New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 1525 total aligned reads displayed.
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2:376222/1‑141 (MQ=25) ttttttGAAACGAGGTGGAACGAGTTTCTTTTTTTCTTGATAGTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATaaa < 2:513937/141‑1 (MQ=255) tGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAAcc < 2:697535/141‑1 (MQ=255) tGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAAcc < 1:736548/141‑1 (MQ=255) agtatctcgttcacactcttttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctctaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcga < 2:84921‑M1/136‑136 (MQ=255) gAAACtcgttcacactcgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctctaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaa > 1:862691‑M1/1‑5 (MQ=255) 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1:258765/1‑141 (MQ=255) | ATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGT > NC_012417/2797‑3077 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |