Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | USA300TCH1516_ALE | 58811 | 58986 | 176 | 2 [1] | [1] 2 | USA300TCH1516_00049/USA300HOU_RS00245 | hypothetical protein/hypothetical protein |
TGTATTACTTCAATATACCCTTAAATTTTTATAATTAATTATATTGTAATATTATTTTATTTTATAAAAATAGTTTAATAAAATGTTTAATTTTTATAAAAAATAATTAAATATTATAGACATTACGATAGTTTAATTAGAAAATATATTTAAGAATTATGAATTTAGTTCTTATTAATGTTAAAGATCATCAATTATTTTGTCACATTATCTTGAGAGGATTACCTTATGAGGTAGCCTTTT > USA300TCH1516_ALE/58660‑58902 | tgtaTTACTTCAATATACCCTTAAATTTTTATAATTAATTATATTGTAATATTATTTTATTTTATAAAAATAGTTTAATAAAATGTTTAATTTTTATAAAAAATAATTAAATATTATAGACATTACGATAGTTTATTTAGTATATATAttt > 4:359755/1‑151 (MQ=255) tttATAAAAAATAATTAAATATTATAGACATTACGATAGTTTAATTAGAAAATATATTTAAGAATTATGAATTTAGTTCTTATTAATGTTAAAGATCATCAATTATTTTGTCACATTATCTTGAGAGGATTACCTTATGAGGTAGCCtttt < 1:386410/151‑1 (MQ=255) | TGTATTACTTCAATATACCCTTAAATTTTTATAATTAATTATATTGTAATATTATTTTATTTTATAAAAATAGTTTAATAAAATGTTTAATTTTTATAAAAAATAATTAAATATTATAGACATTACGATAGTTTAATTAGAAAATATATTTAAGAATTATGAATTTAGTTCTTATTAATGTTAAAGATCATCAATTATTTTGTCACATTATCTTGAGAGGATTACCTTATGAGGTAGCCTTTT > USA300TCH1516_ALE/58660‑58902 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |