| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | USA300TCH1516_ALE | 1,747,382 | (TAC)3→2 | coding (2065‑2067/2280 nt) | USA300HOU_RS08710 ← | Heme uptake protein MmpL11 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1747377 = | 6 (0.070) | 78 (0.930) | 54/262 | 0.2 | 93.6% | coding (2072/2280 nt) | USA300HOU_RS08710 | Heme uptake protein MmpL11 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1747373 | 5 (0.060) | coding (2076/2280 nt) | USA300HOU_RS08710 | Heme uptake protein MmpL11 | |||||
TTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCA > USA300TCH1516_ALE/1747235‑1747511 | ttttttCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAa > 2:481526‑M2/1‑139 (MQ=255)ttttttCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAa < 1:813047‑M2/140‑2 (MQ=255)ttttttCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAa < 2:932783‑M2/140‑2 (MQ=255) aCTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATACTAAAGTAAAGTTGAATATCATAGGAGCAACGAAGAATAGTATAGCAactaataca < 2:508989‑M2/140‑10 (MQ=255) gtcgtTTTTTCTTTATTCCCCATTGCGGAGTGGAAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaata > 1:351880‑M2/3‑128 (MQ=255) tttttCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgt < 1:953057‑M2/140‑18 (MQ=255) tattCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCGactactacaataactgttaatcgtg < 1:616816‑M2/140‑26 (MQ=255) tattCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactg > 1:314756‑M2/1‑115 (MQ=255) ccccATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtatt < 1:88985‑M2/140‑30 (MQ=255) ccccATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGAACCGAAGGATAGTATAGAAactactacaataactgttaatactgtctc < 2:910644‑M2/140‑30 (MQ=255) aTAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGCACATTAAAGCAactactacaataactgttaatactgtattaatt < 1:936856‑M2/140‑34 (MQ=255) aTAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaatt < 1:978051‑M2/140‑34 (MQ=255) aTAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgaattaatt < 2:715138‑M2/140‑34 (MQ=255) aGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattga < 1:832628‑M2/140‑36 (MQ=255) aGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattga < 1:242321‑M2/140‑36 (MQ=255) gCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaa < 1:242474‑M2/140‑37 (MQ=255) gCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaa < 1:263165‑M2/140‑37 (MQ=255) gAGCGGCAATGAAGATTGAAAAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGAAaaaactacacctgccgttaatactgtattaattgaacgt > 2:215544‑M2/1‑101 (MQ=255) gAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgt > 2:100629‑M2/1‑101 (MQ=255) gAACGGCAATGAACATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGGAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgt > 1:319518‑M2/1‑101 (MQ=255) aCGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgt > 2:919111‑M2/1‑99 (MQ=255) gtctatgaaGTTTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtca > 1:195661‑M2/5‑97 (MQ=255) ggCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtca < 2:589995‑M2/140‑44 (MQ=255) gtaatgAAGATTGAAGAGAATACTCCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcat > 1:894720‑M2/3‑96 (MQ=255) gCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaatttaacgtgtcat > 2:685878‑M2/1‑96 (MQ=255) gCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcat > 2:643651‑M2/1‑96 (MQ=255) tGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgggtcattgtc < 1:343894‑M2/140‑49 (MQ=255) aTTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGATAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtct > 2:604356‑M2/1‑87 (MQ=255) ttGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtcta > 2:703780‑M2/1‑86 (MQ=255) ttGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtcta > 2:1004943‑M2/1‑86 (MQ=255) tGAAGTGAATACAACAGAAATCAAGCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGGATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaa > 1:502434‑M2/1‑85 (MQ=255) gAAGAGAATACACCCGAAATCAATACGATAAATAATGCTACAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGCAGAATAGTATAGCAgcgactacgataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaat > 2:655344‑M2/1‑84 (MQ=255) aaTACACCTGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatct > 1:212111‑M2/1‑78 (MQ=255) acacCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGGGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctatt < 1:141848‑M2/140‑66 (MQ=255) acacCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATAGCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctatt < 2:412365‑M2/140‑66 (MQ=255) acCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgctctattaa < 1:475096‑M2/140‑68 (MQ=255) gAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgat < 2:115721‑M2/140‑72 (MQ=255) atcaatcCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatc < 2:330412‑M2/140‑75 (MQ=255) atcaatcCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatc < 1:179073‑M2/140‑75 (MQ=255) atcaatcCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaaaaccggggtaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgttatc < 1:189092‑M2/140‑75 (MQ=255) tcaatcCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAAGAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatca < 1:782490‑M2/140‑76 (MQ=255) caatcCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgacagactaattgaactaataacgctatcat < 1:445139‑M2/140‑77 (MQ=255) tatccGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatc > 1:656789‑M2/2‑63 (MQ=255) aatcCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCTAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctgttaacgatatcatc < 2:254242‑M2/140‑78 (MQ=255) aatcCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcatcgtctgtgtaatttatctcttcacgatatcatc < 2:95964‑M2/140‑78 (MQ=255) tcCTATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaa > 1:366484‑M2/1‑61 (MQ=255) tcCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaa < 1:179202‑M2/140‑80 (MQ=255) ataaataaTGCTAATGGAAAGTTGACTCCTGGTGGATTTTCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttg > 1:679424‑M2/1‑57 (MQ=255) aaataaTGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgtt > 1:944655‑M2/1‑55 (MQ=255) tGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAACACCGAAGAATACTATAGCA‑‑‑ACTACTACAATAACTGTTAATCCTGTATTAATTGAACGTGTCATTGCCTCTCTAATTGATCTATTCACGATCTCATCCATTAGTTCtgttg > 2:142330/1‑140 (MQ=255) gCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgt > 1:39682‑M2/1‑48 (MQ=255) aaagtaaagtTGAATATCGTAGGAGCTCCGAAGAATAGTATAGCAtctactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgt > 2:321491‑M2/1‑45 (MQ=255) aaagtaaagtTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgt > 2:379998‑M2/1‑45 (MQ=255) aaagtaaagtTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcataaatttgttctgttgtcgg < 2:368130‑M2/140‑96 (MQ=255) agtaaagtTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaa < 2:846987‑M2/140‑98 (MQ=255) agtaaagtTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAA‑T‑‑TAATACAATTATTGTTACTTTTGTATTTGATGAAGGTGTCATTATCTTTTTAAACTTTCTATTAACGATAGTATTCATTTGTTCTGTTTTCGTaa > 2:836826/1‑140 (MQ=255) gtaaagtTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatgaatttgttctgttgtcgtaat < 2:159321‑M2/140‑99 (MQ=255) taaagtTGGATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatc > 1:100138‑M2/1‑41 (MQ=255) taaagtTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatc > 2:137765‑M2/1‑41 (MQ=255) taaagtTGAATATCGTAGGAACACCGAAGAATAGTATAGCA‑‑‑ACTACTACAATGACTGTTAATACTGCATTAATTGAACGTGTTATTGTCTTACCAATTGATGATTTAACCATATCATCCATTTGTTCGGCTGTCGTAAta > 2:402869/1‑139 (MQ=255) agtTGAATATCGTAGGAGGACCGAAGAATGGTATAGCAactattacaatcactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcact > 2:765772‑M2/1‑38 (MQ=255) gtTGAATATCGTAGGAGCACGGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatttcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactt > 2:967342‑M2/1‑37 (MQ=255) gctgaATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactt > 1:586397‑M2/3‑37 (MQ=255) tGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAacgactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatcttttaacgatatcatcaatttgttcttttttcgtgataacttta < 1:287649‑M2/140‑106 (MQ=255) tGAATATCGTAAGAGCACCGAAGAATAGTAAAGCA‑‑‑ACTACTACAATAACTGACAATACTGCATAACTTGAGCGTGTCCTTGTCTGTCTCATTGATCTATTACCGCTATCATCACTTTGTTCTGTTTTCGTATTCACTTTa > 2:112205/1‑140 (MQ=255) tatCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgggaatactgtattaattgaacgtgttattgtctgtctaattgatctattaacgatataatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaacct < 2:500826‑M2/140‑110 (MQ=255) cGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaacctttt < 1:764886‑M2/140‑113 (MQ=255) tAGGAGTACCGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgt > 1:211887‑M2/1‑26 (MQ=255) tAGGAGAACCGAAAAATAGTATAACAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgt > 1:269799‑M2/1‑26 (MQ=255) ggAGCACCGAAGAATAGTATAGCAactcctacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgactaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaa > 1:697904‑M2/1‑24 (MQ=255) aCCGAAGAATAGTATAGCA‑‑‑ACTACTACAAGCACTTTTAATGCGTTAGGAATTGAACGTGTCCTCGTCTGTCGAATTGACCTATGAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCGTTTGTAAGtttt < 2:384208/140‑1 (MQ=255) ccGAAGAATAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcagcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttc < 2:73197‑M2/140‑123 (MQ=255) gaagaaTAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcac < 1:107966‑M2/140‑125 (MQ=255) gaagaaTAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcac > 1:692255‑M2/1‑16 (MQ=255) aagaaTAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgtgctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacg < 1:24415‑M2/140‑126 (MQ=255) aagaaTAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatatattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacg < 1:731237‑M2/140‑126 (MQ=255) agaaTAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtattcactttaaccttttgtaagttttcacgt < 1:822839‑M2/140‑127 (MQ=255) agaaTAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacgt < 2:814798‑M2/140‑127 (MQ=255) agaaTAGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacgt < 2:31896‑M2/140‑127 (MQ=255) aGTATAGCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacttacacg < 1:200241‑M2/140‑132 (MQ=255) gTATAGCAactactacaataactgttaatactgtgtttattgaacgtgtcattgtctgtctaattgttttattaacgatatcatcaatttgttctgttttcgtagttactctacgcttttgtaagttattacgtacatgg < 1:142638‑M2/140‑133 (MQ=255) gCAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcataatctggctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacgtacacggtcaaa < 1:528762‑M2/140‑138 (MQ=255) cAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacgtacacggtcaaac > 1:330412‑M2/1‑2 (MQ=255) cAactactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacgtacacggtcaaac > 2:179073‑M2/1‑2 (MQ=255) cAactacgaaaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacgtacacggtcaaac > 1:508983‑M2/1‑2 (MQ=255) cAaccactacaataactgttaatactgtattaattgaacgtgtcattgtctgtctaattgatctattaacgatatcatcaatttgttctgttgtcgtaatcactttaaccttttgtaagttttcacgtacacggtcaaac > 2:189092‑M2/1‑2 (MQ=255) | TTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCA > USA300TCH1516_ALE/1747235‑1747511 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |