New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2085296 = | 302 (0.830) | 25 (0.080) | 20/232 | NT | 8.2% | coding (173/201 nt) | hlb_1 | Phospholipase C |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2128343 | 294 (0.900) | coding (1/825 nt) | hlb_2 | Phospholipase C |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TGTAATTTTAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/2085449‑2085296 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccagtttggatacaTAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGTAG < USA300TCH1516_ALE/2128343‑2128204 TGTAATTTTAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTC < 1:1290627/141‑1 TGTAATTTTAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTC > 2:3438231/1‑141 TGTAATTTTAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTC < 1:1620722/141‑1 GTAATTTTAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCC < 1:357354/141‑1 GTAATTTTAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTAAATGATAATTAATTTTATGTTAAAAGTCTCC > 2:2142408/1‑141 GTAATTTTAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATATTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCC > 2:1524468/1‑141 TAATTTTAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCA > 2:2404652/1‑141 aagTTTAATTGTAAAGTCCCTAAAAAATCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATGTATAATGATAAAGTTATAAACCTTTATATTATGCGGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAG < 2:1266129/138‑1 AATTTTAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGGCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAG < 2:2377594/141‑1 ATTTTAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGT > 2:626601/1‑141 ATTTTAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGT < 1:2504785/141‑1 ATTTTAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGT < 1:2109338/141‑1 TTTTAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAACGTCTCCAGTT > 1:355712/1‑141 TTTTAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTT > 1:1300417/1‑141 TAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGG < 2:1397280/141‑1 TAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGATATTAGTGAATATGAAAAAATTATAATCCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGG < 1:4377046/141‑1 AAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGA < 1:329596/141‑1 AAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTGTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGA < 2:1327818/141‑1 AAATTTAAAGTCCCTAAAAAGACCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTTATAATGATAAAGCTATAAACCCTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGA < 1:155645/141‑1 AAATTTAAAGGCCCTGAAAAGTCCATAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGA < 2:27032/141‑1 AAATTAAAAGTCCCTAAGAAGTTCGGAGAGTGTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGA < 1:801128/141‑1 AATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTACAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATACACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTTCAGTTTGGAT > 2:723303/1‑141 AATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGTGTTATTATTTATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGAT < 1:742965/141‑1 AATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACCTTTAGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGAT > 2:1331656/1‑141 ATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTATAAGTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATA > 2:3365828/1‑141 TTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATAC < 2:2778388/141‑1 TTAAAGTCCCTAAAAAGTAACTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACA < 2:3005129/141‑1 TAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACAT > 1:4262201/1‑141 TCCCTAAAAAGCTCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAA < 1:756655/141‑1 CCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGGAACC > 2:2422810/1‑141 CCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACC > 1:1179242/1‑141 CCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGACGCGATTTTGGATACATAGAAACC > 2:1766404/1‑141 CCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAAC < 1:1733945/141‑1 CCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACA < 2:865219/141‑1 CCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACA > 1:4209609/1‑141 CCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACA < 2:2246618/141‑1 CTAAAATATTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAG < 2:3701767/141‑1 TAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGT > 2:2594386/1‑141 ATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACACCAGTATTTATTGG > 1:1184967/1‑141 TTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTACCGACAGTATTTATTGGGTT < 2:1613531/141‑1 GATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAA > 1:242507/1‑141 AAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTA < 2:432849/141‑1 GATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAA > 1:3767039/1‑141 GCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTT < 1:2857993/141‑1 TGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGT < 2:2506964/141‑1 TTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCgt > 1:2124293/1‑139 GATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCAT > 2:3514860/1‑141 TGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAGTGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCT > 1:728373/1‑141 TGTTAAAAGTCTCCAGTTTGCATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCT > 1:1921084/1‑141 AAGTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAA > 1:379847/1‑141 gcCTCCAGTTTGGATATATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTGAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATG < 2:3972583/139‑1 GTCTCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATG > 1:1745791/1‑141 cgtggTTGGATACATAGAATCGTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGTGTCCCTTAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAA < 2:500549/136‑1 CCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAA < 1:1386406/141‑1 CCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAA < 1:2142408/141‑1 CCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGGTTTTTTGTCCTCTTCTTTAAATTTTTCTTCTAACAATTGAGAA > 2:2412027/1‑141 CAGTTTGGATAGATAGAAACCTTGTAACAATAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAAT < 2:3971244/141‑1 AGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATA > 1:3838610/1‑141 AGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATA > 1:2974981/1‑141 GTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATAC > 1:1143902/1‑141 GTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATAC < 2:2226755/141‑1 GTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATAC < 2:2339908/141‑1 TTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGGAGGTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAGATTTGAGTTGTTTTTTTGTCCGCTTCATTAAGTTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACA > 2:2943835/1‑141 TTTGGATACAGAGAAACCTTGCAACAACAGTATTTATTTGGTTTGTAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGATAATACA < 2:1734757/141‑1 TTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGCGAATACAt > 2:2057329/1‑140 TTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACAC < 1:3154515/141‑1 TTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTACCTAAATTACATGGTTTCTAGATCATGAGGGTTGTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACAC > 1:842614/1‑141 TTGGAGACATAGAAATCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCGCTAATGGGTTCCTATATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCCTTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACAC < 2:73172/141‑1 tgggaACATAGAGACCTGGTAACAAAAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGAGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACG < 2:296000/136‑1 TGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACACATGAGAATACACG > 2:3575632/1‑141 TGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACG > 1:2152789/1‑141 TGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACG > 1:2704894/1‑141 TGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACG < 2:3548978/141‑1 tGATACCTAGAAAACTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTCGTAGTCCCTAATGGGTCTCTAAATTACATACTTTCTAAATTTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGG < 2:3230750/140‑1 GGATACATAGAAAGCTGTTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGG < 2:2074999/141‑1 GGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGG > 1:3217719/1‑141 GGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAAGTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGG < 2:864736/141‑1 GGATACATAGAAAACTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCTCTAATGGGTCCCTATATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGG < 2:1572773/141‑1 GATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTACTCGGTACCCATGATACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGA < 1:2078225/141‑1 GATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTTTAACAAATGAGAATACACGGA > 2:3452087/1‑141 GATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGATAATACACtgt > 2:3158588/1‑138 GATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGA < 2:1508627/141‑1 TACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATG > 1:3497650/1‑141 cCATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGT < 1:3191749/140‑1 ACATAGATACTTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCTTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGT < 2:2617213/141‑1 ACATAGAAACTTTGTAACAACAGTATTTATTGTGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGT < 2:2778392/141‑1 ACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTATATTCTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGT < 2:1348422/141‑1 ACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGT < 2:1849754/141‑1 ACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGT < 2:1756289/141‑1 ACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGT < 2:2786373/141‑1 ACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTGTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGT < 2:355712/141‑1 ACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGCCTCTAAATTACATACTTTCTAAAAGTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGT < 1:1676656/141‑1 ACATAGAAACCTTGGAACAACAGTATTTAGTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGT < 2:13872/141‑1 CATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCTTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAATTGTGAATACACGTATGTA > 2:3222952/1‑141 CATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTACATTTTTCTTCTAACAAATGACACTACACGGTTGTt > 2:3669175/1‑140 CATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGTg > 1:19526/1‑140 ATAGAAACCTTGTAACAGCAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGTAG < 1:2612692/141‑1 ATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGTAG < 1:239422/141‑1 ATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAAGTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGTAG < 1:1439471/141‑1 ATAGAAACCTTGGAACAACAGTATTTATTGGGTGTGGAGTCCCTGATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGTAG < 2:3728840/141‑1 TGTAATTTTAAATTTAAAGTCCCTAAAAAGTCCCTAAAATTTTATTTTATATGAGGTATTATTGATAATGATAAAGTTATAAACCTTGATATTATGCTGTTTTACTTTTTGAATGATAAGTAATTTTATGTTAAAAGTCTCCAGTTTGGATACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/2085449‑2085296 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccagtttggatacaTAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGTAG < USA300TCH1516_ALE/2128343‑2128204 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |