New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 3121594 = | 78 (1.380) | 3 (0.060) | 3/264 | NT | 3.9% | intergenic (‑315/+40) | glcA/glcB | glycolate transporter/malate synthase G |
? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 3121622 = | 73 (1.360) | intergenic (‑343/+12) | glcA/glcB | glycolate transporter/malate synthase G | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGCACACGAGTTAGCGAAATTCCCCGCCATCG > NC_000913_3_hsa_tpiA/3121475‑3121770 | gATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCtttt > 2:320988/1‑150 (MQ=255) ttttaaagctgccagcgatttaatcttcctcggcgtgaaacagccaaacggctataccgaaccgttattacacgcctggcgtttacgcgaaaaagaaagtcattaatagcgtcaaaaaAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCttttt < 1:518581‑M1/32‑1 (MQ=255) gTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTg > 3:242597/1‑150 (MQ=255) ccATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGAc > 1:520733/1‑150 (MQ=255) cATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAAGGTACTACCGCTGGTACGATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACg > 3:73316/1‑150 (MQ=255) ttgttTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTaa > 2:343880/1‑150 (MQ=255) agcgatttaatcttcctcggcgtgaaacagccaaacggctatagcgaaccgttattacacgcctggcgtttacgcgaaaaagaaagtcattaatagcgtcaaaaaAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAAt > 4:359947‑M1/106‑150 (MQ=255) cccGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGActttctt > 1:107189/1‑150 (MQ=255) cccGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGActttctt > 4:58904/1‑150 (MQ=255) cccGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGActttctt > 4:251964/1‑150 (MQ=255) cccGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGActttctt > 2:573785/1‑150 (MQ=255) cccGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGActttctt > 2:158731/1‑150 (MQ=255) ccGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAACAAAACTTCCCGGGGCTTTTTTGACGCCATTAATGActttcttt > 2:156146/1‑150 (MQ=255) cGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCtttt < 3:41924/150‑1 (MQ=255) gCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCttttt < 1:11670/150‑1 (MQ=255) gCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCttttt < 3:65074/150‑1 (MQ=255) cTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTc > 1:437626/1‑150 (MQ=255) aGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTcgc < 3:217793/150‑1 (MQ=255) aGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTcgc < 4:130618/150‑1 (MQ=255) aGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTcgc < 1:153090/150‑1 (MQ=255) aGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAACAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTcgc < 4:169755/150‑1 (MQ=255) tAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGt > 3:380277/1‑150 (MQ=255) gcTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGc < 1:518016/150‑1 (MQ=255) tACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCa < 4:18816/150‑1 (MQ=255) tACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCa > 1:13762/1‑150 (MQ=255) tACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCa > 1:291484/1‑150 (MQ=255) aCGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAg > 4:343248/1‑150 (MQ=255) gggTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGc > 2:91830/1‑150 (MQ=255) tATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCgtg < 1:589660/150‑1 (MQ=255) tATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCgtg < 2:491618/150‑1 (MQ=255) tttAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGta < 2:435995/150‑1 (MQ=255) tttAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGta > 2:296290/1‑150 (MQ=255) aaTATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGtaata > 4:372048/1‑150 (MQ=255) atatTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGtaataa > 3:334004/1‑150 (MQ=255) tatTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAAc > 3:309917/1‑150 (MQ=255) tatTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCACCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAAc > 3:138677/1‑150 (MQ=255) atTGTTAAACCCTGAGAATCGCTGCGGTTATTTCCGGGATAAATGTGCTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACg < 1:299924/150‑1 (MQ=255) taccgaaccgttattacacgcctggcgtttacgcgaaaaagaaagtcattaatagcgtcaaaaaagccccggcaagatttattgtcggggctTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGt > 2:518581‑M2/93‑150 (MQ=255) 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ccTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTACTAACGGTTCGGtata > 2:297523/1‑150 (MQ=255) ccTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGtata > 1:211403/1‑150 (MQ=255) ccTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGtata > 3:353678/1‑150 (MQ=255) ccTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGtata > 1:328616/1‑150 (MQ=255) tAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCGCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGt > 1:340189/1‑150 (MQ=255) 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CCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTATACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCCGGCAGCTTTAAAAGCACACg < 2:481040‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGCACACGa > 2:275636‑M1/1‑150 (MQ=255) CGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGCACACGAg < 3:387172‑M1/150‑1 (MQ=255) CGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGACGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGCATATTCAATCGCTGGCAGCTTTACAAGCACACGAg < 2:37017‑M1/150‑1 (MQ=255) aaTAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTGAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGCACACGAGTTAg < 2:361680/150‑1 (MQ=255) tAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGCACACGAGTTAGCg > 1:571221/1‑150 (MQ=255) aaaCTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGTGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGCACACGAGTTAGCGaa < 1:573436/150‑1 (MQ=255) tGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGCACACGAGTTAGCGAAATTcc < 1:343880/150‑1 (MQ=255) tGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGCACACGAGTTAGCGAAATTcc < 3:37662/150‑1 (MQ=255) ccGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGCACACGAGTTAGCGAAATTcccc > 2:204022/1‑150 (MQ=255) tTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTGAACGCCAGGCGNGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATGAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGCACACGAGTTAGCGAAATTCCCCGCCATCg > 3:166590‑M2/2‑150 (MQ=255) tTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGCACACGAGTTAGCGAAATTCCCCGCCATCg < 4:334004‑M2/149‑1 (MQ=255) tTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGCACACGAGTTAGCGAAATTCCCCGCCATCg > 1:128888‑M2/2‑150 (MQ=255) | GATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAATGTACTACCGCAGTTACTATCATAGCCCCGACAATAAAACTTGCCGGGGCTTTTTTGACGCTATTAATGACTTTCTTTTTCGCGTAAACGCCAGGCGTGTAATAACGGTTCGGTATAGCCGTTTGGCTGTTTCACGCCGAGGAAGATTAAATCGCTGGCAGCTTTAAAAGCACACGAGTTAGCGAAATTCCCCGCCATCG > NC_000913_3_hsa_tpiA/3121475‑3121770 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |