Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | USA300TCH1516_ALE | 1562007 | 1562247 | 241 | 9 [7] | [6] 8 | [hlgC_1] | [hlgC_1] |
ATATTTATTAAAAGATTTACCGAGTTTAAAATATCTACAAATGTGTTTTTTTACTATTATTTCGAAAAAAACCCGTTCATTACCAAACAAATTATAAATAATTTATATTTTGATTGATAATAAACATAAAACCACGATATAGTTGACCATAACAACTTTTTAATCATAGCACACAATACGAACACAAAATAATTTATATACTAAAAACGTTTGTTTTTTTAAAATTTAATATATTCATGTAAAAATTAACTGTTTATTAATTTTAAATAATAGGCAAGTAC > USA300TCH1516_ALE/1562108‑1562388 | atatTTATTAAAAGATTTACCGAGTTTAAAATATCTACAAATGTGTTTTTTTACTATTATTTCGAAAAAAACCCGTTCATTACCAAACAAATTATAAATAATTTATATTTTGATTGATAATAAACATAAAACCACGAtata < 1:123518/141‑1 (MQ=255) cGTTCATTACCAAACAAATTATAAATAATTTATATTTTGATTGATAATAAACATAAAACCACGATATAGTTGACCATAACAACTTTTTAATCATAGCACACAATACGAACACAAAATAATTTATATACTAAAAACgtttgt > 2:3737/1‑141 (MQ=255) atTTTGATTGATAATAAACATAAAACCACGATATAGTTGACCATAACAACTTTTTAATCATAGCACACAATACGAACACAAAATAATTTATATACTAAAAACGTTTGTTTTTTTAAAATTTAATATATTCATGTAAAAAtt < 1:3737/141‑1 (MQ=255) aTAAAACCACGATATAGTTGACCATAACAACTTTTTAATCATAGCACACAATACGAACACAAAATAATTTATATACTAAAAACGTTTGTTTTTTTAAAATTTAATATATTCATGTAAAAATTAACTGTTTATTAATTTTaa > 3:153680/1‑141 (MQ=255) aCCACGATATAGTTGACCATAACAACTTTTTAATCATAGCACACAATACGAACACAAAATAATTTATATACTAAAAACGTTTGTTTTTTTAAAATTTAATATATTCATGTAAAAATTAACTGTTTATTAATTTTAaataat > 2:272883/1‑141 (MQ=255) cGATATAGTTGACCATAACAACTTTTTAATCATAGCACACAATACGAACACAAAATAATTTATATACTAAAAACGTTTGTTTTTTTAAAATTTAATATATTCATGTAAAAATTAACTGTTTATTAATTTTAAATAATAGGc > 2:41454/1‑141 (MQ=255) aGTTGACCATAACAACTTTTTAATCATAGCACACAATACGAACACAAAATAATTTATATACTAAAAACGTTTGTTTTTTTAAAATTTAATATATTCATGTAAAAATTAACTGTTTATTAATTTTAAATAATAGGCAAGTat > 2:13746/1‑140 (MQ=255) aGTTGACCATAACAACTTTTTAATCATAGCACACAATACGAACACAAAATAATTTATATACTAAAAACGTTTGTTTTTTTAAAATTTAATATATTCATGTAAAAATTAACTGTTTATTAATTTTAAATAATAGGCAAGTaa > 2:13731/1‑140 (MQ=255) | ATATTTATTAAAAGATTTACCGAGTTTAAAATATCTACAAATGTGTTTTTTTACTATTATTTCGAAAAAAACCCGTTCATTACCAAACAAATTATAAATAATTTATATTTTGATTGATAATAAACATAAAACCACGATATAGTTGACCATAACAACTTTTTAATCATAGCACACAATACGAACACAAAATAATTTATATACTAAAAACGTTTGTTTTTTTAAAATTTAATATATTCATGTAAAAATTAACTGTTTATTAATTTTAAATAATAGGCAAGTAC > USA300TCH1516_ALE/1562108‑1562388 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |