New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_hsa_pgi | 4240185 = | NA (NA) | 20 (0.370) | 14/264 | 3.4 | NA | noncoding (1/37 nt) | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
? | NC_000913_3_hsa_pgi | 4240218 = | NA (NA) | noncoding (34/37 nt) | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 689 total aligned reads displayed.
AGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAAGGAGGTACTGCTATGACGTCACTCTC > NC_000913_3_hsa_pgi/4240070‑4240366 | gTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTa < 1:560254/149‑1 (MQ=255) aCGGTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACgg < 1:137651/149‑1 (MQ=255) gTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACAGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggt < 2:553646/149‑1 (MQ=255) ttccgttGGTCCAGTGGCACATTGTCGGTTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtag < 2:406497/144‑1 (MQ=255) ttCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtag < 1:82364/149‑1 (MQ=255) ttCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtag < 2:732964/149‑1 (MQ=255) cATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGGGGCTGGGAATCACCTGGATGGGTGATTTTGGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCGTACGggtaggt < 1:630529/149‑1 (MQ=255) tttGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTGTTGCCGGATGCGCCGCCAGCCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGCAGGtat > 1:857263/1‑149 (MQ=255) tttGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTTCGcggaggtgt > 2:301905/1‑147 (MQ=255) tttGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGtat > 1:601093/1‑149 (MQ=255) gTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATc > 1:202414/1‑149 (MQ=255) gTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATc < 1:573389/149‑1 (MQ=255) gTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTGTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATc < 1:816675/149‑1 (MQ=255) ttCTAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATcc < 2:453405/149‑1 (MQ=255) ccAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCgg < 2:228862/149‑1 (MQ=255) ccAGAGGAACATTGTCGATTTTGCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCgg < 2:27638/149‑1 (MQ=255) cAGAGGTACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGc > 1:796279/1‑149 (MQ=255) cAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtaggt < 1:550450/140‑1 (MQ=255) agagGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCt > 1:654231/1‑149 (MQ=255) ggAACATTGTCGAGTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtg < 1:534556/149‑1 (MQ=255) aaCATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggt < 2:126003/149‑1 (MQ=255) aaCATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggt < 1:925357/149‑1 (MQ=255) aCATTGTCGATTTTTCGCGCATTGGTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtg < 2:818194/149‑1 (MQ=255) aCATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTAGTGTCGGGGAACCTATTAGCAGCCGAACGTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtg < 1:974627/149‑1 (MQ=255) aTTGTCGTTTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGa < 1:10342/149‑1 (MQ=255) ttGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAg < 2:97097/149‑1 (MQ=255) tCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGCTGCGCCGCCAGGCGAGGCTTATCCGGCCTACGGATAGGTATAGTCGGCGTTGGTGGAGgcg > 2:196290/1‑149 (MQ=255) tttttCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTGGTGGGAGGCGCGCt < 2:622683/149‑1 (MQ=255) gcgcATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGGTGCGCCGCCAGGCGTGCATCAATTCGTCAACGGGTAGGTATATTCGGAGTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAAt > 1:731162/1‑149 (MQ=255) cATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCa < 1:116917/149‑1 (MQ=255) cATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTACCTATATCCGCCTTTGGTGCAGGCGCCCTCCAAATCCa < 2:744174/149‑1 (MQ=255) cATTGCTGGTGGCTGGCAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCa < 1:318095/149‑1 (MQ=255) cATTGCCGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCa < 1:279103/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCTGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGtt < 1:515292/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGGTGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGCGGCGCTCCCACTCCAGGTTg > 2:644843/1‑149 (MQ=255) cTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTg > 1:991738/1‑149 (MQ=255) gtggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAAc > 1:160187/1‑149 (MQ=255) tggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACa > 2:244412/1‑149 (MQ=255) tgggggATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGTTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACaaaa < 2:479320/147‑1 (MQ=255) cTGGGAATCACCTGAATGGGTGTTTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGGTGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGTGGCGCGGTCCAAATCCAGGTTGAACaaaa > 2:840583/1‑149 (MQ=255) cTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACaaaa < 1:583158/149‑1 (MQ=255) tGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAAc > 2:434375/1‑149 (MQ=255) gggAATCACCTTAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACa < 2:140853/149‑1 (MQ=255) 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tGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAatat > 2:889519/1‑149 (MQ=255) ggTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAg < 1:309487/149‑1 (MQ=255) gATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGAtc < 2:592561/149‑1 (MQ=255) aTTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGAtct > 1:679375/1‑149 (MQ=255) tttttGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtg > 2:761079/1‑92 (MQ=255) tttttGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATAAAAAtctc > 1:25595/1‑149 (MQ=255) 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gATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTtata < 1:124294/131‑1 (MQ=255) tGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACTGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGa < 2:351152/149‑1 (MQ=255) gcgcTGCCAGGCGCGGCTTATCCAGCCTACGGGGAGGTATATCCCGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACACACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTCGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGaa < 1:844817/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGTGAGGTATATCCTGCTTTGGTGGAGGCGCGCTTCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGaa < 2:803051/149‑1 (MQ=255) cgccgcCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAag < 2:113911/149‑1 (MQ=255) ccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAagga < 2:912628/149‑1 (MQ=255) ccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGGAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGAAAACAAAGTACAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAagga > 1:191244/1‑149 (MQ=255) ccgccAGGCGCGGCTGATACGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACGAAAAATACAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAagga < 2:715965/149‑1 (MQ=255) cgcgAGGCGCGGGTCATCGGGCCTACGGGTAGTTATATCCGGCTTTGGTGGAGGAGCGCTCCAAATCCAGGTTGAAAACAACATACACAAAAAATATAGAGCTCCGTCACAGTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAaggag < 2:983442/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAAGGAGGTa < 1:27310/149‑1 (MQ=255) gggttATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAAGGAGGTACTGCTAt < 2:377949/146‑1 (MQ=255) ggCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAAGGAGGTACTGCTAt < 2:329393/149‑1 (MQ=255) cTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATTCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGAGCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAAGGAGGTACTGCTATGa < 2:661767/149‑1 (MQ=255) tCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGACACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAAGGAGGTACTGCTATGACGTc > 1:334985/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAAGGAGGTACTGCTATGACGTCa > 2:56587/1‑149 (MQ=255) cGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAatat > 2:534297/1‑79 (MQ=255) cGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCg > 1:352760/1‑101 (MQ=255) cTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAAGGAGGTACTGCTATGACGTCActctc < 2:258989/149‑1 (MQ=255) cTACGGGTAGGTATATCCGACTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAAGGAGATACTGCTATGACGTCActctc > 2:514978/1‑149 (MQ=255) | AGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAAGGAGGTACTGCTATGACGTCACTCTC > NC_000913_3_hsa_pgi/4240070‑4240366 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |