| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_tpiA | 2071331 = | 75 (1.550) | 4 (0.090) | 4/270 | 6.7 | 5.3% | noncoding (15/195 nt) | isrC | novel sRNA, CP4‑44; putative prophage remnant |
| ? | NC_000913_3_pae_tpiA | 2071358 = | 73 (1.620) | noncoding (42/195 nt) | isrC | novel sRNA, CP4‑44; putative prophage remnant | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTAC > NC_000913_3_pae_tpiA/2071210‑2071501 | gAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAg > 1:230009/1‑149 (MQ=255) agccgttCGTGATTGATGCCGTTTCAGGCTCTGAATCTGCTAACTAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGTAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATTAATATTTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGc < 2:135138/143‑1 (MQ=255) aaCCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACGAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGc > 1:127204/1‑149 (MQ=255) aaCCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGCCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGTATAAACGGATCAATTACTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGc > 2:201331/1‑149 (MQ=255) gACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAAc > 1:822653/1‑149 (MQ=255) gACCGATGCCCTCCCTTACTCTGAGTCTGCTCACACAAGAACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAAc < 2:12851/149‑1 (MQ=255) cTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCt > 1:496653/1‑149 (MQ=255) tgctGCCCTCCCTGGCACTAAGTCTTCGCACAAAAGCACTTTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCtt > 2:716181/4‑149 (MQ=255) gATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCttt < 1:625075/149‑1 (MQ=255) gATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCAATATGCTCATAATAACCttt > 1:232500/1‑149 (MQ=255) gATGCCCCCACTGACACGGAGTCTGCTCAAAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTGTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCttt < 2:777568/149‑1 (MQ=255) tGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGt < 1:648980/149‑1 (MQ=255) ccctccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCa < 1:816727/149‑1 (MQ=255) ctccctGACTCTGAGTCTGCTCACACAAGCACTTGGTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGt > 2:823105/1‑149 (MQ=255) tccctGAATCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATAGTCCGTAAGGGTAATTATAACCTTTGTCAGTa > 2:389530/1‑149 (MQ=255) cctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAAc > 2:33771/1‑149 (MQ=255) ctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCtaat > 2:181111/1‑129 (MQ=255) ctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCtaat < 1:181111/129‑1 (MQ=255) tGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACAt < 1:474721/149‑1 (MQ=255) cgtggAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTCTTCGTTGCTGTCGCGCTTGTCCGTGAAATAGCTCAATAATAGAATAAACCGATCACTCACTATATTATCGATCGTTTATATCGCTGGGCAGGTTAATAATAACCATCGTCAGTAATATGca < 2:630333/145‑1 (MQ=255) gTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATa < 2:756515/149‑1 (MQ=255) tCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATAc < 1:40473/149‑1 (MQ=255) tCTGCTCAAAAAAGCAATGGTTTCCTTTCTGATCCTCTAAGCCGTGCAATAGCACAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATAc < 1:230373/149‑1 (MQ=255) gCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTTTCTCGACCGGGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTa > 1:203427/1‑149 (MQ=255) gCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAGTTATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTa < 2:822653/149‑1 (MQ=255) atCAAAAAGGCACTCTGTTCGTTAATGTCTTTGTTGGGCGTGCAATAGCTCAATAATAGAAGAAATCGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCCTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTAc < 2:236694/148‑1 (MQ=255) acaAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCACTAGCGCAATAATAGAATAAGACGATCAAGATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAAACTTTTGCCGTAACCAGCACAGATGCGTACAGa > 2:382924/1‑149 (MQ=255) acaAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGACTACAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACTTACAGa > 2:775679/1‑149 (MQ=255) aaaaGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGaaa < 1:141217/149‑1 (MQ=255) aaGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTCTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGa < 1:813524/149‑1 (MQ=255) aaGCACCGTTTTCGTCAGTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGa < 2:188402/149‑1 (MQ=255) gCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACa < 2:258860/149‑1 (MQ=255) tGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCa > 1:819677/1‑149 (MQ=255) tGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCa > 1:730549/1‑149 (MQ=255) gTTTTCGCTACTGTCTCTCTTGTCCGTGTAATAGCTCAATAATAGAATAAAGCGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAg < 2:447462/149‑1 (MQ=255) ttttCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTc < 2:465211/146‑1 (MQ=255) ttttCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTc > 1:465211/1‑146 (MQ=255) ttACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGaacaa < 1:823105/149‑1 (MQ=255) tACTATCTCTGTTAGTCGTGCAATATCTCACTTATCGAATCACTCGAGTCCTATCTACTTTATCGATCGTTTATATCGCTCGATACGCGAATAATACCCTTTTTCAGTTACATGCGTAGATACGTATATAAAGACATTCAGGTaacaac < 2:281990/149‑1 (MQ=255) tctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGt > 1:287551/1‑97 (MQ=255) tctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGt < 2:287551/97‑1 (MQ=255) tctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACca < 2:127204/149‑1 (MQ=255) tctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACcaca > 1:722734/1‑149 (MQ=255) ctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACaa < 2:230009/149‑1 (MQ=255) gTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTc > 1:742939/1‑149 (MQ=255) gccGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCa < 2:192631/148‑1 (MQ=255) tGCAATAGCTCAATAATAGAATCCACCGCTCAAGGTCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTCATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAAAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAaaa‑a > 2:397827/1‑149 (MQ=255) cAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAAAA‑ACt > 2:766314/1‑149 (MQ=255) attgCTCAATTATAGACAAAAGCGATGAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATTCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTcc < 2:498290/146‑1 (MQ=255) cTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCAATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAAACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAACACCCCcac > 2:404238/1‑149 (MQ=255) aaTAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACGAAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTcc > 2:469657/1‑149 (MQ=255) aaTAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTcc > 2:720094/1‑149 (MQ=255) aaTAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAAAAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCCGAACTcc > 2:559889/1‑149 (MQ=255) aTAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCg > 1:25136/1‑149 (MQ=255) cccaTCAATATCTATTTTATCGATCGATTATATCTATCGATGAGCTCAGGACGACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACt < 1:406600/146‑1 (MQ=255) aCGATCAATATCGATTTTATCGACCGTTTATATCGAACGATAAGCTAATAATAACCTTTGTAAGTAAAATGCACCGATACGTACAGAAAGAAATTCAGGAAAAGAAAGAACCACAGTGCAGAA‑ACTCCAACAGCCGGCCCTCCggagcg > 2:705944/1‑145 (MQ=255) aCGAGCAATATCTATTTTATAGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACt < 2:458880/149‑1 (MQ=255) aaTATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACca > 2:472079/1‑107 (MQ=255) aaTATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACca < 1:472079/107‑1 (MQ=255) cTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑GCTCCCGCAGCGGGACTTGCGGCACTGTAGCCCTGTa < 2:203427/149‑1 (MQ=255) cTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTa > 1:847880/1‑149 (MQ=255) cTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTa < 2:731541/149‑1 (MQ=255) ttttATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCt > 1:63369/1‑149 (MQ=255) ttATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACGACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCTCAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGc < 2:742939/149‑1 (MQ=255) atcgatcgTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCa < 1:805220/129‑1 (MQ=255) atcgatcgTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCa > 2:805220/1‑129 (MQ=255) ccgattgTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTGGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCgg < 2:563671/148‑1 (MQ=255) gatcgTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTa < 1:33771/149‑1 (MQ=255) tcgTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCCCTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATc > 1:804549/1‑149 (MQ=255) gTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTAAAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACACACACAGCCGGACCTCCTGCCCTGTAACCCTTTACCTGCCGGTAcccc > 2:669303/1‑148 (MQ=255) tttATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCGTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGGAACCCTTTACCTGCCCGTATCCAc > 2:504124/1‑149 (MQ=255) tagatcgagcgATGAGATAATAATAACCGTTGTCAGTAACTGGCATAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCACGt < 2:347311/146‑1 (MQ=255) tcgatcgaTAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCTGGTACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCACGTTtgt < 1:716181/149‑1 (MQ=255) gatcgatAAGCTAATAATAACATTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCGCAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCACGTTTGTgg < 1:556306/149‑1 (MQ=255) gatcgatAAGCTAATAATAACATTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTCTAACCAACTACCTGCCGGTAACCCCGTTTATgg > 2:174013/1‑149 (MQ=255) ttcgatAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCATAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCACGTTTCTggg > 2:787385/2‑149 (MQ=255) gatAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTAc > 1:483935/1‑149 (MQ=255) aGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCa > 1:407967/1‑55 (MQ=255) aGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCa < 2:407967/55‑1 (MQ=255) | GAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAA‑ACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCACGTTTGTGGGTAC > NC_000913_3_pae_tpiA/2071210‑2071501 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |