| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 2290113 | NA (NA) | 52 (1.470) | 33/280 | 0.2 | 98.1% | intergenic (‑32/+1) | insH1/yejO | IS5 transposase and trans‑activator/pseudogene, autotransporter outer membrane homology;putative transport; Not classified; putative ATP‑binding component of a transport system |
| ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 3654601 | 1 (0.030) | intergenic (+74/‑82) | slp/dctR | outer membrane lipoprotein/Putative LuxR family repressor for dicarboxylate transport | |||||
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_hsa_tpiA/2289966‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTGGTGTAGTAAGGCGCACCCCAGCCCGGTTCC < NC_000913_3_hsa_tpiA/3654601‑3654458 CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:376265/149‑1 GGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 2:215665/149‑1 GGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 2:576859/149‑1 GACCAGAAAGTCTCTTGTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTTATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACTTTCCTTAG < 1:346975/149‑1 GACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCTCCTTCCTTAG > 2:11906/1‑149 ACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGC < 2:409125/149‑1 ACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGC < 2:420011/149‑1 ACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGC < 1:33583/149‑1 cCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGT < 1:362640/148‑1 TCTTTTCTGATCTTACGGCGCTTACTGCTCAATTCACTTTCTGCGAATGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATTGCTCCACATGACAAACATGATCTCATATCAGGTACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTAT < 2:32349/149‑1 GGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGA < 1:589401/149‑1 ACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 2:564484/122‑1 ACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA > 1:564484/1‑122 GCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTAATTTGTTTTAATTTGATCTAATTCA > 2:621734/1‑149 GCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATG > 2:85363/1‑149 TTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGAT > 2:412590/1‑149 TTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGAT > 2:232962/1‑149 GAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGC > 2:508422/1‑149 aagTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCT < 2:154643/146‑1 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGGCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATTTCATATCAGGGAGTTGTTCGCTTCTTCCTGAGCTTACTGTGTATTAATTTGAGGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAA < 2:148421/149‑1 AAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCA > 2:507686/1‑149 AGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTC < 1:232962/149‑1 GATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCTGTG > 2:91985/1‑149 GATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTG > 2:389341/1‑149 TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTA > 1:46880/1‑149 TCATGATGAACCCTGTTCTAGGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTA > 2:232192/1‑149 TGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTT < 1:242795/149‑1 AACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGTCCA > 1:204581/1‑149 CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTG < 2:240376/132‑1 CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTG > 1:240376/1‑132 CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATCCATGATTCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCT > 1:430357/1‑149 ATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTT < 1:85363/149‑1 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTA < 1:507686/149‑1 GGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTAC < 1:508422/149‑1 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGA < 1:313020/149‑1 AGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACT < 1:522144/149‑1 ATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCCAGTGATACCTGACTCA > 2:432921/1‑149 CATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTG < 1:257010/149‑1 CATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTG < 1:412590/149‑1 TGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTGGT < 1:363349/149‑1 GATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGGGCATAAATTTGATCTCAGGCAATATTCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTGGTG < 1:240960/149‑1 ATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTGGTGa > 1:431496/1‑148 TCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTGGTGTAGT > 2:305966/1‑149 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTGGTGTAGTAA > 2:297991/1‑149 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTG < 1:10323/140‑1 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTG > 2:10323/1‑140 ATATCAACGACTTGTTCGCACCTCCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTGGTGTAGTAA > 2:573273/1‑149 TATCAGGGACTTGTTCGAACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTGGTGTAGTAAG < 2:564838/149‑1 GCACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCCTTGGTGTAGTAAGGCGCACCCCAGCCCGG > 2:244335/1‑149 ACCTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTGGTGTAGTAAGGCGCACCCCAGCCCGGTT > 1:197074/1‑149 CTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTGGTGTAGTAAGGCGCACCCCAGCCCGGTTCC > 2:35709/1‑149 CTTCCTTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTGGGGTAGTAAGGCGCACCCCAACCCGGTTCC > 2:344899/1‑149 CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_hsa_tpiA/2289966‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGCTTACTGTGTATTAATTTGATGTAATGCATGATGCAGATGCTGAGAAAGCATCTGCATCTTTCGGTGGTGTTATTTGACCAGCTCAGGTGTTACCTGACTCACCGCATTGGTGTAGTAAGGCGCACCCCAGCCCGGTTCC < NC_000913_3_hsa_tpiA/3654601‑3654458 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |