| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | = 17001 | NA (NA) | 4 (0.010) | 4/248 | NT | 4.2% | coding (61/675 nt) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0021 | IS431 mec transposase |
| ? | CP000731 | = 17016 | 95 (0.260) | coding (46/675 nt) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0021 | IS431 mec transposase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAA > CP000731/16872‑17141 | tcttcCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGG < 2:354907‑M2/141‑1 (MQ=255) tttccAAATTTGATATAAAATTGGGGCATTTTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCTCGTTTTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGC > 1:300073‑M2/2‑141 (MQ=255) cttcCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGC < 1:250459‑M2/141‑1 (MQ=255) cttcCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGC < 1:454210‑M2/141‑1 (MQ=255) cttcCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGC < 1:368111‑M2/141‑1 (MQ=255) ttcCGAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCGTGAACCCGACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGAGAGTAGCCAACGGCT < 1:674793‑M2/141‑1 (MQ=255) ttcCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTAAATGATGAAAGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATTACGATAGCCCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGtt < 2:140467‑M2/141‑3 (MQ=255) tcCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTA < 2:172854‑M2/141‑1 (MQ=255) tcCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTA > 1:373535‑M2/1‑141 (MQ=255) tcCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGAAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCACTTAATGTTTCAAATATGTATCGATAGCTCGATGCATATCTTAGATAATAGCCAAGGGCTA < 2:680928‑M2/141‑1 (MQ=255) ccAAGTTTGATAGAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGTTCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATACCACGACAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTAC < 1:664469‑M2/141‑1 (MQ=255) ccAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTAC < 1:754304‑M2/141‑1 (MQ=255) ccAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTAC < 2:678079‑M2/141‑1 (MQ=255) ccAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTAC < 2:753713‑M2/141‑1 (MQ=255) ccAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTAC < 2:791364‑M2/141‑1 (MQ=255) tttcTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCGTTGGCTACtatctaagatatgcattgagctatcg > 1:550634‑M2/2‑115 (MQ=255) gaACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCGTTGGTTACtatctaagatatgctttgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgt > 2:502082‑M2/1‑82 (MQ=255) ttACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCGTTGGCTACtatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgt > 2:725163‑M2/1‑76 (MQ=255) aTAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAcct < 2:832143/141‑1 (MQ=11) aTAGCTCAATGCAAAACTTAGATAGTAACCAACCGCTACAGTCATAACATCCTTGTTAAATTGTTTAAATCTGAAATAGTGCATACAGAAGACACCATTTTGTTAAAATTATATTATAAATACAACTTTGCAACAGAAcct < 1:826037/141‑1 (MQ=11) agttCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTAAAGTGATGACATCCTTGTTAAATTGTTTAGATCTGAAATAGTTCATACAGTAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAcctcc < 2:395228/138‑1 (MQ=11) aGCTCATTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCGTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAcctcc < 2:643192/141‑1 (MQ=17) aGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGCAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAcctcc > 1:26698/1‑141 (MQ=17) aGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTTTTTTTATTATATTATAAATTCAACTTTGCAATAGAAcctcc > 2:866317/1‑141 (MQ=11) aGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAcctcc < 2:705057/141‑1 (MQ=32) aGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAcctcc < 2:924214/141‑1 (MQ=32) aGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAcctcc < 1:102642/141‑1 (MQ=32) aGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTGGCAACAGAAcctcc < 2:574199/141‑1 (MQ=17) gCTCAATGCATAACTAAGATAGTAGCCAACGGCTACAGAGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAGGACTCCTTTTTGTGAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCCACAGCAcctcct > 2:415360/1‑141 (MQ=11) cTCAATGCATATCTTCGCTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTa < 1:346611/141‑1 (MQ=18) cTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAACTTGTTTATATCGTAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTa < 1:218683/141‑1 (MQ=16) cTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTa > 2:549448/1‑141 (MQ=33) cTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTa > 1:136349/1‑141 (MQ=33) cTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTa > 1:745401/1‑141 (MQ=33) cTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTAAGCTTTGCAACAGAACCTCCTa > 2:408529/1‑141 (MQ=18) cTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCGACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTa > 1:674998/1‑141 (MQ=18) tCAAGGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATCTTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTaa > 1:640604/1‑141 (MQ=21) cAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTCAc > 1:170288/1‑141 (MQ=17) cAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAAc > 1:380337/1‑141 (MQ=35) aaaccATATCTTAAATATTAGCCAACGACTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATATGAAATAGTTCATACAGAATACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACt < 2:857539/137‑1 (MQ=11) aaTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACt < 2:908424/141‑1 (MQ=35) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTg < 2:210470/141‑1 (MQ=37) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTg > 1:566155/1‑141 (MQ=37) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTg < 1:749500/141‑1 (MQ=37) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTg < 2:88481/141‑1 (MQ=37) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTg > 1:460335/1‑141 (MQ=37) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCGAACTg < 2:409761/141‑1 (MQ=21) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATGGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTg > 1:53548/1‑141 (MQ=37) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAAAGACTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAACTCAACTGTGCAGCAGATCCCCCTAGCTg < 2:194990/141‑1 (MQ=11) gCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTa < 2:588750/141‑1 (MQ=38) cATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTAt < 2:860083/141‑1 (MQ=39) atatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTTAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACATCCTAACTGTAtt > 2:586003/1‑141 (MQ=255) atatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTAtt < 2:650150/141‑1 (MQ=40) atatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTAtt < 2:309778/141‑1 (MQ=40) tatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCACCAGAACCTCCTAACTGTATTa > 2:828973/1‑141 (MQ=255) tatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTa > 2:162247/1‑141 (MQ=40) tatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAAAAGAACCACCTAACTttatta > 2:496240/1‑141 (MQ=255) tatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGGGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATAGCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTGGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAATGGTATTa > 2:604355/1‑141 (MQ=11) atCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTac < 1:290594/141‑1 (MQ=255) atCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTac < 1:277473/141‑1 (MQ=255) tCTTATATCGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTacc < 1:875184/141‑1 (MQ=255) tCTTAGTTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTacc < 2:729136/141‑1 (MQ=255) tCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATCACATTCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTacc < 2:514010/141‑1 (MQ=255) tCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTTTTTTTTTTTTATTATAAATTCAACTTTACAACAGAACCTCCTAACTGTATTacc > 2:488924/1‑141 (MQ=14) tCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTacc < 1:1547/141‑1 (MQ=255) tCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTacc > 1:299870/1‑141 (MQ=255) tCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCCCCTAACTGTATTacc < 2:358806/141‑1 (MQ=255) cTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTaccc > 1:49951/1‑140 (MQ=255) cTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTGGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTacca > 1:656165/1‑141 (MQ=255) tgaGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTaccac < 2:928013/139‑1 (MQ=255) tAGATAGCAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATAGCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAATCTTGCTAGAGAACCTCCTAACTGTATTaccacc < 2:624372/141‑1 (MQ=14) aGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCt < 1:49018/141‑1 (MQ=255) aGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCt > 2:447106/1‑141 (MQ=255) aGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAACTCCTAACTGTATTACCACCt > 2:641565/1‑141 (MQ=255) aGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATCCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCt > 2:447465/1‑141 (MQ=255) gATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCtt < 2:415653/141‑1 (MQ=255) gATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCtt > 1:914495/1‑141 (MQ=255) aTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGCCTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTACAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTa > 1:688776/1‑141 (MQ=255) aTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTa > 2:764785/1‑141 (MQ=255) aTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTa > 1:209323/1‑141 (MQ=255) aTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTa < 2:175259/141‑1 (MQ=255) aTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGCATTACCACCTTa > 2:806971/1‑141 (MQ=255) aTAGTAGCCAACGGCTACAGTGAGAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTTTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTa > 2:674192/1‑141 (MQ=255) tagtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTTTTTTTTTTTTATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTTTATTACGACCATaa > 2:561901/1‑141 (MQ=14) agtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTaaa > 2:583505/1‑141 (MQ=255) agtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTaaa < 1:526687/141‑1 (MQ=255) | TCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAA > CP000731/16872‑17141 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |