New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 342 total aligned reads displayed.
AAAGTGCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000731/1562‑1610 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgtcacaaaaATAAGACAGTACTTTTTTATAAAAAATCAACAAAAAAGACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCT < NC_012417/1047‑909 ATTTTTGTGACAAATGCTGTAGGTAGTGTCACAAAAATAAGACAGTACTTTTTTATAAAAAATCAACAAAAAAGACATTAGTCAACACTAATGGCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTG > 1:514493/1‑140 TGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAGTACTTTTTTATAAAAAATCAACAAAAAAGACATTAGTACATACTCATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGC > 1:230657/1‑140 GACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAGTACTTTTTTATAAAAAATCAACAAAAAAGACATTAGTCAACACTCTTGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCT > 1:38298/1‑140 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |