New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000731 | 2264 = | 388 (1.070) | 10 (0.010) | 4/238 | NT | 1.5% | intergenic (+44/+124) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0003/USA300HOU_pUSA300HOUMR0004 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_012417 | 2053 = | 958 (0.820) | intergenic (+286/+40) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TTTGCAGCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000731/2414‑2264 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gttaagggttcCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTT > NC_012417/2053‑2192 TTTGCAGCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑G > 1:250382/1‑141 TTGCAGCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GT < 2:784734/141‑1 TTGCAGCGGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GT < 2:56496/141‑1 TGCAGCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACACTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCCAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTT > 2:175594/1‑141 GCAGCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTCTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTA < 2:874487/141‑1 CAGCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAA < 1:428314/141‑1 CAGCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAA > 1:289561/1‑141 cGCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACAGTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAG < 1:490493/140‑1 AGCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGGGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAG > 1:265568/1‑141 AGCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCTTTAACAATCCCGAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAG > 2:851773/1‑141 AGCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAG > 1:92388/1‑141 AGCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAG < 1:514773/141‑1 AGCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAG > 2:631494/1‑141 gcgGGATGCGCTGGAGGGTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTGGAGCCTCGTAACCCTTAACAACCCCAAAACTTGTGGAATGGTGGGGTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGG < 2:779144/138‑1 GCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGG < 1:562624/141‑1 GCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGG > 1:70953/1‑141 GCTGGATCCTCTGTAGGTTTATTTTATTCCAATTGTTTTATCGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTTTGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGG < 1:426265/141‑1 CTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGG < 2:831048/141‑1 CTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTACTCCAATTGTTTTATTGACATTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGG > 1:516431/1‑141 gGGATGCTCGGTAGGTTGGTTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGT < 1:412329/140‑1 TGGATGCTCTTTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATACGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGT < 1:417337/141‑1 TGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGTTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGT < 2:248706/141‑1 TGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGT < 1:860313/141‑1 TGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGT > 1:652370/1‑141 TGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGT > 2:421427/1‑141 ggcTGCTTTGTAGGTTGATTTTGTTCCAATTGTTGTATTGACGTTGAGCCTCGGTACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGTCATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTACGGGTT < 2:775100/138‑1 GGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTT > 1:231633/1‑141 GGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTT < 1:508737/141‑1 GATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTC > 2:603462/1‑141 GATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTC < 1:194067/141‑1 TGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTactt > 2:662928/1‑137 TTTTATTCCAATGGTTTTATCGACGTTGAGGCGCGGAACCCTTAACAATCCCAAACCTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAAT < 2:597265/141‑1 TAACAATCCCAAAACTTTTCGAAGGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTC‑‑‑TTCTCAACATCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGA < 2:332280/141‑1 TCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGTAATAAATAGTATCTAAAGTGACCCGTATTTA > 1:791743/1‑141 CCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACA > 2:370278/1‑141 TCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTATTGGA‑ATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGT > 1:451178/1‑141 TCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGT > 2:608883/1‑141 TCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGT > 2:706390/1‑141 ATGGTCGGCTGAATAGCTCCCTCTAAGCCGACATTCGTTTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTCCGAGGCACAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCG < 2:185804/141‑1 GGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCC > 1:897107/1‑141 GTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTT < 1:934113/141‑1 GTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTT > 1:364267/1‑141 ggAAGGGTTCCGAGGCCCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGAGTATCTGAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTGCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTA < 1:311736/139‑1 TTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGTTTTCCTTTTATCCCAATTTTA < 1:482220/141‑1 TAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAG < 2:481316/141‑1 TAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAG > 1:752712/1‑141 TAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAG > 1:169391/1‑141 TAAGGGTCCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAG < 1:132351/141‑1 agGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGC < 2:464592/139‑1 AAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCCATTGGAATGAATAGGATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGC < 1:257268/141‑1 AAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTACCCTTGCAGTCGACTTCATTCCAAACCATATTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGC < 1:221120/141‑1 AAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAACCCATCGTAGCGGCTATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGC > 1:405563/1‑141 AAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGC < 1:929595/141‑1 AAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATACCAATTTTAGC > 2:913476/1‑141 AAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATATAAAGTTACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGCAACCATAGTAGCGGCGATTCCAGCTAGGTGTCCTTTTATCCCAATTTTAGC > 1:315088/1‑141 AAGGGTTCCGAAGCTCAATGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAACGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGC < 1:475615/141‑1 AAGGCTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTGCGAAACCATAGTAGCTGCGATGCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGC < 1:191183/141‑1 AGGGTTCCGAGTCTAAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTTGCT < 2:261373/141‑1 AGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATCAAGCAATTTTAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT < 1:358006/141‑1 AGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTCGCT > 1:592700/1‑141 AGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT > 1:335395/1‑141 AGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT < 2:334031/141‑1 AGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT < 2:604550/141‑1 AGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT > 2:208242/1‑141 AGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT > 2:892343/1‑141 AGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT < 1:893707/141‑1 AGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAAAAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTCCCTCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT < 2:756788/141‑1 AGGGTTCCGAGGCTCAACGGCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT < 1:893697/141‑1 AGGGTTCCGAGGCTAAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCT < 2:629753/141‑1 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTGTCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTA > 1:535421/1‑141 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTCTCCCCATTTTAGCTA > 1:126288/1‑141 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTA > 2:703119/1‑141 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTA > 1:582023/1‑141 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTA < 1:375523/141‑1 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTA < 1:230303/141‑1 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTA < 1:535674/141‑1 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTA < 1:796655/141‑1 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTA > 1:849143/1‑141 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTA < 2:140053/141‑1 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATCTTAGCTA > 1:56872/1‑141 GGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGGATGTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTA > 1:429405/1‑141 GGGTGCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTA < 1:161811/141‑1 GGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCACTTTTAGCTAA > 2:143574/1‑141 GGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAA > 2:600909/1‑141 GGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAA > 1:381426/1‑141 GGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAA > 1:530440/1‑141 GGTTCCGAGGCTCAACGTAAATAAATCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAA < 1:480902/141‑1 GTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTcaa < 2:245080/141‑4 TCCGAAGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACGCGTATTTAAGCTTACATTGTACATCCTGCGAAACCATAGTAGCTGCGATCCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCCACTTTAGCTATTTT > 2:272925/1‑141 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGGCCCAATAGTGGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTT > 1:446605/1‑141 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTT < 1:530434/141‑1 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTT > 1:349730/1‑141 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTT < 1:83371/141‑1 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTT > 1:145745/1‑141 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTT > 1:375055/1‑141 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTT > 1:403349/1‑141 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTT > 2:334500/1‑141 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTACCCCAATTTTAGCTAATTTT < 1:499641/141‑1 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATGCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTACTTTT > 2:782879/1‑141 CCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGAGTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTT > 1:812021/1‑141 TTTGCAGCTGGATGCTCTGTAGGTTGATTTTATTCCAATTGTTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGT‑TT‑‑‑‑A‑‑GTTAAGGGTTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000731/2414‑2264 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gttaagggttcCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTT > NC_012417/2053‑2192 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |