BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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*	?	USA300TCH1516_ALE	895785 =	59 (0.650)	27 (0.340)	15/226	NT	33.1%	coding (806/822 nt)	metQ_2	Methionine‑binding lipoprotein MetQ
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Only 100 of 108 total aligned reads displayed.

GGTTGTTTTCAAGGGCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCATGCGTGCTAC  >  USA300TCH1516_ALE/909601‑909880

ggTTGTTTTCAAGGGGAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAt                                                                                                                                             >  2:393602‑M2/1‑140 (MQ=255)

ggTTGTTTTCAAGGGCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCGGGCTAAt                                                                                                                                             <  2:15293‑M2/141‑2 (MQ=255)

ggTTGTTTTCAAGGGCAAAAAAAGGGCATAATTCTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAt                                                                                                                                             >  2:1057843‑M2/1‑140 (MQ=255)

ggTTGTTATCAAGGCCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCACGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTGTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGCTAATCTGGCTAAt                                                                                                                                             <  2:367719‑M2/141‑2 (MQ=255)

ggTTGCTTTCAAGGGCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAt                                                                                                                                             >  2:803102‑M2/1‑140 (MQ=255)

  ttgttTTCAAGGGCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAACTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAtta                                                                                                                                           <  1:1042500‑M2/141‑4 (MQ=255)

     ttttCAAGGGCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattc                                                                                                                                        <  2:535290‑M2/141‑7 (MQ=255)

         aaaGGGAAAAAACAGGGCATAATTTATAAACAAAGGGCAAGGATATGAATAATAAATTACCTTGAAAACTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTCGAATGACCTTGAACTTCCTTGATAATTTGGCTAATTATTcaaac                                                                                                                                    <  2:837676/140‑5 (MQ=255)

           aGGGCAAAAAAAGGGCATAATTTTTAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACGATGTTGTGATTGCCCTTGAACTTCCGTGATAATCTGGCTAAttattcgtgcta                                                                                                                                  <  1:705925‑M2/141‑13 (MQ=255)

           aGGGCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCCAAttattcctgcta                                                                                                                                  >  1:721788‑M2/1‑129 (MQ=255)

           aGGGAAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgcta                                                                                                                                  >  2:88505‑M2/1‑129 (MQ=255)

              gCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaat                                                                                                                               >  2:40219‑M2/1‑126 (MQ=255)

               aaaaaaaagGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaata                                                                                                                              <  2:131152‑M2/140‑17 (MQ=255)

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                 aaaaaaGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAACATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCtaaataaa                                                                                                                            >  1:979680/1‑141 (MQ=255)

                 aaaaaaGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCtaaataaa                                                                                                                            >  1:28502/1‑141 (MQ=255)

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                      aGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaa                                                                                                                       <  2:12238‑M2/141‑24 (MQ=255)

                      aGGGCATAAATTTGAAGCAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAAGTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCACTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCata                                                                                                                       <  1:107371/141‑1 (MQ=255)

                       gggCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAACTAAATCatat                                                                                                                      >  2:910576/1‑141 (MQ=255)

                       gggCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCatat                                                                                                                      >  1:773345/1‑141 (MQ=255)

                       gggCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCatat                                                                                                                      >  1:773395/1‑141 (MQ=255)

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                                     aaCAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTCTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTaa                                                                                                        <  2:823517/141‑1 (MQ=255)

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                                          aGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGa                                                                                                   <  1:983722/141‑1 (MQ=255)

                                           gggCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaatcacctttat                                                                                                  <  1:103161‑M2/141‑45 (MQ=255)

                                           gggCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaataaaataaaaataccctttaa                                                                                                  <  2:938499‑M2/141‑45 (MQ=255)

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                                            ggCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAACTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATg                                                                                                 <  2:1042500/141‑1 (MQ=255)

                                             gCAAGGGTATGAATAATACATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGt                                                                                                <  2:664474/141‑1 (MQ=255)

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                                              cAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGtt                                                                                               >  2:350628/1‑141 (MQ=255)

                                               aaGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataatccccattaattaaaaataccctgtaataac                                                                                              <  2:546314‑M2/141‑49 (MQ=255)

                                               aaGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttattaac                                                                                              <  1:391788‑M2/141‑49 (MQ=255)

                                                      tGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATGATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCt                                                                                       <  1:281655/141‑1 (MQ=255)

                                                         ataattAATTATCTTGAGAATGTTATAAATGCATATATAACCATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCtttt                                                                                    <  2:772641/141‑1 (MQ=255)

                                                         ataataAATTATCTTGATAATTTTATAAATGCATATATAAAACTGTCATGCCCGACCCTGCTATTGCTTGATAATCTGGCTAATTTTTTCTGTTAAATTATTCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCtttt                                                                                    <  2:1062463/141‑1 (MQ=255)

                                                         ataataAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCtttt                                                                                    <  2:806177/141‑1 (MQ=255)

                                                         agaataaATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCtttt                                                                                    <  2:28361/139‑1 (MQ=255)

                                                             taaATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTtttaat                                                                                <  1:304544/141‑1 (MQ=255)

                                                             taaATTAACTTGAAAAGTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTtttaat                                                                                <  1:183256/141‑1 (MQ=255)

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                                                                   aTCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTCCatcttcgcgcaagataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttt                                                                          <  1:255555‑M2/141‑69 (MQ=255)

                                                                    tCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGTCCTTGAACTTCCTTGATAATCGGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCGTATTAATGGCTGAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAGCa                                                                         >  1:1058467/1‑141 (MQ=255)

                                                                    tCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACa                                                                         >  2:474013/1‑141 (MQ=255)

                                                                      ttGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAgg                                                                       <  1:144476/141‑1 (MQ=255)

                                                                       tGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttggg                                                                      <  1:876774‑M2/141‑73 (MQ=255)

                                                                       tGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggcgttattttgttg                                                                      <  1:641015‑M2/141‑73 (MQ=255)

                                                                       tGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCGGGGCTTTTTAAGTTAAACAGGt                                                                      >  1:834951/1‑141 (MQ=255)

                                                                         aaaaTTTTATAAATGCATATATAACGATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTACACAATCTTGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTAt                                                                    >  1:479920/1‑141 (MQ=255)

                                                                           aaTTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTAttt                                                                  >  2:330691/1‑141 (MQ=255)

                                                                             ttttATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTtat                                                                <  1:594371/141‑1 (MQ=255)

                                                                                      tgtagacataACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATAttt                                                       <  1:333223/134‑1 (MQ=255)

                                                                                          tatataACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATTGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGa                                                   <  1:634121/141‑1 (MQ=255)

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                                                                                          tatataACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGa                                                   <  2:236626/141‑1 (MQ=255)

                                                                                           atataACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGaa                                                  <  2:637902/141‑1 (MQ=255)

                                                                                           atataACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGATCGGTTACTTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGaa                                                  <  1:1038223/141‑1 (MQ=255)

                                                                                            tataACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAAt                                                 <  2:409305/141‑1 (MQ=255)

                                                                                             ataACAAGGTGTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAAGCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTTAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATg                                                <  1:37397/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                aaaatgTTTTGACTGCCCTTGAACTTCCGTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaa                                             >  2:247870‑M2/3‑44 (MQ=255)

                                                                                                aCAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATCTTTAGGACTgcgt                                             >  1:763789/1‑138 (MQ=255)

                                                                                                  aaTGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaa                                           >  1:267032‑M2/1‑42 (MQ=255)

                                                                                                     tttttGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTa                                        <  2:589878/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                        ttGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATACTCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTa                                     <  1:375711/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                        ttGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGGATGAGATGCTATTa                                     >  1:420400/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                        ttGATTGCCCTTGAACTTCCTTCCGGAGCTGGCGAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTa                                     >  1:535677/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                         tGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTAc                                    >  2:566195/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                         tGATTGCCCTTGAACTTCCTTGAGAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGATGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTAc                                    >  2:791321/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                             tGCCCTTGAACTTCCTTTATAATCTGGCTAATGATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCGATTACTGAt                                <  2:129517/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                             tGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGAt                                <  1:177722/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                              gtccttGAACTCCCCTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaattacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatat                               >  2:379795‑M2/3‑30 (MQ=255)

                                                                                                              gCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatat                               >  2:385106‑M2/1‑30 (MQ=255)

                                                                                                              gCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCAAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatat                               >  1:230556‑M2/1‑30 (MQ=255)

                                                                                                                ccTTTAACTGTCTGGATAATCTGGCCACttagtcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaccgattaaggggttattcttgtggtattgaaaagaaaaaagggcaccaaaggggcagtatatgc                             >  2:337282‑M2/1‑28 (MQ=255)

                                                                                                                ccTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATaaa                             >  2:1028353/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                 cTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAg                            <  2:883167/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                   tGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatatgcaaa                          <  1:782082‑M2/141‑117 (MQ=255)

                                                                                                                        ttCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGTCTCAGTAACATGATTTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGGTATTTAGGTATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATc                     >  1:151208/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                        ttCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGCTGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATGTTTAGGGATGAGATGCTATTACGGCTAAAGTAAAATc                     >  1:151603/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                             tGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattatataaacataacctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatatgcaaattattgaatt                <  1:757611‑M2/141‑127 (MQ=255)

                                                                                                                             tGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaatagaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatatgcaaattatcgaatt                <  1:758207‑M2/141‑127 (MQ=255)

                                                                                                                             tGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttattttttttgttttttaaataaaaaagggcaaaaaaggggcggtatatgtaaattatcgaatt                <  2:819598‑M2/141‑127 (MQ=255)

                                                                                                                             tGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatatgcaaattatcgaatt                <  2:483025‑M2/141‑127 (MQ=255)

                                                                                                                             tGATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatatgcaaattatcgaatt                <  2:819493‑M2/141‑127 (MQ=255)

                                                                                                                              gATAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggccccaaaggggcagtatatgcaaattatcgaattt               <  2:76502‑M2/141‑128 (MQ=255)

                                                                                                                              gATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGATATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTatat               >  2:174048/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                tAATCTGGCTAAttattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggaattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatatgcaaattatcgaatttta             <  1:108960‑M2/141‑130 (MQ=255)

                                                                                                                                    cTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAACTCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATatgcatgg         >  2:1060960/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                    cTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATatgcatgc         <  1:953431/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                     tGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCATGCg        >  2:53790/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                      ggCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCATGCGt       >  1:280512/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                      ggCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCATGCGt       <  2:163317/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                         tAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTAAAACATGTATTCAAATCACATGGAGTAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCATGCGTGCt    <  1:258936/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                           attattcctgctaaataataccaattaaataaaaataccctttaataacaacgattaaggggttatttttgtggtattgaaaataaaaaagggcacaaaaggggcagtatatgcaaattatcgaattttaaacaaaaaaat  >  1:1048767‑M2/1‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                           attattCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGGTGGTCTTTTTAATTTAAACAGGTCTTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCAAGGGTGcgtc  >  2:98212/1‑138 (MQ=255)

                                                                                                                                           attattCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCATGCGTGCTAc  <  1:1014441/141‑1 (MQ=255)

GGTTGTTTTCAAGGGCAAAAAAAGGGCATAATTTTGAAACAAAGGGCAAGGGTATGAATAATAAATTATCTTGAAAATTTTATAAATGCATATATAACAATGTTTTGATTGCCCTTGAACTTCCTTGATAATCTGGCTAATTATTCCTGCTAAATAAATCATATTAATGGCTCAGTAACGTGATGTTGCTGGGCTTTTTAATTTAAACAGGTATTTATATGATATTTAGGAATGAGATGCTATTACGGATAAAGTAAAATCCTATATGCATGCGTGCTAC  >  USA300TCH1516_ALE/909601‑909880

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 13 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.