| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 1566 total aligned reads displayed.
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2:955907/1‑141 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGa > 1:758881/1‑141 (MQ=255) ccGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCa > 2:161670/1‑141 (MQ=255) cgcccAGTCGACAAGTTTTGGGAGTGTTAAGGGCAACGAGGAACGGTGTCGAGAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAATCCATAGTAGCTGCGATTCCAg < 1:573477/138‑1 (MQ=255) caCCATTCGACAAGTTTTGGGACTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGCATTTAAGATTACATTGTACATCCCTCCAAACCATAGCAGCTGCCATTCCAGc < 2:534185/140‑1 (MQ=25) aCCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCt > 1:892241/1‑141 (MQ=255) cATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAg > 2:509528/1‑141 (MQ=255) aTTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAgg > 2:283953/1‑141 (MQ=255) ttCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGt < 1:353955/141‑1 (MQ=255) tCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGtt > 1:500023/1‑141 (MQ=255) cGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGTATTTAAGATTACATTGTAAATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGttt > 1:945713/1‑141 (MQ=255) gACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTAAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTc < 1:109941/141‑1 (MQ=255) tttTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATACCTAGCGT‑AAGGGTGAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTa < 1:804411‑M2/138‑1 (MQ=255) ttTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTAt < 2:355389‑M2/139‑1 (MQ=255) ttTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTAt > 1:391505‑M2/3‑141 (MQ=255) ttTGGGATTGTTAAGGGGTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGTATTTAAGATTACATTGGACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTAt < 2:300036‑M2/139‑1 (MQ=255) tTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATAGGAATAAATAGTATCTAAAGA‑AACCCGTATTTAAGATTACATGGTACATCATTCGAGAGCATAGTAGGTGGGAGTCCAGCTAGGTTTGCTTTTATc > 2:1044219‑M2/2‑141 (MQ=255) tGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATcc < 2:417614/141‑1 (MQ=255) | ATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGT‑AACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCC > NC_012417/1895‑2175 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |