| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 4093097 | 127 (1.890) | 8 (0.120) | 7/268 | 7.5 | 6.2% | intergenic (‑274/+27) | frvA/rhaM | putative enzyme IIA component of PTS/L‑rhamnose mutarotase |
| ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 4093109 | 120 (1.860) | intergenic (‑286/+15) | frvA/rhaM | putative enzyme IIA component of PTS/L‑rhamnose mutarotase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
TGCACATAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTAAAACACTTCTTGCAGCTCGCT‑ACTCACCGGGCTGTTATCCGGGTTAGCGGGCATAACATCGGTCATATATTTCCACCAACGTTGGCAAACATCAGTGCTGGCAACCGCAT > NC_000913_3_hsa_tpiA/4092948‑4093245 | tGCACATAATGGTTATTTAAATAAACAACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGcc < 2:797176/150‑1 (MQ=255) tcaaaTAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAAGCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCg < 2:143879/146‑1 (MQ=255) acaTAATGGTTATTTAAATAGACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGa < 1:802836/150‑1 (MQ=255) acaTAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGa > 1:779016/1‑150 (MQ=255) gTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCAtctc > 2:979975/1‑150 (MQ=255) gTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTAGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATCTTGTGCCGGAGGCAtctc > 1:1039014/1‑150 (MQ=255) ttATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATctct < 1:716786/150‑1 (MQ=255) tATTTAAATAAACCACATGAAACATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTg < 2:14079/150‑1 (MQ=255) aTTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTgg > 1:1078736/1‑150 (MQ=255) aTTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTgg < 1:930383/150‑1 (MQ=255) aTTTAAATAAACCACATGAATCACTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAAGATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTgg < 1:575349/150‑1 (MQ=255) tttAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGc < 1:388828/150‑1 (MQ=255) tttAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGc > 1:391419/1‑150 (MQ=255) aataaaCCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACAt < 1:108852/150‑1 (MQ=255) ataaaCCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACAtt < 2:1080199/150‑1 (MQ=255) ataaaCCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACAtt < 2:1078736/150‑1 (MQ=255) ataaaCCACACGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACAtt < 2:265529/150‑1 (MQ=255) aaaCCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTgg < 1:979975/150‑1 (MQ=255) ccACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATATATCCAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCa < 1:823373/150‑1 (MQ=255) caTGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAAtt > 2:1022004/1‑150 (MQ=255) caTGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAAtt > 1:891525/1‑150 (MQ=255) caTGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTCTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAAtt > 2:664952/1‑150 (MQ=255) tGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTAc < 1:1022004/150‑1 (MQ=255) aaTCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACgg > 1:429495/1‑150 (MQ=255) aTCATTAATGGGTTATTAAGTATTTTTGTGACTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGc < 2:332188/150‑1 (MQ=255) cATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAg < 1:849357/150‑1 (MQ=255) cATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAg < 1:946765/150‑1 (MQ=255) cATTAATGGGTTAGTTATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAg < 2:161219/150‑1 (MQ=255) aTTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAgg < 1:59914/150‑1 (MQ=255) aTTAATGGGTTATTCATTATTCTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAgg < 1:664952/150‑1 (MQ=255) ttAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGt < 1:274813/150‑1 (MQ=255) ttAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGt < 2:779016/150‑1 (MQ=255) aaTGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCATGTaa > 2:126525/1‑150 (MQ=255) tGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTaaaa < 1:306168/150‑1 (MQ=255) tGGGTTATTCAATATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATCTGCCCAACCTGAAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAAGATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTaaaa < 1:627546/150‑1 (MQ=255) tGGGTCCTTCACTATGTTTGTGATTAAAGAAGAAAGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTaaaa < 2:891525/150‑1 (MQ=255) gggTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTAAAac > 1:498863/1‑150 (MQ=255) ggTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACAtt < 1:615731/127‑1 (MQ=255) ggTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACAtt > 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1:1152742/150‑1 (MQ=255) ttAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTAAAACACTTCTTGCAGCTCGCT‑ACTCACCGGGCTGTTATCCGGGTTAGCGGGCATAACATCGGTCATATATTTccacc > 1:824119/1‑150 (MQ=255) aTTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTAAAACACTTCTTGCAGCTCGCT‑ACTCACCGGGCTGTTATCCGGGTTAGCGGGCATAACATCGGTCATATATTTCCACCAAc < 2:102668/150‑1 (MQ=255) tttGAAATCGAAATTGAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACAGTGGGCAATTACGGCAGGTAAAACACTTCTTGCAGCTCGCT‑ACTCACCGGGCTGTTATCCGGGTTAGCGGGCATAACATCGGTCATATATTTCCACCAACGtt < 2:37128/150‑1 (MQ=255) ttCAAATTGAAATTGAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTAAAACACTTAGTGCAGCTCGCT‑ACTCGCCGGGCTGTTATCCGGGTTAGCGGGCATAACATCGGTCATATATTTCCACCAACGTTg < 2:360807/150‑1 (MQ=255) ttCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCGGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTAAAACACTTCTTGCAGCTCGCT‑ACTCACCGGGCTGTTATCCGGGTTAGCGGGCATAACATCGGTCATATATTTCCACCAACGTTg < 2:974330/150‑1 (MQ=255) tCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGc > 1:551456/1‑51 (MQ=255) tCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGc < 2:551456/51‑1 (MQ=255) tCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTAAAACACTTCTTGCAGCTCGCT‑ACTCACCGGGCTGTTATCCGGGTTAGCGGGCATAACATCGGTCATATATTTCCACCAACGTTgg < 1:741357/150‑1 (MQ=255) gAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTAAAACACTTCTTGCAGCTCGCT‑ACTCACCGGGCTGTTATCCGGGTTAGCGGGCATAACATCGGTCATATATTTCCACCAACGTTGGCAAACAt > 1:1156156/1‑150 (MQ=255) tttAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTAAAACACTTCTTGCAGCTCGCT‑ACTCACCGGGCTGTTATCCTGTTTAGCGGGCATAACATCGGTCATATATTTCCACCAACGTTGGCAAACATCAGt < 2:493327/150‑1 (MQ=255) tAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTGAAACACCTCTTACAGCTCGCT‑ACTCACCGGGCTGTTATCCGGGTTAGCGGGCATAACATCGGTCATATATTGCCACCAACGTTGGCAAACATCAGtac > 1:1165515/1‑148 (MQ=255) aaaTATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTAAAACACTTCTTGCAGCTCGCT‑ACTCACCGGGCTGTTATCCGGGTTAGCGGGCATAACATCGGTCATATATTTCCACCAACGTTGGCAAACATCAGTGCTg < 2:804912/150‑1 (MQ=255) ccGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTAAAACACTTCTTGCAGCTCGCT‑ACTCACCGGGCTGTTATCCGGGTTAGCGGGCATAACATCGGTCATATATTTCCACCAACGTTGGCAAACATCAGTGCTGGCAACCGCAt < 2:745862/150‑1 (MQ=255) | TGCACATAATGGTTATTTAAATAAACCACATGAATCATTAATGGGTTATTCATTATTTTTGTGATTTACTCACAATGTATCAGGGAAATATAACTTACCGGGAGATGTAATATGTTTAATTTTTCAAATCGAAATTTAAAATATTGTGCCGGAGGCATCTCTGGCACATTGGGCAATTACGGCAGGTAAAACACTTCTTGCAGCTCGCT‑ACTCACCGGGCTGTTATCCGGGTTAGCGGGCATAACATCGGTCATATATTTCCACCAACGTTGGCAAACATCAGTGCTGGCAACCGCAT > NC_000913_3_hsa_tpiA/4092948‑4093245 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |