| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_tpiA | = 1468681 | NA (NA) | 10 (0.490) +ACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGG |
3/202 | 3.0 | 33.2% | coding (146/906 nt) | insD1 | IS2 transposase TnpB |
| ? | NC_000913_3_pae_tpiA | 1650843 = | 29 (0.980) | intergenic (+1/‑2) | ydfE/insD1 | Qin prophage; pseudogene;Phage or Prophage Related/IS2 transposase TnpB;IS, phage, Tn; Transposon‑related functions; extrachromosomal; transposon related | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
TGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_pae_tpiA/1468657‑1468681‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGGCACATACAGGCA > NC_000913_3_pae_tpiA/1650843‑1650986 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGTATACGGAGAAGCACATCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCA > 1:470852/1‑95TGTATACGGAGAAGCACATCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCA < 2:470852/95‑1 ttTCCGTATACTCCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGC < 2:405222/147‑1 tATCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTGGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCGGTTGC < 2:351581/148‑1 TCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGACAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGGCAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGGTCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTT > 1:195798/1‑149 TCCGTAAACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTAGGGTTATCGTCGGGTATGTGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTT < 2:287065/149‑1 CGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTAGCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGA > 2:88998/1‑149 CGTATACACCATGATATCGGAGAGCTGCGAACGTATGGTTACCGTCGGGTATTGGCGCTGCCTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTAGTTCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGA < 2:43437/149‑1 GTATGCAGCATGTTAGCGGAGAGCTGCCAACGTAGGGGTATGGGCGGGTATGGGCGCTGGTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAG < 2:479872/149‑1 tacACACCATGTTATCGGAGAGCTTCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGC < 1:480057/146‑1 TATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGCCAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGGTCAATGCCGAACGTCTTTAACGGATCATGTGAAAGAATGCGCTGTTGCTTTAGC > 1:187378/1‑149 ACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGtatg > 1:197970/1‑145 ACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAA > 1:225761/1‑149 ACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTCCTTGAGCGAAAA > 1:73028/1‑149 CATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACC > 1:43833/1‑149 CATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCGTCGCAGACAGGCAGAAATTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTCCCGGATCATGCGCCCAAATTCCCTGGTGCTTGAGCGAAcaac > 2:490765/1‑145 ATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCT > 1:140565/1‑149 TGTTATCGGAGAGCTGCCAAGGTATGGTGATGGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCATAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTG < 2:107201/149‑1 TGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTG < 2:284888/149‑1 TGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCAAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTG < 1:493654/149‑1 TGTTAGCGGAGGGGTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTG < 2:50297/149‑1 atgcgCGGAGAGCTGACAACTGAGGGTTAGCGGCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTGTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGC < 2:286186/144‑1 GTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGC < 2:466714/149‑1 GTTATCGAAAAGCTACCAACGTATGGTTATCGTCGGGTAGGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCCATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGC < 2:435127/149‑1 tTCGGAGAGCTGCCAACGTATCGCTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGT < 2:500299/148‑1 TCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGAGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGAGTTTACCGGATCATCGGCCAGAATGCGCTGTTGCTTAACCGAAACACTGCTGTt > 2:522477/1‑148 CGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCTACTGCGGGGGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTAC > 2:113133/1‑149 GGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACC > 1:73539/1‑149 GGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACC > 2:199387/1‑149 GAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCG > 1:466256/1‑149 GAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCC < 1:407351/149‑1 GCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCAT < 2:225761/149‑1 CTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATC < 1:507129/149‑1 GCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGGCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGGGCGAACACCTGCTTTACCGCCATCGA > 1:112160/1‑149 CAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGACAACCTGCTGTACCGCCATCGAAA > 2:312635/1‑149 CAACGGATGGTTATCGTCGGGTAGTGGTGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAA < 2:412626/149‑1 AACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAAC > 1:370070/1‑149 ccTATGGTTATCGGCGGGTATGGGCGCTGCTTCGAAGACATGCAGAACTTGATTGTATGCCTGCAATCACTGCCAAACTTGTTCACCGGATCATGCGCCAGATTGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGG < 2:235414/147‑1 acTATGCTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGTTATGCCTGCGATCAATGCCAAAGGTGTTTACCGGACCATGCGGCAGAATGCGCTGTTGCGCGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGG < 2:243201/147‑1 CGTATGGTTATCGTCCGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGG < 1:210300/149‑1 GTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGAGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGG > 1:1957/1‑149 tagGGTTATCGGCGGGTAGGGGCGCGGCTGCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTCTACCGGATCCTGCGCCAGAATGCGCTGTGGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGGC < 2:200387/146‑1 gATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGGC < 2:135977/148‑1 TATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGTAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGGC < 1:349150/149‑1 TATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATTCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCGGAATGCGATGTTGATTGAGCGAGAACCTGCTGTTCCCCCATCGCAACGGGC > 2:117855/1‑149 TATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGGC > 1:303961/1‑149 TATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGC < 1:493166/128‑1 TATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGC > 2:493166/1‑128 TGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGCAACGGGCcc > 2:259007/1‑147 GGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGGCACA > 1:426905/1‑149 TTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTAGCAGACAGGCAGAATTAGCTGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCATAATGCGCCGTTGCTTGAGCGTAACCCTGCTCTACCGCCATCGAAACGGGCACATA < 2:413795/149‑1 TCGGCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGGCACATACAG < 2:119450/149‑1 CGTCGGGTAGGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGGCACATACAGG < 1:155636/149‑1 GTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGGCACATACAGGC > 1:362491/1‑149 gCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAACCGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGGCACATACAGGCA < 2:121163/148‑1 gCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATAAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGGCACATACAGGCA < 2:587/148‑1 TCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGGCACATACAGGCA > 1:26092/1‑149 GGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACC > 2:40334/1‑120 GGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACC < 1:40334/120‑1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_pae_tpiA/1468657‑1468681‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGGCACATACAGGCA > NC_000913_3_pae_tpiA/1650843‑1650986 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |