New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_012417 | = 1982 | 955 (0.880) | 6 (0.010) | 4/244 | NT | 0.66% | intergenic (+215/+111) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_012417 | = 2027 | 895 (0.870) | intergenic (+260/+66) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
GTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACTT‑‑‑G‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012417/1837‑1982 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaactt‑‑‑gTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTT < NC_012417/2027‑1889 GTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGGAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑A > 2:383723/1‑140 GTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGACACTTTATTGATGTTGAGAAGACCCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑A > 2:187159/1‑140 GTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑A > 1:923/1‑140 GTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑A > 1:640941/1‑140 GTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑A > 2:548560/1‑140 GTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑A > 1:46070/1‑140 GTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑A < 1:454098/140‑1 GTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑A > 1:365012/1‑140 tttCTTACTTTATGGTTTTCTAGAAGGATGATGCGTTTGAGGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATAAAGATAATAAAAAAGAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AA < 2:348438/137‑1 TTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATTCTTTTGACGTGATGGTAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAACAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AA > 2:677212/1‑140 TTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTTTCATGAAGATAATAAAACATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACTCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AA > 2:575112/1‑140 TTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AA < 1:228733/140‑1 TTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AA < 2:210493/140‑1 TTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AA < 1:411955/140‑1 TTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AA < 1:341788/140‑1 TTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGACTATCATGAAGATAATGAAAAATAGAGGACGCAGGTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAAAAACCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AA > 2:455459/1‑140 TTGCTTACTTTTTGGTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AA < 1:579047/140‑1 TTGCTTACTTGTTGGTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGAAGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AA < 2:172720/140‑1 TTGCTTACTATTTGTCTTTCTATAAAGATGATGCTTGTGACGAAAGGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AA < 2:694473/140‑1 TTGCTTAATTTTTGTTTTTATATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AA < 2:405726/140‑1 tggTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACTAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAA < 2:669640/137‑1 TGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGTTGGTGAAGGCGACGAGATGGAAGTAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAACATTTATTGATGTTGAGAAAAACACTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAA > 2:345088/1‑140 TGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGTAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAA < 1:388354/140‑1 TGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAA < 1:363565/140‑1 TGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAA < 1:20648/140‑1 TGCTTACTTTCTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGACGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAA < 1:248076/140‑1 GCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGGTGCTTGTGACGAGATGGAAGTAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGACCACTTAAC‑‑T‑‑‑‑GAAg > 2:36199/1‑139 GCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCTTTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCGTTAAC‑‑T‑‑‑‑TAAC > 2:606912/1‑140 GCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGCGAAAATTTATTGATCTTGAGAAGAACCGTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAAC > 2:575157/1‑140 GCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAACATTTATTGATGTTGAGAAGATGCCTTATC‑‑C‑‑‑‑AAAC > 1:189981/1‑140 GCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAAC > 2:331672/1‑140 GCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAAC < 1:442748/140‑1 GCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAAC > 1:300409/1‑140 GCTTACTTTTTGTTTGTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAAC < 1:337274/140‑1 GCTTACTTATTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAAC < 1:266584/140‑1 CTTACTTTTTGTTTTTCTATAAATATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGATAAATATGATTATTAGGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAGAATTTATTGATGTTGATAAGAACTCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACT > 2:407617/1‑140 CTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGTAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACT > 2:540020/1‑140 CTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATTCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACT > 1:321641/1‑140 CTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACT > 1:278983/1‑140 CTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAAACCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACT > 1:136368/1‑140 TTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGCAGACCCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACTT > 1:520629/1‑140 TTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGACGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACTT > 2:454303/1‑140 TTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACTT > 2:431509/1‑140 cacgTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTGTTGACGAGAGGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACTT‑‑‑G < 1:238913/136‑1 TACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACTT‑‑‑G < 1:494874/140‑1 TACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATATTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACTT‑‑‑G > 1:491130/1‑140 TACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTATGACGAGATGTAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACTT‑‑‑G < 1:25161/140‑1 TTTGTTTTTCTATAAAGATGTTGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGATGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGACACCTGAAC‑‑T‑‑‑‑GAACTT‑‑‑GACGAc > 2:722832/1‑139 TTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGATAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCTGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACTT‑‑‑Gaagcc > 2:432774/1‑135 AGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACTTGCAGACGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCG < 2:321263/140‑1 GAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTG < 2:175380/140‑1 AAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGC < 1:465199/140‑1 ATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACAATCCCAAAACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCT < 2:580661/140‑1 caaagcgT‑‑‑GTCGAGTGGGCGGCGTAAGAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATC < 1:261366/133‑1 agaatTT‑‑‑GTCGAATGTCCGGCTTGCTAGTTCTCGCTATGCCGACATTCGGCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAAGGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCA < 2:696988/135‑1 acAACAT‑‑‑GTCGAATAGTTGGTCCAACACCGCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCA > 2:747522/3‑140 AAACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACCTTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCAT < 1:64346/140‑1 AAACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCAT < 2:417512/140‑1 AAACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCAT > 1:598285/1‑140 AAACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCAT < 1:735269/140‑1 AAACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGACATAAATGTGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATCATAATCAT > 1:492508/1‑140 tACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCGTGATAGCTCACGCTATGCCTACATTCGTCTTCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATA < 2:640236/139‑1 atCTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATA < 2:20151/138‑1 AACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTACTAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATA > 1:664352/1‑140 AACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATA > 2:22259/1‑140 AACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAACGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATATTTTATTATTTTCATTATCATCAga > 2:136158/1‑138 AACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAAGAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATA < 2:443369/140‑1 gCTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATAT < 2:210045/139‑1 accT‑‑‑GTTGAATGGTCCGCTTGATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATAT < 2:583374/137‑1 ACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTCATAGCTCGCGCTATGCCGACAGTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATAT < 1:685141/140‑1 ACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTACGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGCTAATCATAT > 1:742228/1‑140 ACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATTTTCGTGATAATCTTAT > 2:319997/1‑140 ACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCTTGATAATCATct > 2:565331/1‑138 ACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATAT > 1:630987/1‑140 ACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATAT > 1:511524/1‑140 ACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATAT > 2:254554/1‑140 ACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATAT > 1:425783/1‑140 ACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATAT < 1:422929/140‑1 ACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATAT > 1:296944/1‑140 ACTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATAT > 1:200085/1‑140 ACTC‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATAT < 2:242624/140‑1 CTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTCTTTTTTATTGTCTTCATTATAACCATATT > 2:521348/1‑140 CTT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATT > 1:563761/1‑140 TT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGTCGACATTCTTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTT < 1:367112/140‑1 TT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGTCATAAATGCGTCCTCTGTTTTTTATTATCTTCTTGCTACTCATTTTT > 1:12906/1‑140 TT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTT < 1:964/140‑1 TT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTT < 2:667928/140‑1 TT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTT < 1:303623/140‑1 TT‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTT < 1:228730/140‑1 T‑‑‑GTCTAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTGAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTT < 1:526632/140‑1 T‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTTAGTGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTT > 1:107906/1‑140 T‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTT < 2:585149/140‑1 T‑‑‑GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTT < 1:572540/140‑1 GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTTAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTATATTATTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTT > 2:614630/1‑140 GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTT < 2:321613/140‑1 GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTT > 2:143288/1‑140 GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTT > 1:97935/1‑140 GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTT > 1:558490/1‑140 GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTT < 2:9230/140‑1 GTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATACCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATCTTTTT > 1:607804/1‑140 GTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAAC‑‑T‑‑‑‑AAACTT‑‑‑G‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012417/1837‑1982 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaactt‑‑‑gTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTT < NC_012417/2027‑1889 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |