGGa < 2:135176/141‑1 (MQ=255) ggAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCAGGAATTTAGAAAAACATGTGGa < 1:87972/141‑1 (MQ=255) acaaTTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCAGGAATTTAGAAAAACATGTGGa < 1:233279/139‑1 (MQ=255) aTTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTTTTTTTTTTTTAATTCTCCTTATGGTCTTACGGAGTTTTTATAGTACAATTAAATATTCTCGATTTTTGATAAAAATAGCCCTGCAGGATTTTAGTATAACATGTGGAAGt > 2:229980/1‑141 (MQ=255) ttCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGTTTTATTTCTAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTTATAAAAATCGCCCTGCAGGATTTTAGAAAAATAGTTGGAAGttt > 2:233490/1‑141 (MQ=255) tCTTGCTTTGCCAGACCTATAATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAGAAACGCCCTGCAGGAATTTAGAAAAACATGTGGAAGtttt < 2:207949/141‑1 (MQ=255) cTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCAGGAATTTAGAAAAACATGTGGAAGTTTTa > 1:22377/1‑141 (MQ=255) cTTTGCCAGAGCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCAGGAATTTAGAAAAACATGTGGAAGTTTTAAAgg < 2:142520/141‑1 (MQ=255) cTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCAGGAATTTAGAAAAACATGTGGAAGTTTTAAAgg > 2:189631/1‑141 (MQ=255) tGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCAGGAATTTAGAAAAACATGTGGAAGTTTTAAAGGAtt < 2:11729/141‑1 (MQ=255) | TGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTTTGATAAAAAACGCCCTGCAGGAATTTAGAAAAACATGTGGAAGTTTTAAAGGATT > NC_012417/1040‑1320 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |