| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1697752 = | 74 (0.820) | 5 (0.060) | 5/228 | NT | 7.9% | intergenic (+8/+37) | rpsT/USA300HOU_RS08460 | 30S ribosomal protein S20/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1697788 = | 51 (0.640) | intergenic (+44/+1) | rpsT/USA300HOU_RS08460 | 30S ribosomal protein S20/hypothetical protein | |||||
GCAGTTAAGTTAGTAGACAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATTCATCAAGTTGATAATGTCTTACTTGTCCTAA > USA300TCH1516_ALE/1697649‑1697923 | gCAGTTAAGTTAGTAGACAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTAttttt > 1:570492/1‑141 (MQ=255)gCAGTTAAGTTAGTAGACAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTAttttt < 1:337941/141‑1 (MQ=255)gCAGTTAAGTGAGTAGACAAAGCTGCTCAAAGTAATGGAATACATTCAAACTAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAGTAATCTTTTTAAATTAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTAttttt < 1:772685/141‑1 (MQ=255) agttaagttaGTAGACAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTta > 1:689150/1‑141 (MQ=255) gctaatttaATAGACAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTtat < 2:1008384/139‑1 (MQ=255) ttaagttaGTAGACAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTtata < 1:510383/141‑1 (MQ=255) ttaagttaGTAGACAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTtata < 1:883072/141‑1 (MQ=255) ttaagttaGTAGAAAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTtata < 1:453676/141‑1 (MQ=255) aagttaGTAGACAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATaaa < 2:446382/141‑1 (MQ=255) aagttaGTAGACAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATaaa > 1:446382/1‑141 (MQ=255) gACTAAGCGGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAgaatg < 2:109401/141‑1 (MQ=255) aaCAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACAGTCAAACAAAGCTGTCCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTCTATTTTTTATAAAGATAgaatg < 2:808278/140‑1 (MQ=255) aCAAAGCTTCTAAAAGTAATTTAGTAAATTCAAACAAAGCTGACCGTATCAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAgaatga < 1:847705/141‑1 (MQ=255) aCAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAgaatga < 2:744729/141‑1 (MQ=255) aCAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAgaatga < 1:894981/141‑1 (MQ=255) aCAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAAGAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAgaatga < 1:810391/141‑1 (MQ=255) cAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAgaatgaa > 2:641746/1‑141 (MQ=255) aaaaGCTGCACAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAgaatgaa < 2:113119/140‑1 (MQ=255) aGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAATTAAGTAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTGGAACTTTTATTTTTTATAAATATGTAATGaataa > 2:667662/1‑141 (MQ=255) gctCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTcc > 1:160969/1‑141 (MQ=255) gctCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATAAATAATTcc > 1:867461/1‑141 (MQ=255) tCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAg < 2:788154/141‑1 (MQ=255) aaaGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTa < 2:787263/141‑1 (MQ=255) aaGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTAt > 1:584748/1‑141 (MQ=255) aaGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTACAGTAt > 2:54110/1‑141 (MQ=255) aTTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACt < 2:180953/141‑1 (MQ=255) aTTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACt < 1:653211/141‑1 (MQ=255) aTTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACt < 2:53103/141‑1 (MQ=255) aTTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAACAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAGTAATTCCAGTATTGACt > 2:739692/1‑141 (MQ=255) aTTTAATACATGCAAACAAACCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACt < 1:726889/141‑1 (MQ=255) tAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCCCAATTCATGACTGTAAATAAATAATCTTATTAAATAAAAGATCATGAACAGGCTTGAACTGTGATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTACAGTATTAACTGtt > 2:530822/1‑141 (MQ=255) aaacttaaatcatcatatatggtaatacagtgaatactggaattattcattctatctttataaaAAATAAAAGTTCAAGCATGCGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAATATAGAATGAATAATTCCGGTATGAACTGTTTa < 1:536300‑M1/77‑1 (MQ=255) aaacttaaatcatcatatatggataaacagttactactggaattattcattctatctttataaaaaataaaagttcaagctcatgcttgaccttttatttTTTATAAAGATAGAATGCATAATTCCAGTATTAATTTTTTa > 2:80833‑M2/101‑141 (MQ=255) aaacttaaatcatcatatatggataaacagttaatactggaattattcattctatctttataaaaaataaaagttcaagcgcatgcttgaacttttatttTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTa < 1:502180‑M2/41‑1 (MQ=255) aaatcatcatatatggataaacagttaatactggaattattcattctatctttataaaaaataaaagttcaagcgcatgcttgaacttttatttTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCata < 2:647456‑M2/47‑1 (MQ=255) caaaGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATatga > 2:969406/1‑141 (MQ=255) aaGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATatgatg < 1:728268/141‑1 (MQ=255) tatggataaacagttaatactggaattattcattctatctttataaaAAATAAAAGTTCAAGCATGCGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGAttt < 2:647456‑M1/94‑1 (MQ=255) 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1:764923/1‑141 (MQ=255) acaATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGt > 1:328820/1‑141 (MQ=255) aTTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTc < 2:438947/141‑1 (MQ=255) ttAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCTTGTATGAGGATTTAAGTTTATAATCAGTTTcc > 1:312235/1‑141 (MQ=255) ttAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTcc > 1:771355/1‑141 (MQ=255) aTGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGca > 1:929671/1‑141 (MQ=255) aTGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGca < 2:494540/141‑1 (MQ=255) tGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGcac > 1:1003143/1‑141 (MQ=255) gACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTCAAGTTTATAATCAGTTTCCGcaca < 2:508696/141‑1 (MQ=255) cTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAg < 1:1006766/141‑1 (MQ=255) taaataaTCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCtat > 1:559781/1‑141 (MQ=255) taaataaTCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCAAAAGCATCtat > 1:516779/1‑141 (MQ=255) aatactCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTataa < 1:1034885/141‑1 (MQ=255) aataatCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTataa < 1:647444/141‑1 (MQ=255) ataatCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAGTGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAACATCTataat > 1:1109613/1‑141 (MQ=255) ataatCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTataat > 2:330056/1‑141 (MQ=255) aatCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAatat < 2:48828/141‑1 (MQ=255) aatCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAatat < 2:240790/141‑1 (MQ=255) aatCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACGTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAatat < 2:233913/141‑1 (MQ=255) taaataaaAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTATAACAAGATAGAATAAATAATACAATCTAAAACTTTTTAGCAATATATAATAATTTATGTTTTTATGTATTTTCCTAACAATCATTGATAATTTTCaataat > 2:809597/1‑141 (MQ=255) aagaaaaGGTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTTTAAAGATAGAATGAATAGTTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATtc < 2:109702/138‑1 (MQ=255) AATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATtc > 2:29689‑M1/1‑141 (MQ=255) TAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATtcat > 1:931509‑M1/1‑141 (MQ=255) AAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATtcatc > 2:914398‑M1/1‑141 (MQ=255) aagttcaagcatgcgcttgaacttttatttTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATTCATCaa > 1:955031‑M2/31‑141 (MQ=255) TTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATTCATCAAGtt > 2:977096‑M1/1‑141 (MQ=255) TCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATTCATCAAGTTg > 1:897865‑M1/1‑141 (MQ=255) TCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATTCATCAAGTTg < 1:829322‑M1/141‑1 (MQ=255) gcATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTATCCGCAGAAGCATCTATAATATTCAATAATTCATCAAGTTGATAATg < 2:717536/141‑1 (MQ=255) ttGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATGCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTTTAATATTCTATAAGTCATCAAGTTGATAATGTc < 2:47572/140‑1 (MQ=255) aTGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATTCATCAAGTTGATAATGTc > 1:624986/1‑141 (MQ=255) tGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATTCATCAAGTTGATAATGTCt < 2:635462/141‑1 (MQ=255) tGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATTCATCAAGTTGATAATGTCt < 2:903689/141‑1 (MQ=255) tGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATCAACTGTTGATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATTCATCAAGTTGATAATGTCt < 1:816743/141‑1 (MQ=255) gcttgaacttttatttTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATCATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATTCATCAAGTTGATAATGTCtt < 1:617699‑M2/125‑1 (MQ=255) gcttcaacttttatttTTTATAAAGATAGAATTAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATTCATCAAGTTGATAATGTCtt < 1:537701‑M2/125‑1 (MQ=255) ttgacctttttgttTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATTCATCAAGTTGATAATGTCTTAc < 2:771355‑M2/127‑1 (MQ=255) ttgaacttttatttTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTAAATAATTAATCAAGTTGATAATGTCTTAc > 2:737678‑M2/15‑141 (MQ=255) tatttTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCGTATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATTCATCATGTTGATATTGTCTTATTTGTCCTaa > 2:55015‑M2/6‑141 (MQ=255) | GCAGTTAAGTTAGTAGACAAAGCTGCTCAAAGTAATTTAATACATTCAAACAAAGCTGACCGTATTAAATCACAATTAATGACTGCAAATAAATAATCTTTTTAAATAAAAGTTCAAGCGCATGCTTGAACTTTTATTTTTTATAAAGATAGAATGAATAATTCCAGTATTAACTGTTTATCCATATATGATGATTTAAGTTTATAATCAGTTTCCGCACAAGCATCTATAATATTCAATAATTCATCAAGTTGATAATGTCTTACTTGTCCTAA > USA300TCH1516_ALE/1697649‑1697923 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |