BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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gtcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaacttttggttaaaaaataaaatggacaagataaa                                                                                                                                            <  2:113229‑M1/1‑1 (MQ=255)

gtcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaa                                                                                                                                            <  1:372354‑M1/1‑1 (MQ=255)

 tcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaa                                                                                                                                           <  2:284380‑M1/2‑1 (MQ=255)

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   acacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttgccgtccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaaaa                                                                                                                                         >  1:154788‑M1/138‑141 (MQ=255)

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            cccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAACGTTATtgc                                                                                                                                <  1:545090‑M1/13‑2 (MQ=255)

            cccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGa                                                                                                                                >  2:527917‑M1/129‑141 (MQ=255)

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              catgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACt                                                                                                                              <  1:620032‑M1/15‑1 (MQ=255)

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                tgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTa                                                                                                                            <  2:81306‑M1/17‑1 (MQ=255)

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                                                                         tagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAAc                                                                   >  1:633523‑M1/68‑141 (MQ=255)

                                                                         tagagtagaacgttgccaggcagtttttgaatcaaattttggttaaaaaataaattggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAAc                                                                   <  1:429966‑M1/74‑1 (MQ=255)

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                                                                              tagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTGGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCTGTAAGAAATTTTAACATGGAAAACTTAAt                                                              <  1:300900‑M1/79‑1 (MQ=255)

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                                                                                       gccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGGCGGTACGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACaatatt                                                     <  2:228260‑M1/88‑2 (MQ=255)

                                                                                       acaaaacaaCTCAACTTAAGAAAGAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATg                                                     >  2:476189/1‑141 (MQ=255)

                                                                                        caaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGt                                                    >  1:15678/1‑141 (MQ=255)

                                                                                          aggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAACGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCa                                                  <  1:432453‑M1/91‑1 (MQ=255)

                                                                                          aaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCa                                                  <  1:207542/141‑1 (MQ=255)

                                                                                           aacaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCaa                                                 >  2:553216/1‑141 (MQ=255)

                                                                                           aacaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCaa                                                 >  2:478911/1‑141 (MQ=255)

                                                                                              agttttttaatcaaattttagttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGt                                              >  1:493397‑M1/47‑141 (MQ=255)

                                                                                               acacaactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGtt                                             <  1:607402/138‑1 (MQ=255)

                                                                                                 tttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGCCAATATGTCAACGTTaa                                           >  2:80829‑M1/44‑141 (MQ=255)

                                                                                                 tcaactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTAACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTATCGGTTAGAAAAATAAACATTGAAAACGGAATTACAATATGCAAACGTTaa                                           >  2:434735/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                  ttttaaacaaaagttggttaaaaaagaaaaatgacaagataaAAAAAGTTATGGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCTGTTAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAt                                          >  2:476288‑M1/43‑141 (MQ=255)

                                                                                                   tttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAtt                                         >  1:214260‑M1/42‑141 (MQ=255)

                                                                                                   tttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAtt                                         >  2:320389‑M1/42‑141 (MQ=255)

                                                                                                   tttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAtt                                         >  1:284380‑M1/42‑141 (MQ=255)

                                                                                                   tttaatcaaagtatggttaaaaaataaaaaggaaaaaataaAAAAAGTTATTGAATTAAAAGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATgtcaacgaaaaaa                                         >  2:29110‑M1/42‑135 (MQ=255)

                                                                                                   aactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAtt                                         <  1:234625/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                     ctTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTcc                                       >  2:601561/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                     ctTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTcc                                       <  1:306288/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                       atcaaattgtggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa                                     >  2:659391‑M1/38‑141 (MQ=255)

                                                                                                       aacaaattttggttaaaaaacaaaatggctaagataaAAAAAGTTAGTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa                                     >  1:595554‑M1/38‑141 (MQ=255)

                                                                                                        tcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaa                                    >  2:208788‑M1/37‑141 (MQ=255)

                                                                                                         caaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTTATAAAAGGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTCAAACCGGAATGACCAGATGTCAACGTTAATTCCaaaa                                   <  1:123660‑M1/106‑1 (MQ=255)

                                                                                                         caaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaa                                   <  1:577310‑M1/106‑1 (MQ=255)

                                                                                                         caaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaa                                   <  1:108398‑M1/106‑1 (MQ=255)

                                                                                                           aaaTAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaaa                                 <  1:142717/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                             aTAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTATTGTGGATAAGAAAAAAGAACGTTGAGAAATGAATGAGAATATGTCAAAGTTAATTCCTAAAAACg                               >  2:461025/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                              tttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGGCTTAAATTTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGt                              >  2:272058‑M1/31‑141 (MQ=255)

                                                                                                                 cTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTCATACAGATATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGCACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAc                           >  2:440441/1‑141 (MQ=37)

                                                                                                                     aaTTACTAACGAAAATTATTTTTACATAATTATTGACTTAAATGTGAATAAAATGCATGACTAACGCTTGTCATTAAGAAAAAGGTACATACAGATGTGAAGGACAATACTTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACtata                       <  2:58233/141‑1 (MQ=16)

                                                                                                                            aaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTCATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACa                >  1:4333‑M1/17‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                tggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACa            >  1:81306‑M1/13‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                tggacaagataaAAAAAGTTATTGACGTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACa            >  1:406168‑M1/13‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                  gacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAATCGTAACTATAAGTTACAAACatt          >  2:476224‑M1/11‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                      aattTTAAAAAGTTATTGATTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTAGGTAATTTAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTAttt      <  1:154531/141‑1 (MQ=21)

                                                                                                                                      aattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTAttt      >  1:244057/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                         aaaAAAAAGTTATTGACTTAAATTTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGACAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGt   >  1:560427‑M1/4‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                          aaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTa  <  2:235491‑M1/139‑1 (MQ=255)

AGGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTA  >  USA300TCH1516_ALE/512480‑512758

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 22 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.