New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 422 total aligned reads displayed.
AAAAAAAGTTGCAACACTTGCATTAGCAAATTTATTATTAGTTGGTGCACTTACTGACAATAGTGCCAAAGCCGAATCTAAGAAAGATGATACTGATTTGAAGTTAGTTAGTCATAACGTTTATATGTTATCGACCGTTTTGTATCCAAACTGGAGACTTTTAACATAAAATTACTTATCATTCAAAAAGTAAAACAGCATAATATCAAGGTTTATAACTTTATCATTATCAATAATACCTCATATAAAATAAAATTTTAGGGACTTTTTAGGGACTTTAA > USA300TCH1516_ALE/2085156‑2085436 | ctacatccgtgtattctcatttgttagaagaaaaatttaatgaagaggacaaaaaaacatctaaaattttagaaagtatgtagtttaggaacccattagggactccaaacacaataaatactgttgttacaaggtttctat < 2:2924049‑M1/1‑1 (MQ=255) ctacatccgtgtattctcatttgttagaagaaaaatttaatgaagaggacaaaaaaacaactaaaattttagaaagtatgtaatttagggacccattagggactccaaacccaataaatactgctgttacaaggtttctat < 1:2612692‑M1/1‑1 (MQ=255) ctacatccgtgtattctcatttgttagaagaaaaatttaatgaagaggacaaaaaaacaactaaaattttagaaagtatgtaatttagggacccatcagggactccacacccaataaatactgttgttccaaggtttctat < 2:3728840‑M1/1‑1 (MQ=255) agaaaaaGTTGCAACACTTGCATTAGCAAATTTATTATTAGTTGGTGCACTTACTGACAATAGTGCCAAAGCCGAATCTAAGAAAGATGATACTGATTTGAAGTTAGTTAGTCATAACGTTTATATGTTATCGACCGtttt < 2:659732/139‑1 (MQ=255) 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2:3555737/1‑141 (MQ=255) TGTATCCAAACTGGAGACTTTTAACATAAAATTACTTATCATTCAAAAAGTAAAACAGCATAATATCAAGGTTTATAACTTTATCATTATCAATAATACCTCATATAAAATAAAATTTTAGTTACTTTTTAGGGACtttaa < 2:3005129‑M1/141‑1 (MQ=255) TGTATCCAAACTGGAGACTTTTAACATAAAATTACTTATCATTCAAAAAGTAAAACAGCATAATATCAAGGTTTATAACTTTATCATTATCAATAATACCTCATATAAAATAAAATTTTAGGGACTTTTTAGGGACtttaa > 1:2163915‑M1/1‑141 (MQ=255) | AAAAAAAGTTGCAACACTTGCATTAGCAAATTTATTATTAGTTGGTGCACTTACTGACAATAGTGCCAAAGCCGAATCTAAGAAAGATGATACTGATTTGAAGTTAGTTAGTCATAACGTTTATATGTTATCGACCGTTTTGTATCCAAACTGGAGACTTTTAACATAAAATTACTTATCATTCAAAAAGTAAAACAGCATAATATCAAGGTTTATAACTTTATCATTATCAATAATACCTCATATAAAATAAAATTTTAGGGACTTTTTAGGGACTTTAA > USA300TCH1516_ALE/2085156‑2085436 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |