New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 3121594 = | 78 (1.380) | 3 (0.060) | 3/264 | NT | 3.9% | intergenic (‑315/+40) | glcA/glcB | glycolate transporter/malate synthase G |
? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 3121622 = | 73 (1.360) | intergenic (‑343/+12) | glcA/glcB | glycolate transporter/malate synthase G | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGCAC > NC_000913_3_hsa_tpiA/3121445‑3121743 | cgatggcggggaatttcgctaactcgtgtgcttttaaagctgccagcgatttcatcttcctcggcgtgaaacagccaaacggctataccgaaccgttattacncgcctggcgttcacgcgaaaaagaaagtcattaatagcgtcaaaaaa > 3:166590‑M1/150‑150 (MQ=255) cgatggcggggaatttcgctaactcgtgtgcttttaaagctgccagcgatttaatcttcctcggcgtgaaacagccaaacggctataccgaaccgttattacacgcctggcgtttacgcgaaaaagaaagtcattaatagcgtcaaaaaa > 1:128888‑M1/150‑150 (MQ=255) cgatggcggggaatttcgctaactcgtgtgcttttaaagctgccagcgatttaatcttcctcggcgtgaaacagccaaacggctataccgaaccgttattacacgcctggcgtttacgcgaaaaagaaagtcattaatagcgtcaaaaaa < 4:334004‑M1/1‑1 (MQ=255) gcagacgcagaGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACa < 3:151749/150‑1 (MQ=255) gcagacgcagaGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACa > 3:246705/1‑150 (MQ=255) gcagacgcagaGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACa < 4:238145/150‑1 (MQ=255) acgcaggGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGAtaataa < 4:119271/150‑1 (MQ=255) acgcagaGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATaa > 4:91472/1‑150 (MQ=255) acgcagaGGATCGTTAAGATGTCCAGATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATaa > 4:91488/1‑150 (MQ=255) gcagaGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATaaaa > 4:375461/1‑150 (MQ=255) gcagaGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATaaaa > 1:153547/1‑150 (MQ=255) gcagaGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATaaaa < 1:136584/150‑1 (MQ=255) agTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTNCCGCAGTTACTATCATAGCCACGACAATAAAACTTg > 4:159236/1‑150 (MQ=255) 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gCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCttttt < 1:11670/150‑1 (MQ=255) gCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCttttt < 3:65074/150‑1 (MQ=255) cTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTc > 1:437626/1‑150 (MQ=255) aGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTcgc < 3:217793/150‑1 (MQ=255) aGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTcgc < 1:153090/150‑1 (MQ=255) 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tatTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAAc > 3:309917/1‑150 (MQ=255) tatTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCACCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAAc > 3:138677/1‑150 (MQ=255) atTGTTAAACCCTGAGAATCGCTGCGGTTATTTCCGGGATAAATGTGCTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACg < 1:299924/150‑1 (MQ=255) ttAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTc > 2:283568/1‑150 (MQ=255) ttAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTATTAACGCTATTAATGCCTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCATGCGTGTAATAACGGTTc > 3:107406/1‑150 (MQ=255) 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cGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTgg > 3:312095/1‑150 (MQ=255) cGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTgg < 3:349286/150‑1 (MQ=255) cGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTgg < 3:117995/150‑1 (MQ=255) aCTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCTCGTAAACGCCATGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGTGGAGGGTTAATTCGCGGGCAGCttt > 4:129846/1‑150 (MQ=255) tATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGTTGTTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTTGCTGTTTCACGCCGAGGGAGATTAAATCGCTGGCCGCTTTaa > 4:245246/1‑150 (MQ=255) tATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGACGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTaa > 1:362896/1‑150 (MQ=255) aTCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTaaa < 3:91488/150‑1 (MQ=255) aTCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTaaa < 3:91472/150‑1 (MQ=255) tAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGACTTTCTTTTTCGCGTAAACTCCAGGAGTGTAATAACGAGTCGGTATAGCCGTTTTGCTGTTTCACGCCGCCGCAGATTAAATCGCTGGCCGCTTTAAAAGca > 4:371062/1‑150 (MQ=255) tAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGca < 3:181121/150‑1 (MQ=255) AGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGcac < 1:538892‑M1/150‑1 (MQ=255) | TCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGCAC > NC_000913_3_hsa_tpiA/3121445‑3121743 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |