New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 1921 total aligned reads displayed.
TTTTTTTATTCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATC > NC_012417/1815‑2093 | tttttttATTCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGA < 2:255704‑M1/140‑1 (MQ=255) tttttttATTCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTCTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAACAACTAGACGCCGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGA < 2:613835‑M1/140‑1 (MQ=255) tgtttttatTTCTATTGGTGTTGTTTCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGGCGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGA < 2:478135‑M1/138‑1 (MQ=255) ttATTCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATATTg > 1:372806/1‑140 (MQ=255) 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tATTGAcgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaat > 1:258772‑M1/1‑6 (MQ=255) tATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaata < 2:514341/140‑1 (MQ=31) caTTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaata < 2:342401/139‑1 (MQ=14) aTTGAcgttgagcctcgtaacccttaacaatcccaacacttttcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatg < 2:461394‑M1/140‑136 (MQ=255) aTTGAcgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacaccaacaaatattctcggcataaatg > 2:688191‑M1/1‑5 (MQ=255) aTTGAcgttgagcctcggaaaccttaacaatcccaaaacttgtcgactggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggatcttctcaccatcaatacatttcctcggcatacatg > 1:318099‑M1/1‑5 (MQ=255) ttGAcgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcatcaatgc > 2:43890‑M1/1‑4 (MQ=255) ttGAcgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgc > 1:683814‑M1/1‑4 (MQ=255) acgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccg < 2:234284‑M1/72‑72 (MQ=255) | TTTTTTTATTCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATC > NC_012417/1815‑2093 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |