| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913_3_hsa_pgi | = 2470483 | 135 (1.430) | intergenic (+21/‑332) | gtrS/tfaS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage/pseudogene, CPS‑53 (KpLE1) prophage; tail fiber assembly protein fragment;Phage or Prophage Related | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
TAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTA > NC_000913_3_hsa_pgi/2470336‑2470626 | taGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCaataat > 1:495005/1‑149 (MQ=255)taGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCAt < 2:380257/149‑1 (MQ=255)taGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCAt < 2:116800/149‑1 (MQ=255) agagATTTAATCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATg < 1:1014199/149‑1 (MQ=255) agagATTTAAGCAAGCATATATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACATTAGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTAAAAAATAATACAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAAACATg > 2:126877/1‑149 (MQ=255) gagaTTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTTATTTATAAAATAATTCAAATAAATCAAGACAATAGAGATGTAAAGAACTTAGTTTAAATTTCTCGACAATCATgt > 1:1201248/1‑148 (MQ=255) gagaTATAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATgg < 1:727577/149‑1 (MQ=255) agaTTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGgc < 2:1530398/149‑1 (MQ=255) 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aaaGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACGAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTTATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATAtc < 1:369097/149‑1 (MQ=255) aaGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATAtct > 2:69343/1‑149 (MQ=255) aaGCACTAAGTTTAAATTGCGCGACAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGAGACTATATCTACTGATAGAATAGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTAATTGAAATAtct > 2:1182496/1‑149 (MQ=255) cACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGAc < 2:803518/79‑1 (MQ=255) cTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTCATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGAGGTTATCTCCTGATAGAAGTGCGGTTTTGAGTATCAAATGCCCTGAGGCGTTGGTTATTGTAATATCTCctct > 1:1262477/1‑149 (MQ=255) aaGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTAt < 1:1497929/149‑1 (MQ=255) aGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATc < 1:733268/149‑1 (MQ=255) gTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGTGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTTTTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCt < 2:1108955/149‑1 (MQ=255) gTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCt < 2:1079636/149‑1 (MQ=255) tttAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTg > 1:95332/1‑149 (MQ=255) aaaTTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAg > 2:1312629/1‑149 (MQ=255) aTTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGAc < 1:23077/149‑1 (MQ=255) tGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGa < 2:346116/149‑1 (MQ=255) cgcgcCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATa > 1:1493392/1‑149 (MQ=255) ccAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTATCCTCCTCGTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGTTATTGACTATCTAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTATTATCTCCTCTATCTTCAGACGATAACtt > 2:284799/1‑149 (MQ=255) cAATCATGGCGCGCACAAGCTATATTACCAACCTAATTTCTCGTCCTCTTAGAGTGACTATATCTACTGATAGAATTGAGGTATTGAGTATCAAATGCCCTGCTTCGTTGTGTATGGTAATATCTGGTCTATCTGCAGCCGATACCttt > 2:1262307/1‑148 (MQ=255) cAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGAGTATCAAATGCCCGGATTCGTTGTTTATTGTAATTTCTCCTCTATCTGCAGAAGAGAACTTa > 1:1126798/1‑149 (MQ=255) | TAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTA > NC_000913_3_hsa_pgi/2470336‑2470626 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |