New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_012417 | = 2937 | 1235 (0.960) | 14 (0.010) | 7/250 | NT | 1.2% | intergenic (‑263/–) | USA300HOU_RS14900/– | hypothetical protein/– |
? | NC_012417 | = 2949 | 1025 (0.830) | intergenic (‑275/–) | USA300HOU_RS14900/– | hypothetical protein/– | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 1351 total aligned reads displayed.
GTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAG > NC_012417/2809‑3089 | aTTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTTTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAgttt > 1:455226‑M2/1‑137 (MQ=255) aTTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACAAGatt > 2:60709/1‑141 (MQ=255) ttCGATTTTATTTGATAATCCTTTTTACTTTTTAGAAAGTGTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATGTATTTCGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGTAGAAGGAGTTGGTTGTTTTTTGAATCG‑AGTGTGAACGAGTttc < 2:460039/141‑1 (MQ=255) tCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTttct < 1:763984/141‑1 (MQ=255) tCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTttct < 2:363664/141‑1 (MQ=255) tCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTttct < 2:730493/141‑1 (MQ=255) cGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTttctt < 1:388489/141‑1 (MQ=255) gATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAACAAGAAGAATGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTttcttc < 2:811567/141‑1 (MQ=255) gATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTttcttc < 1:630549/141‑1 (MQ=255) attttattttATAATCCTTTTTACGTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTtcttct < 2:435803/141‑1 (MQ=255) aTTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAACAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTtcttct < 2:834437/141‑1 (MQ=255) ttttATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTCTTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTcttctt < 1:23445/141‑1 (MQ=255) tttgatttgaTAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTcttctt < 2:423127/141‑1 (MQ=255) ttttttTGATAATACGTTTGATTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTTGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTGAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttg < 2:538889/141‑1 (MQ=39) tttATTTGGTAATCCTTTTGTCTTTTTAGAATGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAAGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAGGACAGTATAGGTTGTTTTTTGGAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttg < 2:501635/141‑1 (MQ=255) tttATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGTAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGCAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttg < 2:789905/141‑1 (MQ=255) tttATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTttctaaatc < 2:10033/141‑6 (MQ=255) tttATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttg < 2:137955/141‑1 (MQ=255) tttATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACAATAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttg < 1:731412/141‑1 (MQ=255) ttATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttgt < 1:376223/141‑1 (MQ=255) ttATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttgt < 1:55787/141‑1 (MQ=255) ttATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttgt < 1:873889/141‑1 (MQ=255) ttATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttgt < 2:265557/141‑1 (MQ=255) tATTTGATAATTCTTTTCACTTTTTAGAAATTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGATAGTCATAAAAAGAATAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGATTTTCTtcttgtc < 2:319597/141‑1 (MQ=255) tATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAGAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttgtc < 1:611987/141‑1 (MQ=255) tATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttgtc > 1:134590/1‑141 (MQ=255) ttttGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGCGTCATAACAAGCAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttgtct < 2:707308/140‑1 (MQ=255) aTTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttgtct < 1:594523/141‑1 (MQ=255) aTTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttgtct < 1:745917/141‑1 (MQ=255) tttGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCAAATAAATTTATTTAGGTTGAGATGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttgtctt > 1:930496/1‑141 (MQ=255) ttGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttgtcttg < 2:746030/141‑1 (MQ=255) tGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAATG‑AGTGTGAACGAGATTCTTCTTGGCTTGa > 2:769891/1‑141 (MQ=255) tGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTtcttgtcttgt > 2:27991/1‑140 (MQ=255) aTCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACta > 1:25217/1‑141 (MQ=255) ccTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACtata < 2:405666/141‑1 (MQ=255) cTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACtatat < 1:835050/141‑1 (MQ=255) cTTTTGACATTTTAGAAAATTATAATTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACtatat < 1:10004/141‑1 (MQ=255) tttGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTGGAGGGTCATAAAACGAAGAAGGAATAGGTTGTTGTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAg > 1:895289/1‑141 (MQ=255) tttGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGGTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑ATTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGCTACTATATAg > 2:470813/1‑141 (MQ=255) ttGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGa < 1:659816/141‑1 (MQ=255) ttGACTTTTTAGAAAGGTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGa < 1:52245/141‑1 (MQ=255) tGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGaa < 1:86287/141‑1 (MQ=255) gACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGaaa > 1:848580/1‑141 (MQ=255) gACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTAGATACTATATAGaaa < 1:701614/141‑1 (MQ=255) aCTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGTTACTATATAGAAAt < 1:491702/141‑1 (MQ=255) ttttAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAAc < 2:212236/141‑1 (MQ=255) ttttAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAAc < 1:348713/141‑1 (MQ=255) tttAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACt > 1:911901/1‑141 (MQ=255) tttAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACt < 2:1513/141‑1 (MQ=255) tttAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACt < 2:593722/141‑1 (MQ=255) cgttatctttattCATTGGTTCTCACATTAATTTAAATAGGTATAGAGGGTCATAAATCGCAGAAGGAATAGGTTGTAATTTCACACG‑TGTGAGAACTAGATTATTCTTGTCTTGATCGTATATAGAAATAACTCGAtttt > 2:332525/8‑141 (MQ=255) aGTTTTATTTAGTCATTGGGTTTAACATTAATGTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAATAGAAGAAGGAATTGGTTGTTTTTTGAGCCG‑TGTGTAATCGAGGTTCTGCTTTTATTCATCTGATGTATAAGCAACTCGAtttt > 2:568249/1‑141 (MQ=255) gTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTTAAACTATAGAGAGATGGCTCGGttgtg < 2:893324/141‑4 (MQ=38) gTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATATCTCGATTTta < 2:637402/141‑1 (MQ=255) ttttattCAGTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGTTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTtatatat < 2:655507/140‑1 (MQ=255) tttattCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTTTTTTT‑TTTTTGAACGAGTTAATTCTTGTCTTGATACTATATAGGAATCACGCGATGTtattttta > 2:682655/1‑136 (MQ=255) tttattCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTtatatata > 2:873747/1‑141 (MQ=255) tattCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGTATAGGTTGTTTTTTTTTTTG‑TTTTTGAAAGAGTGTCTTCTTGTCTTGTTTCTATTTAGTTATCACTTGACTTtgtatttttt > 2:518484/1‑136 (MQ=255) tattCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTtatatatata > 1:479197/1‑141 (MQ=255) ttCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGc < 2:553957/141‑1 (MQ=255) aTTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGGTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGt > 2:120410/1‑141 (MQ=255) ttGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTa < 1:541188/141‑1 (MQ=255) ggTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATAGTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAAc > 1:407291/1‑141 (MQ=255) gTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACt < 2:348255/141‑1 (MQ=255) ttttCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTg > 1:325138/1‑141 (MQ=255) tttCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTCTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGt < 2:670826/141‑1 (MQ=255) ttCAAATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGtt < 2:242623/141‑1 (MQ=255) cacaTTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGa > 2:912257/1‑141 (MQ=255) cacaTTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGa < 1:428225/141‑1 (MQ=255) cacaTTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGa < 1:214865/141‑1 (MQ=255) acaTTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGat > 1:204102/1‑141 (MQ=255) aaTTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATCTAGCTGTAACTGTTGAGATTaa > 1:785925/1‑140 (MQ=255) tttatttaGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAg < 1:181521/141‑1 (MQ=255) ttaGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGttt > 2:576008/1‑141 (MQ=255) ttaGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGttt > 2:866401/1‑141 (MQ=255) ttAGAGTGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTTGTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACgt < 2:384534/141‑1 (MQ=255) gagGGTCATAAAAAGACGAAGGAATAGTGTTTTTTATAACATGCAAAATGCGCATG‑TTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGtt < 1:443745/141‑1 (MQ=255) agGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGttt < 1:806037/141‑1 (MQ=255) gTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGATACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTtg > 2:937234/1‑141 (MQ=255) gTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTtg < 2:484829/141‑1 (MQ=255) gTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTtg < 1:266053/141‑1 (MQ=255) gTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTtg < 1:687062/141‑1 (MQ=255) gTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTtg < 1:678679/141‑1 (MQ=255) cATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTtgtg > 1:312153/1‑141 (MQ=255) aaaaaGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGt < 2:19972/141‑1 (MQ=255) aagaagaagGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGaa < 1:46955/141‑1 (MQ=255) aagaagGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTCAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAgg < 2:226910/141‑1 (MQ=255) aagaagGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAgg < 1:819334/141‑1 (MQ=255) aagaagGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAgg < 2:848580/141‑1 (MQ=255) agaagGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGa < 1:280580/141‑1 (MQ=255) gaagGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGaa > 2:169270/1‑141 (MQ=255) aGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGAc < 1:776330/141‑1 (MQ=255) aGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGAc < 1:576008/141‑1 (MQ=255) ggTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAAAGAGTTTCTTCTTGTCTGGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAGCGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACa < 2:298213/141‑1 (MQ=255) ttgttTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAAt < 1:508334/141‑1 (MQ=255) tgttTTTTGCAACG‑AGTGTGACTGAGTTTCTTCTTGTCTGGATACTTTATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATa < 2:183193/141‑1 (MQ=255) ttttGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATaaaaa < 1:717991/141‑1 (MQ=255) aCG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGAAAATAAAAAACCCCAg > 1:119331/1‑141 (MQ=255) aGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTta < 1:298960/141‑1 (MQ=255) cGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTTTAACTGTTGATACTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAGAGGAAAATTTGCCAATAAAAAACCCCAGTTTTAgtatta > 1:165714/1‑141 (MQ=255) | GTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACG‑AGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAG > NC_012417/2809‑3089 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |