New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 3542 total aligned reads displayed.
TATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTT > NC_012417/1934‑2212 | aTGGCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAAACCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGc < 2:285974/140‑1 (MQ=17) aTGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGc > 2:530073/1‑140 (MQ=33) cccagaAAATTTATTAATGTTGAGAAAAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATTTCGTCATAGCGTGAGCTATTAATCCGACCATTCGACAATTTTTGGGATTGTTAAGCGTTCGTATGTTCAACGTCAATAAAGCAAt < 2:214297/137‑1 (MQ=11) ccGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGAGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAAt < 2:653016/140‑1 (MQ=17) agaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTTAACGTCAATAAAGCAATTgg < 1:706747/140‑1 (MQ=14) agaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTgg < 2:577290/140‑1 (MQ=31) agaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGATCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTgg > 1:278376/1‑140 (MQ=14) agaAAATTTATTGATGTTCAGAAAAACCCTTAACGAAACTTGCAGACGAATGTCGGGATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTGGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATggg < 2:899501/140‑1 (MQ=11) aTTGATGATGAGAAGAACCCGTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGATTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCGATAAAGCAATTGGAATAAATAg > 1:632463/1‑140 (MQ=255) ttGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGt < 1:869822/140‑1 (MQ=33) 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1:950578/1‑140 (MQ=39) aGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAGTTTTGGCTAAtttttt > 2:198577/1‑140 (MQ=255) aGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAAtttttt > 2:863866/1‑140 (MQ=255) ggCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGGATCGAAAGTAACCCGGAGTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTCACTTTTATCCCAATTTGAGCTAAttttttt > 2:738265/1‑140 (MQ=255) cTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGc > 1:51706/1‑140 (MQ=255) cTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGCAACCCGTACTTAAGCTTACATTGTACAGCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGGTTCCTTTGATCCAAATATTAGCTAATTTTTTTGc > 2:981755/1‑140 (MQ=255) cTCAACGCCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGc < 2:7899/140‑1 (MQ=255) aaCGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACCTCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTACTTTTTTTGCtcc > 1:415829/1‑138 (MQ=255) aaCGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTAc < 2:159431/140‑1 (MQ=255) caataaaGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCt < 2:675263‑M2/133‑1 (MQ=255) aaaGCAGTTGGAATACATAGTATCTACAGTACCCCGTATTTATGATTACATTGTACATCCTCCGAATCCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTaa < 2:230215‑M2/137‑1 (MQ=255) aGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTTCGTCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGt < 2:551623‑M2/139‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |