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1:138341/1‑141 (MQ=255) tGGGGAAAATCCGTAGATCTGAAGAGACCTACGGTTCTTTTTATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTg < 2:481729/141‑1 (MQ=40) tGGGGAAAAACCGTAGATCTGAAGAGCCCTACGGTTTTTTTTATATAGAGCGTAAATACATTCAACACCTTTTTAAGTAATCTTTCTCGGATTGAGACTTTTATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTg < 1:221291/141‑1 (MQ=14) ggAAAATCCGTAGATCTGAAGTGACCTACGGTTCTTTTTATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTGTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTc < 1:270673/141‑1 (MQ=255) aTCCGTAGATCTGAAGAGACCTACGGTTCTTTTTATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGa < 1:100967/141‑1 (MQ=39) | CTTGAATCTTAGTAATTGTAACAGTCATATTAAATGGCTGGTTCTGTTGCAAAGTAAAAAATATAGCTAATCACTAATATATCATGTCAGTGTTCGTTTAACTTGCTAGCATGATGCTAATTTCGTGGCATGGGGAAAATCCGTAGATCTGAAGAGACCTACGGTTCTTTTTATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGG > CP000731/20299‑20579 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |