| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | = 17001 | NA (NA) | 4 (0.010) | 4/248 | NT | 4.2% | coding (61/675 nt) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0021 | IS431 mec transposase |
| ? | CP000731 | = 17016 | 95 (0.260) | coding (46/675 nt) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0021 | IS431 mec transposase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
CCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGC > CP000731/16876‑17156 | ccAAGTTTGATAGAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGTTCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATACCACGACAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTAC < 1:664469‑M2/141‑1 (MQ=255)ccAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTAC < 2:678079‑M2/141‑1 (MQ=255)ccAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTAC < 2:791364‑M2/141‑1 (MQ=255)ccAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTAC < 1:754304‑M2/141‑1 (MQ=255) tttcTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCGTTGGCTACtatctaagatatgcattgagctatcg > 1:550634‑M2/2‑115 (MQ=255) aTAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAcct < 2:832143/141‑1 (MQ=11) aGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGCAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAcctcc > 1:26698/1‑141 (MQ=17) aGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTTTTTTTATTATATTATAAATTCAACTTTGCAATAGAAcctcc > 2:866317/1‑141 (MQ=11) aGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAcctcc < 1:102642/141‑1 (MQ=32) aGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAcctcc < 2:924214/141‑1 (MQ=32) aGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTGGCAACAGAAcctcc < 2:574199/141‑1 (MQ=17) gCTCAATGCATAACTAAGATAGTAGCCAACGGCTACAGAGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAGGACTCCTTTTTGTGAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCCACAGCAcctcct > 2:415360/1‑141 (MQ=11) cTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAACTTGTTTATATCGTAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTa < 1:218683/141‑1 (MQ=16) cTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTa > 2:549448/1‑141 (MQ=33) cTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTa > 1:745401/1‑141 (MQ=33) cTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTAAGCTTTGCAACAGAACCTCCTa > 2:408529/1‑141 (MQ=18) cTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCGACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTa > 1:674998/1‑141 (MQ=18) tCAAGGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATCTTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTaa > 1:640604/1‑141 (MQ=21) aaaccATATCTTAAATATTAGCCAACGACTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATATGAAATAGTTCATACAGAATACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACt < 2:857539/137‑1 (MQ=11) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTg < 1:749500/141‑1 (MQ=37) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTg < 2:88481/141‑1 (MQ=37) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATGGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTg > 1:53548/1‑141 (MQ=37) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAAAGACTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAACTCAACTGTGCAGCAGATCCCCCTAGCTg < 2:194990/141‑1 (MQ=11) atatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTTAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACATCCTAACTGTAtt > 2:586003/1‑141 (MQ=255) atatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTAtt < 2:309778/141‑1 (MQ=40) atatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTAtt < 2:650150/141‑1 (MQ=40) tatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTa > 2:162247/1‑141 (MQ=40) tatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAAAAGAACCACCTAACTttatta > 2:496240/1‑141 (MQ=255) tatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGGGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATAGCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTGGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAATGGTATTa > 2:604355/1‑141 (MQ=11) atCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTac < 1:290594/141‑1 (MQ=255) tCTTATATCGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTacc < 1:875184/141‑1 (MQ=255) tCTTAGTTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTacc < 2:729136/141‑1 (MQ=255) tCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTacc < 1:1547/141‑1 (MQ=255) tCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCCCCTAACTGTATTacc < 2:358806/141‑1 (MQ=255) cTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTaccc > 1:49951/1‑140 (MQ=255) tgaGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTaccac < 2:928013/139‑1 (MQ=255) aGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCt < 1:49018/141‑1 (MQ=255) aGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCt > 2:447106/1‑141 (MQ=255) aGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAACTCCTAACTGTATTACCACCt > 2:641565/1‑141 (MQ=255) gATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCtt < 2:415653/141‑1 (MQ=255) gATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCtt > 1:914495/1‑141 (MQ=255) aTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGCCTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTACAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTa > 1:688776/1‑141 (MQ=255) aTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTa > 2:764785/1‑141 (MQ=255) aTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTa < 2:175259/141‑1 (MQ=255) aTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTa > 1:209323/1‑141 (MQ=255) aTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGCATTACCACCTTa > 2:806971/1‑141 (MQ=255) gtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGCACCTCCTAACTGTATTACCACCTTaaaa > 2:158207/1‑141 (MQ=255) gtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTaaaa > 1:595053/1‑141 (MQ=255) gtagCCAACGGCTACAATGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTaaaa > 1:562226/1‑141 (MQ=255) tgCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATAACTGAAATAGTTCATACAGCAGATTCTTTTTTGTTAAAATTATATTAGAAATTCAACTTTGCTACATAACCTCCTAACTGGATTACCACCTTCAAagt < 2:70753/140‑1 (MQ=14) gggcAACGGCGACAGGGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGGAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATAGTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAagt < 2:900835/138‑1 (MQ=17) agCCAACGGCTACtatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccacttntatatcaaatttgaaa < 1:851620‑M2/141‑129 (MQ=255) agCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAagt < 2:876318/141‑1 (MQ=255) ccAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGCACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAagtag < 2:467207/141‑1 (MQ=255) ccAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAAATTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAagtag > 2:663619/1‑141 (MQ=255) cgttggCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAagtagt > 1:136898/5‑141 (MQ=255) cAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAagtagt < 1:403303/141‑1 (MQ=255) cAACGGCTACAGTGATAACACCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAagtagt > 1:571511/1‑141 (MQ=255) aaCGGCTACtatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttccagaatctgcaccaatttcatatcgaatttggaagaaa < 2:868193‑M2/141‑133 (MQ=255) aaCGGCTACtatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccgattttatatcaaatttggaagaaa < 1:809691‑M2/141‑133 (MQ=255) aCGGCTACtatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaa < 2:580812‑M2/141‑134 (MQ=255) aCGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTATTTTTTTATTATAAATTCACCTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGttc > 2:311261/1‑140 (MQ=17) cGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCATAACTGTATTACCACCTTAAAAGGAGTTGc > 1:200794/1‑141 (MQ=255) ggCTACtatctaagatatgcattgagctattgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccgcgtggttgcagcaaatttggaagaaaaag > 1:456489‑M2/1‑6 (MQ=255) ggCTACtatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaag < 1:604860‑M2/141‑136 (MQ=255) ggCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTCACTGTATTACCACCTTCAAAGTAGTTGCa > 1:324953/1‑141 (MQ=255) ggCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCa < 2:490234/141‑1 (MQ=255) ggCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCa > 2:745847/1‑141 (MQ=255) gCTATtatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagc > 2:750195‑M2/1‑5 (MQ=255) gCTACtatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagc > 1:131155‑M2/1‑5 (MQ=255) gCTACtatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagc > 1:298532‑M2/1‑5 (MQ=255) gCTACtatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagc > 2:305051‑M2/1‑5 (MQ=255) gCTACtatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaacgtttgtttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagc > 1:888768‑M2/1‑5 (MQ=255) gCTACtatctaagatatgcattcagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaagatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagc > 1:653805‑M2/1‑5 (MQ=255) gCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAAATTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAATAGTTGCAg > 1:388416/1‑141 (MQ=255) gCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCAGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAAGTTTGCAACAAAACCTACTAACTGTATTACAACCTTAAAagtaggttcaa > 2:292352/1‑135 (MQ=17) ctactatctaatatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagca > 1:305299‑M2/1‑4 (MQ=255) ctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagca > 2:253292‑M2/1‑4 (MQ=255) ctactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagca > 1:796002‑M2/1‑4 (MQ=255) cTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGa < 2:901365/141‑1 (MQ=255) cTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGa > 1:146384/1‑141 (MQ=255) tactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatttcaaattgggaagaaaaagcaa < 2:209167‑M2/141‑139 (MQ=255) tactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcat > 1:311981‑M2/1‑3 (MQ=255) tactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcat > 2:720322‑M2/1‑3 (MQ=255) tactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcat > 1:99931‑M2/1‑3 (MQ=255) tactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcat > 2:436228‑M2/1‑3 (MQ=255) tactatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcat > 1:832143‑M2/1‑3 (MQ=255) tACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTTTATTTATATTATAAAATCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTCTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGAc > 2:533787/1‑141 (MQ=18) tACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTATTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTGCCACCTTAAAAGTAGTTGCAGAc > 2:566781/1‑141 (MQ=255) actatctaaggtaagcattgaggtatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcata > 2:220023‑M2/1‑2 (MQ=255) actatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatttgccccaattttatatcaaatttgtaagaaaacgcata < 1:375486‑M2/141‑140 (MQ=255) actatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcata > 1:883718‑M2/1‑2 (MQ=255) aCAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGCCg > 2:510216/1‑141 (MQ=255) aCAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACg > 2:416208/1‑141 (MQ=255) aCAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAAAAGACTCCTTTTTGTGAAAATTATATTATAAATTCACCTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTCCAGAcc > 2:518676/1‑140 (MQ=255) ctatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctacctttggggtcaggaatatgccccaattttatatcaaatttggatgagaaagaataa < 2:808785‑M2/141‑141 (MQ=255) ctatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataa > 1:40986‑M2/1‑1 (MQ=255) ctatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataa > 2:595447‑M2/1‑1 (MQ=255) ctatctaagagatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataa > 2:817152‑M2/1‑1 (MQ=255) cAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATCGTTGATACGGATGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGc > 1:735736/1‑141 (MQ=255) | CCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGC > CP000731/16876‑17156 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |