| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | USA300TCH1516_ALE | 1,747,382 | (TAC)3→2 | coding (2065‑2067/2280 nt) | USA300HOU_RS08710 ← | Heme uptake protein MmpL11 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1747377 = | 6 (0.070) | 78 (0.930) | 54/262 | 0.2 | 93.6% | coding (2072/2280 nt) | USA300HOU_RS08710 | Heme uptake protein MmpL11 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1747373 | 5 (0.060) | coding (2076/2280 nt) | USA300HOU_RS08710 | Heme uptake protein MmpL11 | |||||
TTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAAC > USA300TCH1516_ALE/1747238‑1747514 | ttttttcaactgacgttttttcattattccccatagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaa < 1:813047‑M1/1‑1 (MQ=255)ttttttcaactgacgttttttcattattccccatagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaa > 2:481526‑M1/140‑140 (MQ=255)ttttttcaactgacgttttttcattattccccatagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaa < 2:932783‑M1/1‑1 (MQ=255) actgacgttttttcattattccccatagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatactaaagtaaagttgaatatcataggagcaacgaagaatagtatagcaACTAATACa < 2:508989‑M1/9‑1 (MQ=255) gtcgttttttctttattccccattgcggagtggaaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATa > 1:351880‑M1/129‑140 (MQ=255) tttttcattattccccatagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGt < 1:953057‑M1/17‑1 (MQ=255) tattccccatagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcgACTACTACAATAACTGttaatcgtg < 1:616816‑M1/25‑5 (MQ=255) tattccccatagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTg > 1:314756‑M1/116‑140 (MQ=255) ccccatagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTAtt < 1:88985‑M1/29‑1 (MQ=255) ccccatagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagaaccgaaggatagtatagaaACTACTACAATAACTGTTAATActgtctc < 2:910644‑M1/29‑4 (MQ=255) atagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagcacattaaagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAAtt < 1:936856‑M1/33‑1 (MQ=255) atagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGaattaatt < 2:715138‑M1/33‑1 (MQ=255) atagcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAAtt < 1:978051‑M1/33‑1 (MQ=255) agcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGa < 1:832628‑M1/35‑1 (MQ=255) agcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGa < 1:242321‑M1/35‑1 (MQ=255) gcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGaa < 1:242474‑M1/36‑1 (MQ=255) gcggaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGaa < 1:263165‑M1/36‑1 (MQ=255) gagcggcaatgaagattgaaaagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagaaAAAACTACACCTGCCGTTAATACTGTATTAATTGAACgt > 2:215544‑M1/102‑140 (MQ=255) gaacggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACgt > 2:100629‑M1/102‑140 (MQ=255) gaacggcaatgaacattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcggaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACgt > 1:319518‑M1/102‑140 (MQ=255) acggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACgtgt > 2:919111‑M1/100‑140 (MQ=255) gtctatgaagtttgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCa > 1:195661‑M1/98‑140 (MQ=255) ggcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCa < 2:589995‑M1/43‑1 (MQ=255) gtaatgaagattgaagagaatactccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCAt > 1:894720‑M1/97‑140 (MQ=255) gcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTTAACGTGTCAt > 2:685878‑M1/97‑140 (MQ=255) gcaatgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCAt > 2:643651‑M1/97‑140 (MQ=255) tgaagattgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGGGTCATtgtc < 1:343894‑M1/48‑1 (MQ=255) attgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgataaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTgtctgtct > 2:604356‑M1/88‑140 (MQ=255) ttgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTa > 2:703780‑M1/87‑140 (MQ=255) ttgaagagaatacaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTa > 2:1004943‑M1/87‑140 (MQ=255) tgaagtgaatacaacagaaatcaagccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaataggatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTaa > 1:502434‑M1/86‑140 (MQ=255) gaagagaatacacccgaaatcaatacgataaataatgctacagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgcagaatagtatagcaGCGACTACGATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAAt > 2:655344‑M1/85‑140 (MQ=255) aatacacctgaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCt > 1:212111‑M1/79‑140 (MQ=255) acaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggggcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTAtt < 1:141848‑M1/65‑1 (MQ=255) acaccagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatagcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTAtt < 2:412365‑M1/65‑1 (MQ=255) accagaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGCTCTATTaa < 1:475096‑M1/67‑1 (MQ=255) gaaatcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGat < 2:115721‑M1/71‑1 (MQ=255) atcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATatc < 2:330412‑M1/74‑1 (MQ=255) atcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATatc < 1:179073‑M1/74‑1 (MQ=255) atcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAAAACCGGGGTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGTTatc < 1:189092‑M1/74‑1 (MQ=255) tcaatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaagagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATatca < 1:782490‑M1/75‑1 (MQ=255) caatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGACAGACTAATTGAACTAATAACGCTatcat < 1:445139‑M1/76‑1 (MQ=255) tatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATatcatc > 1:656789‑M1/64‑140 (MQ=255) aatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcacctaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTGTTAACGATatcatc < 2:254242‑M1/77‑1 (MQ=255) aatccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATCGTCTGTGTAATTTATCTCTTCACGATatcatc < 2:95964‑M1/77‑1 (MQ=255) tcctataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCaa > 1:366484‑M1/62‑140 (MQ=255) tccgataaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCaa < 1:179202‑M1/79‑1 (MQ=255) ataaataatgctaatggaaagttgactcctggtggattttcgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTg > 1:679424‑M1/58‑140 (MQ=255) aaataatgctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGtt > 1:944655‑M1/56‑140 (MQ=255) tGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAACACCGAAGAATACTATAGCA‑‑‑ACTACTACAATAACTGTTAATCCTGTATTAATTGAACGTGTCATTGCCTCTCTAATTGATCTATTCACGATCTCATCCATTAGTTCtgttg > 2:142330/1‑140 (MQ=255) gctaaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCtgttgt > 1:39682‑M1/49‑140 (MQ=255) agtaaagtTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAA‑T‑‑TAATACAATTATTGTTACTTTTGTATTTGATGAAGGTGTCATTATCTTTTTAAACTTTCTATTAACGATAGTATTCATTTGTTCTGTTTTCGTaa > 2:836826/1‑140 (MQ=255) aaagtaaagttgaatatcgtaggagctccgaagaatagtatagcaTCTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGt > 2:321491‑M1/46‑140 (MQ=255) aaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGt > 2:379998‑M1/46‑140 (MQ=255) aaagtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATAAATTTGTTCTGTTGTcgg < 2:368130‑M1/95‑2 (MQ=255) taaagtTGAATATCGTAGGAACACCGAAGAATAGTATAGCA‑‑‑ACTACTACAATGACTGTTAATACTGCATTAATTGAACGTGTTATTGTCTTACCAATTGATGATTTAACCATATCATCCATTTGTTCGGCTGTCGTAAta > 2:402869/1‑139 (MQ=255) agtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTaa < 2:846987‑M1/97‑1 (MQ=255) gtaaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATGAATTTGTTCTGTTGTCGTAAt < 2:159321‑M1/98‑1 (MQ=255) taaagttggatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATc > 1:100138‑M1/42‑140 (MQ=255) taaagttgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATc > 2:137765‑M1/42‑140 (MQ=255) tGAATATCGTAAGAGCACCGAAGAATAGTAAAGCA‑‑‑ACTACTACAATAACTGACAATACTGCATAACTTGAGCGTGTCCTTGTCTGTCTCATTGATCTATTACCGCTATCATCACTTTGTTCTGTTTTCGTATTCACTTTa > 2:112205/1‑140 (MQ=255) agttgaatatcgtaggaggaccgaagaatggtatagcaACTATTACAATCACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACt > 2:765772‑M1/39‑140 (MQ=255) gttgaatatcgtaggagcacggaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATTTCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACtt > 2:967342‑M1/38‑140 (MQ=255) gctgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACtt > 1:586397‑M1/38‑140 (MQ=255) tgaatatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACGACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTTTTAACGATATCATCAATTTGTTCTTTTTTCGTGATAACTTTa < 1:287649‑M1/105‑1 (MQ=255) tatcgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGGGAATACTGTATTAATTGAACGTGTTATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATAATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCt < 2:500826‑M1/109‑1 (MQ=255) cgtaggagcaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCtttt < 1:764886‑M1/112‑1 (MQ=255) taggagtaccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGt > 1:211887‑M1/27‑140 (MQ=255) taggagaaccgaaaaatagtataacaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGt > 1:269799‑M1/27‑140 (MQ=255) ggagcaccgaagaatagtatagcaACTCCTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGACTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTaa > 1:697904‑M1/25‑140 (MQ=255) aCCGAAGAATAGTATAGCA‑‑‑ACTACTACAAGCACTTTTAATGCGTTAGGAATTGAACGTGTCCTCGTCTGTCGAATTGACCTATGAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCGTTTGTAAGtttt < 2:384208/140‑1 (MQ=255) ccgaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCAGCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTc < 2:73197‑M1/122‑1 (MQ=255) gaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCAc < 1:107966‑M1/124‑1 (MQ=255) gaagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCAc > 1:692255‑M1/17‑140 (MQ=255) aagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTGCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACg < 1:24415‑M1/125‑1 (MQ=255) aagaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATATATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACg < 1:731237‑M1/125‑1 (MQ=255) agaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTATTCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGt < 1:822839‑M1/126‑1 (MQ=255) agaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGt < 2:814798‑M1/126‑1 (MQ=255) agaatagtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGt < 2:31896‑M1/126‑1 (MQ=255) agtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACTTACACg < 1:200241‑M1/131‑1 (MQ=255) gtatagcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTGTTTATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGTTTTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTTTCGTAGTTACTCTACGCTTTTGTAAGTTATTAcgtacatgg < 1:142638‑M1/132‑4 (MQ=255) gcaACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATAATCTGGCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCaaa < 1:528762‑M1/137‑1 (MQ=255) ctactactaCAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAAc < 1:965632/140‑1 (MQ=255) caACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAAc > 1:330412‑M1/3‑140 (MQ=255) caACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAAc > 2:179073‑M1/3‑140 (MQ=255) caACTACGAAAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAAc > 1:508983‑M1/3‑140 (MQ=255) caACCACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAAc > 2:189092‑M1/3‑140 (MQ=255) | TTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAAC > USA300TCH1516_ALE/1747238‑1747514 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |