| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_KO_pgi | 4383971 = | 114 (0.470) | 133 (0.540) | 95/282 | 3.6 | 53.8% | coding (145/315 nt) | yjeN | uncharacterized protein |
| ? | NC_000913_3_KO_pgi | = 4497945 | NA (NA) | intergenic (+11/+82) | insD1/yjgX | IS2 transposase TnpB/pseudogene fragment | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TTTCGCTATAGCGCATACGAAACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_KO_pgi/4384118‑4383971‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGC < NC_000913_3_KO_pgi/4497945‑4497797 TTTCGCTATAGCGCATACGAAACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGGGCTACCTG > 1:1430214/1‑150 TTCGCTATAGCGCATACGAAACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGG < 2:2116645/150‑1 TATAGCGCATACGAAACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTG > 4:1453669/1‑150 ATAGCGCATACGAAACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGC < 3:767407/150‑1 ATAGCGCATACGAAACAAATCGCCGGATCCCACTCATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCTACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGC < 1:1470692/150‑1 AGCGCATACGAAACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCC < 1:574069/150‑1 CGCATACGAAACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCT > 4:833411/1‑150 cCATACGAAACAAATCGCCGTATCCCACTAATCCCCCGCGAAAACCCAGACAGCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTCCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTA < 1:1214232/149‑1 CATACGAAACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTAT > 2:52197/1‑150 CATACGAAACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACAAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTAT > 4:149709/1‑150 GAAACAAATCGCCGTATCCCACTAATACCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATCTCCGGCAGGGTTCCCCACCGTTTACCATCGCGACCTTTCAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGACTTGCCCCTATACTTC > 4:665170/1‑150 AAACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCC < 2:1589619/150‑1 AAACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCC > 1:744863/1‑150 AACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCA < 4:644335/150‑1 ACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG > 2:1971109/1‑150 ACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCC > 2:2394390/1‑139 ACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCC < 1:2394390/139‑1 AAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC < 1:2221042/150‑1 GCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTG < 4:142631/150‑1 CCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGT < 3:4374/150‑1 CGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTT > 2:868210/1‑150 GTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTA < 1:2569314/150‑1 TATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTAT > 2:705371/1‑150 CCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT > 2:1887471/1‑150 CCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT > 2:2535212/1‑150 CACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTG < 1:169493/113‑1 CTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAA < 1:200976/150‑1 ATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCC > 1:433762/1‑150 CCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGCTAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTCCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA < 2:1562750/150‑1 GCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAA > 1:2024156/1‑150 GCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAA < 4:531360/150‑1 GCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAA < 2:1918557/150‑1 CGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG < 1:705371/150‑1 AAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACACATTACAAGCCC > 2:1723262/1‑150 AACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC > 4:123180/1‑150 AACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC > 1:323270/1‑150 ACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCT < 3:1430588/150‑1 GACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCG < 4:1026174/150‑1 ACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGC < 4:867473/150‑1 ATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAG > 2:2250750/1‑150 CGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGAT > 1:1494214/1‑150 GATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATAT > 1:662728/1‑150 TAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTC < 3:474939/150‑1 ATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGT < 1:1205456/150‑1 TAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTG < 1:652831/150‑1 CGCAATAAATATCCGGCATGTTTCCCCACCGTTTTCCATCGCTATCGTTTAGTTTTTGAAGGTTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGA < 3:149709/150‑1 CGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGA < 3:1217526/150‑1 CGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCAACGATAGTCCCGTGGCGA > 3:499178/1‑150 GCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGCGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATCTATGTTAGCATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAG > 1:2021763/1‑150 CAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGC > 4:1335153/1‑150 TAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGAT < 1:473622/150‑1 AAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGCTTTGCCCCT > 1:2501251/1‑77 AAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATA > 2:2513732/1‑150 AAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCT < 2:2501251/77‑1 TATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACC > 1:96801/1‑150 CCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAG < 2:1524019/150‑1 GGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCG > 1:503387/1‑150 GGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA > 1:1967133/1‑92 GTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA > 1:772332/1‑150 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3:965264/1‑150 TTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCG > 4:1214907/1‑150 TTAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTG < 4:831528/150‑1 TAATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGC < 2:323270/150‑1 AATGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA > 3:527153/1‑150 TGGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAG < 2:2149271/150‑1 GGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGG < 1:1036205/150‑1 GGTGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAATCTGCCGACATGCGTCGTGCTAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGG < 2:662728/150‑1 TGCTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTT < 3:1328139/150‑1 CTACCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCT > 2:1277650/1‑150 CCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG > 3:508697/1‑150 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACACGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGC > 4:192801/1‑150 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGC > 3:790811/1‑150 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGC > 3:16220/1‑150 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGC > 4:1640652/1‑150 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGC > 1:1679627/1‑150 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGC > 3:1545662/1‑150 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGC > 3:1498133/1‑150 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGC > 1:1094678/1‑150 TTTCGCTATAGCGCATACGAAACAAATCGCCGTATCCCACTAATTCCCCGCGAAAAACCAGACATCGGATAAGATAAGCGCAATAAATATCCGGCAGGTTTCCCCACCGTTTACCATCGCGATCTTTGAGGGTGTTAATGGTGCTACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_KO_pgi/4384118‑4383971‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGC < NC_000913_3_KO_pgi/4497945‑4497797 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |